3. Results3.1. Characterization of

3. Results
3.1. Characterization of the full-length cDNA of PmXbp1
The full-length cDNAof PmXbp1was 1762 bp in length containing an
open reading frame (ORF) of 855 bp corresponding to a polypeptide of
284 amino acidswith the 5′ and 3′ UTRs of 147 and 741 bp, respectively
(excluding the poly A tail, GenBank accession no. JN644920, Fig. 1).
PmXbp1 showed the closest sequence similarity to Xbp1 of Hottentotta
judaicus (E-value = 1e−24). The deduced PmXbp1 protein contained
three putative N-linked glycosylation sites (NXS/T) at positions
174–176, 240–242 and 280–282, respectively. The calculated pI
and MW of the deduced PmXbp1 protein were 7.65 and 30.66 kDa, respectively.
The signal peptide was not found in this presumed nonsecretory
protein. A BRLZ domain (E-value = 2.32e−10) was found at
amino acids positions 93–157 of the deduced PmXbp1 protein (Fig. 1).
3.2. Determination of sequence polymorphism in PmXbp1 using PCR-SSCP
analysis and DNA-cloning and sequencing
The PCR product of 185 bp in sizewas obtained fromamplification of
PmXbp1 against genomic DNA of 3-month-old P. monodon juveniles. A
total of 3 SSCP patterns were observed (Fig. 2). Of these, patterns A
(N = 44 accounting for 27.16%) and B (N = 116 accounting for
71.60%) were collectively observed in 98.77% of examined specimens
while pattern C was found in only two male individuals (1.23%). Only
a single SNP (T→C349)was observed fromPCR-cloning and sequencing
of representative individuals exhibiting SSCP patterns A (T/T349) and B
(T/C349) (N = 9 each).

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3. ผล
3.1 ลักษณะของยีนยาวเต็มรูปแบบของ PmXbp1
เต็มความยาว cDNAof PmXbp1was 1762 bp
ในความยาวที่มีกรอบการอ่านเปิด(ORF) 855 bp ที่สอดคล้องกับ polypeptide ของ
284 อะมิโน acidswith 5 'และ 3' UTRs 147 และ 741 bp ตามลำดับ
(ไม่รวมโพลีหาง A, ภาคยานุวัติ GenBank ไม่มี. JN644920, รูปที่ 1)..
PmXbp1 แสดงให้เห็นความคล้ายคลึงกันลำดับใกล้เคียงกับ Xbp1 ของ Hottentotta
judaicus (E-value = 1e-24) อนุมานโปรตีน PmXbp1
มีสามสมมุติN-เชื่อมโยงเว็บไซต์ glycosylation (NXS / T) ที่ตำแหน่ง
174-176, 240-242 และ 280-282 ตามลำดับ พี่คำนวณและเมกะวัตต์ของ deduced โปรตีน PmXbp1 เป็น 7.65 และ 30.66 กิโลดาลตันตามลำดับ. ปไทด์สัญญาณไม่พบใน nonsecretory นี้สันนิษฐานว่าโปรตีน โดเมน BRLZ (E-value = 2.32e-10) ถูกพบในตำแหน่งกรดอะมิโน93-157 ของ deduced โปรตีน PmXbp1 (รูปที่ 1).. 3.2 การศึกษาความหลากหลายลำดับ PmXbp1 ใช้ PCR-SSCP การวิเคราะห์และการโคลนดีเอ็นเอและลำดับผลิตภัณฑ์ PCR 185 bp ใน sizewas ได้ fromamplification ของ PmXbp1 กับดีเอ็นเอ 3 เดือนเก่าหนุ่มสาวกุ้งกุลาดำ รวม 3 รูปแบบ SSCP ถูกตั้งข้อสังเกต (รูปที่. 2) ของเหล่านี้รูปแบบ(ยังไม่มี = 44 คิดเป็นสัดส่วน 27.16%) และ B (ยังไม่มี = 116 คิดเป็น71.60%) ถูกตั้งข้อสังเกตในการรวม 98.77% ของตัวอย่างที่ตรวจสอบในขณะที่รูปแบบC พบในเพียงสองคนชาย (1.23%) เฉพาะSNP เดียว (T → C349) พบว่า fromPCR-โคลนและลำดับของบุคคลที่เป็นตัวแทนของการจัดแสดงรูปแบบSSCP A (T / T349) และ B (T / C349) (N = 9 แต่ละคน)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3 . ผลลัพธ์
3.1 . ลักษณะสมบัติของยีนเต็มตัวของ pmxbp1
เต็มตัว cdnaof pmxbp1was 1762 BP ในความยาวที่มี
กรอบเปิดอ่าน ( ORF ) 855 BP ที่สอดคล้องกับพอลิเพปไทด์ของกรดอะมิโน
284 acidswith 5 และ 3 utrs นั้นได้รับของแล้วคุณ BP )
( ยกเว้นโพลีหางขนาดไม่ jn644920 , สนธิ ,
รูปที่ 1 )pmxbp1 มีความคล้ายคลึงกับลำดับใกล้ xbp1 ของ hottentotta
judaicus ( ประโยชน์ = 1e − 24 ) ได้ pmxbp1 โปรตีนที่มีอยู่
3 ซึ่ง n-linked glycosylation เว็บไซต์ ( nxs / t ) ที่ตำแหน่ง
174 และ 176 , 260 และ 280 – 240 ( 282 ) คำนวณค่า PI
และ บริษัทได้ pmxbp1 โปรตีนและ 7.65
30.66 kDa ตามลำดับสัญญาณเปปไทด์พบในนี้สันนิษฐานว่า nonsecretory
โปรตีน เป็น brlz โดเมน ( ประโยชน์ = 2.32e − 10 ) พบใน
กรดอะมิโนตำแหน่ง 93 – 157 ได้ pmxbp1 โปรตีน ( รูปที่ 1 )
2 . การหาลำดับเบสที่ใช้ใน pmxbp1 PCR-SSCP
การวิเคราะห์และดีเอ็นเอการโคลนยีนและลำดับ
pcr ผลิตภัณฑ์ 185 BP ใน sizewas ได้รับ fromamplification ของ
pmxbp1 กับดีเอ็นเอของกุ้งกุลาดำ 3-month-old เยาวชน . มีทั้งหมด 3 รูปแบบ
SSCP พบ ( รูปที่ 2 ) ของเหล่านี้ลวดลาย
( n = 44 บัญชี 27.16 เปอร์เซ็นต์ ) และ B ( n = 116 /
71.60 % ) นี้พบใน 98.77 % ของการตรวจสอบชิ้นงาน
ในขณะที่รูปแบบ C พบเพียงสองชาย บุคคล ( 1.23% ) เท่านั้น : SNP เดี่ยว ( T → keyboard - key - name c349 ) พบว่า frompcr การโคลนยีนและลำดับ
ตัวแทนของบุคคลจัดแสดงรูปแบบ SSCP ( T / t349 ) และ B
( T / c349 ) ( N = 9 คน