A conceptual model emphasizing dire

A conceptual model emphasizing direct host-microbe interactions has dominated work on host-associated microbiomes. To understand plant-microbiome associations, however, broader influences on microbiome composition and functioning must be incorporated, such as those arising from plant-plant and microbe-microbe interactions. We sampled soil microbiomes associated with target plant species (Andropogon gerardii, Schizachyrium scoparium, Lespedeza capitata, Lupinus perennis) grown in communities varying in plant richness (1-, 4-, 8- or 16-species). We assessed Streptomyces antagonistic activity and analysed bacterial and Streptomyces populations via 454 pyrosequencing. Host plant species and plant richness treatments altered networks of coassociation among bacterial taxa, suggesting the potential for host plant effects on the soil microbiome to include changes in microbial interaction dynamics and, consequently, co-evolution. Taxa that were coassociated in the rhizosphere of a given host plant species often showed consistent correlations between operational taxonomic unit (OTU) relative abundance and Streptomyces antagonistic activity, in the rhizosphere of that host. However, in the rhizosphere of a different host plant species, the same OTUs showed no consistency, or a different pattern of responsiveness to such biotic habitat characteristics. The diversity and richness of bacterial and Streptomyces communities exhibited distinct relationships with biotic and abiotic soil characteristics. The rhizosphere soil microbiome is influenced by a complex and nested array of factors at varying spatial scales, including plant community, plant host, soil edaphics and microbial taxon and community characteristics.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แบบจำลองแนวคิดที่เน้นการโฮสต์โดยตรงจุลชีพได้ครอบงำการทำงานบนโฮสต์ที่เกี่ยวข้อง microbiomes เข้าใจความสัมพันธ์ของพืช-microbiome อย่างไรก็ตาม อิทธิพลกว้างขึ้น microbiome องค์ประกอบและการทำงานต้องรวมอยู่ เช่นที่เกิดขึ้นจากปฏิสัมพันธ์ของพืชพืชและจุลชีพจุลชีพ เราเก็บตัวอย่างดิน microbiomes ที่เกี่ยวข้องกับเป้าหมายชนิดพืช (Andropogon gerardii, Schizachyrium scoparium, Lespedeza capitata, Lupinus perennis) ปลูกในชุมชนแตกต่างกันในพืชความเข้มข้น (1, 4, 8 - หรือสาย พันธุ์ที่ 16) ประเมินกิจกรรมเป็นปรปักษ์ Streptomyces และวิเคราะห์แบคทีเรีย และประชากร Streptomyces ผ่าน 454 pyrosequencing โฮสต์พืชสายพันธุ์และพืชความร่ำรวยการรักษาเปลี่ยนแปลงเครือข่าย coassociation ระหว่างแบคทีเรียเหลือง แนะนำมีศักยภาพสำหรับโฮสต์พืชผล microbiome ดินเพื่อรวมการเปลี่ยนแปลงใน dynamics จุลินทรีย์การโต้ตอบและ จึง วิวัฒนาการร่วม ถูก coassociated ในไรโซสเฟียร์ของโฮสต์กำหนดพืชสายพันธุ์มักพบความสัมพันธ์สอดคล้องกันระหว่างความอุดมสมบูรณ์ในการดำเนินงานหน่วยอนุกรมวิธาน (OTU) ญาติและกิจกรรมปรปักษ์ Streptomyces ในไรโซสเฟียร์ของโฮสต์นั้น อย่างไรก็ตาม ในไรโซสเฟียร์ของโฮสต์อื่นพืช OTUs เดียวกันแสดงให้เห็นว่าไม่สอดคล้อง หรือรูปแบบที่แตกต่างกันของการตอบสนองดังกล่าวลักษณะกำเนิดสิ่งมีชีวิตอาศัย ความหลากหลายและความเข้มข้นของแบคทีเรียและชุมชน Streptomyces แสดงระดับความสัมพันธ์กับลักษณะดินไบโอติก และ abiotic ไรโซสเฟียร์ microbiome ดินเป็นผลมาจากปัจจัยที่แตกต่างกันเครื่องชั่งเชิงพื้นที่ ชุมชนโรงงาน โรงงานโฮสต์ edaphics ดิน และจุลินทรีย์มัน และลักษณะชุมชนหลากหลายซับซ้อน และซ้อนกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รูปแบบความคิดที่เน้นการปฏิสัมพันธ์โฮสต์จุลินทรีย์โดยตรงได้ครอบงำการทำงานใน microbiomes โฮสต์ที่เกี่ยวข้อง เพื่อให้เข้าใจถึงสมาคมพืช microbiome แต่อิทธิพลที่กว้างขึ้นอยู่กับองค์ประกอบ microbiome และการทำงานจะต้องรวมเช่นที่เกิดขึ้นจากพืชพืชและการมีปฏิสัมพันธ์จุลินทรีย์จุลินทรีย์ เราเก็บตัวอย่างดิน microbiomes เกี่ยวข้องกับพันธุ์พืชเป้าหมาย (Andropogon gerardii, Schizachyrium scoparium, Lespedeza capitata, Lupinus perennis) ที่ปลูกในชุมชนที่แตกต่างกันในความอุดมสมบูรณ์ของพืช (1, 4-, 8- หรือ 16 ชนิด) เราประเมิน Streptomyces กิจกรรมปฏิปักษ์และวิเคราะห์เชื้อแบคทีเรียและเชื้อ Streptomyces ประชากรผ่าน 454 pyrosequencing สายพันธุ์พืชและการรักษาความอุดมสมบูรณ์ของพืชเปลี่ยนแปลงเครือข่ายของ coassociation หมู่แท็กซ่าแบคทีเรียแนะนำที่มีศักยภาพสำหรับผลกระทบพืชใน microbiome ดินเพื่อรวมถึงการเปลี่ยนแปลงในการเปลี่ยนแปลงการทำงานร่วมกันของจุลินทรีย์และดังนั้นวิวัฒนาการร่วม แท็กซ่าที่ถูก coassociated บริเวณรากพืชที่กำหนดสายพันธุ์ที่มักจะแสดงให้เห็นความสัมพันธ์ที่สอดคล้องกันระหว่างหน่วยงานที่จัดหมวดหมู่ (OTU) ญาติอุดมสมบูรณ์และความ Streptomyces กิจกรรมปฏิปักษ์ในบริเวณรากเจ้าภาพว่า อย่างไรก็ตามในบริเวณรากของสายพันธุ์พืชที่แตกต่างกันที่ Otus เดียวกันแสดงให้เห็นความสอดคล้องไม่มีหรือรูปแบบที่แตกต่างกันของการตอบสนองลักษณะที่อยู่อาศัยของสิ่งมีชีวิตดังกล่าว ความหลากหลายและความอุดมสมบูรณ์ของเชื้อแบคทีเรียและเชื้อ Streptomyces ชุมชนแสดงความสัมพันธ์ที่แตกต่างกันที่มีลักษณะของดินที่มีชีวิตและ Abiotic บริเวณราก microbiome ดินได้รับอิทธิพลจากอาร์เรย์ที่ซับซ้อนและซ้อนกันของปัจจัยที่แตกต่างกันเครื่องชั่งเชิงพื้นที่รวมทั้งชุมชนพืชโฮสต์พืช edaphics ดินและแท็กซอนจุลินทรีย์และลักษณะชุมชน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แนวคิดที่เน้นปฏิสัมพันธ์โฮสต์โดยตรง จุลินทรีย์มี dominated ทำงานบนโฮสต์ที่เกี่ยวข้อง microbiomes . เข้าใจสมาคม ไมโครไบโ โรงงาน แต่ถูกอิทธิพลขององค์ประกอบไมโครไบโ และการทํางานจะต้องรวมอยู่ เช่น ผู้ที่เกิดจากพืชจุลินทรีย์จุลินทรีย์และการโต้ตอบ เราเก็บตัว microbiomes ดินเกี่ยวข้องกับชนิดพืชเป้าหมาย ( andropogon gerardii schizachyrium scoparium capitata lespedeza , , , กูปรี เพเรนนิส ) ที่ปลูกในชุมชนที่แตกต่างกันในความอุดมสมบูรณ์ของพืช ( 1 , 4 , 8 หรือ 16 ชนิด ) เราประเมินกิจกรรมและประชากรแบคทีเรียปฏิปักษ์ในแหล่งข้อมูล และ Streptomyces ผ่าน 454 ไพโรซีเควนซิง . โฮสต์ชนิดพืชและการรักษาความอุดมสมบูรณ์ของพืชเปลี่ยนแปลงเครือข่าย coassociation ระหว่างแบคทีเรียและแสดงให้เห็นศักยภาพสำหรับโฮสต์ของพืชต่อไมโครไบโดินเพื่อรวมการเปลี่ยนแปลงในการปฏิสัมพันธ์พลวัตและ , จึง , Co วิวัฒนาการ และที่ coassociated ในรากของพืชให้โฮสต์มักจะมีความสัมพันธ์ที่สอดคล้องกันระหว่างหน่วยปฏิบัติการอนุกรมวิธาน ( otu ) ความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์และ Streptomyces ปฏิปักษ์ กิจกรรม ในรากของโฮสต์ที่ อย่างไรก็ตาม ในรากของพืชชนิดต่าง ๆในโฮสต์เดียวกัน มีความสอดคล้องหรือแตกต่างกัน รูปแบบของการตอบสนองทางชีวภาพเช่นที่อยู่อาศัยลักษณะ ความหลากหลายและความอุดมสมบูรณ์ของชุมชน และมีความสัมพันธ์กับเชื้อ Streptomyces ที่แตกต่างกันการลักษณะของดินไร่ . รากดินไมโครไบโ มีอิทธิพลจากปัจจัยพันธุกรรมที่ซับซ้อน และอาร์เรย์ที่แตกต่างกันระดับพื้นที่ ได้แก่ ชุมชน พืชอาหารและพืช edaphics ดินและชนิดของจุลินทรีย์และลักษณะชุมชน