Qualitative PCR analysis. For the s

Qualitative PCR analysis. For the species-specific qualitative PCR, DNA was
isolated as described previously (16) earlier. PCRs were carried out as described
previously (37, 40, 41) by using a PTC-200 Peltier Thermal Cycler (Biozym,
Landgraaf, The Netherlands). Amplification products were checked by agarose
gel electrophoresis and ethidium bromide staining.
Species-specific quantitative real-time PCR. For the selection of primer and
probe sequences, the 16S-23S intergenic spacer regions of the different Lactobacillus
species were retrieved from the GenBank, EMBL, and DDBJ databases
as follows: L. acidophilus (AB102855 [25], AF182726 [37], and U32971 [39]), L.
alimentarius (AF500493 [33] and AF500492 [33]), L. amylovorus (AF182732
[37]), L. animalis (AY526616 and AY526614), L. brevis (AB102858 [25] and
AF405353 [11]), L. bulgaricus (Z75475), L. casei (AB102854 [25], AF405352 [11],
AF182729 [37], and AF121200 [38]), L. collinoides (AB117957 and AB117955),
L. crispatus (AF182719 [37] and AF074857 [38]), L. curvatus (AF074858 [38],
U97135 [5], and U97129 [5]), L. delbrueckii (]AB102856 [25], AB035485 [37],
AB035484 [37], U32969 [39], U32968 [39], and U32967 [39]), L. farciminis
(AF500491 [33] and AF500490 [33]), L. fermentum (AF182720 [37]), L. frumenti
(AJ616011), L. gasseri (AB102860 [25], AF182721 [37], and AF074859 [38]), L.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

PCR วิเคราะห์เชิงคุณภาพ สำหรับเชิงคุณภาพ PCR species-specific ดีเอ็นเอได้แยกต่างหากตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (16) ก่อนหน้านี้ PCRs ได้ดำเนินการตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (37, 40, 41) โดยที่ PTC 200 Peltier ร้อน Cycler (BiozymLandgraaf ประเทศเนเธอร์แลนด์) ขยายผลิตภัณฑ์ได้ถูกตรวจสอบ โดย agaroseเจ electrophoresis และย้อมสีโบรไมด์ ethidiumPCR เชิงปริมาณแบบเรียลไทม์ species-specific สำหรับการเลือกสีรองพื้น และลำดับโพรบ ภูมิภาคเป็นตัวเว้นวรรค intergenic 16S 23S ของแลคโตบาซิลลัสแตกต่างกันสายพันธุ์ได้ถูกเรียกใช้จากฐานข้อมูลของ GenBank, EMBL และ DDBJดังนี้: L. acidophilus (AB102855 [25], AF182726 [37], และ U32971 [39]), L.alimentarius (AF500493 [33] และ AF500492 [33]), L. amylovorus (AF182732[37]), L. animalis (AY526616 และ AY526614), L. เทนเซอร์ (AB102858 [25] และAF405353 [11]), L. bulgaricus (Z75475), L. casei (AB102854 [25], AF405352 [11],, AF182729 [37] และ AF121200 [38]), L. collinoides (AB117957 และ AB117955),L. crispatus (AF182719 [37] และ AF074857 [38]), L. curvatus (AF074858 [38],U97135 [5], และ U97129 [5]), L. delbrueckii (] AB102856 [25], AB035485 [37],U32969, AB035484 [37] [39], U32968 [39], และ U32967 [39]), L. farciminis(AF500491 [33] และ AF500490 [33]), L. fermentum (AF182720 [37]), L. frumenti(AJ616011), L. gasseri (AB102860 [25], AF182721 [37], และ AF074859 [38]), L.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์เชิงคุณภาพ PCR สำหรับสายพันธุ์เฉพาะคุณภาพ PCR ดีเอ็นเอ
ที่แยกได้ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (16) ก่อนหน้านี้ PCRs ได้ดำเนินการตามที่อธิบายไว้
ก่อนหน้านี้ (37, 40, 41) โดยใช้ Peltier PTC-200 Thermal Cycler (Biozym,
Landgraaf, เนเธอร์แลนด์) ผลิตภัณฑ์ที่ได้รับการขยายการตรวจสอบโดย agarose
gel electrophoresis การย้อมสีและ ethidium bromide.
สปีชี่เฉพาะ real-time PCR เชิงปริมาณ สำหรับการเลือกของไพรและ
ลำดับการสอบสวน 16S-23S ภูมิภาค spacer intergenic ของแลคโตบาซิลลัสที่แตกต่างกัน
ชนิดที่ดึงมาจาก GenBank, EMBL และฐานข้อมูล DDBJ
ดังนี้ L. acidophilus (AB102855 [25], AF182726 [37] และ U32971 [39]) ลิตร
Alimentarius (AF500493 [33] และ AF500492 [33]) ลิตร amylovorus (AF182732
[37]) animalis ลิตร (AY526616 และ AY526614) ลิตร Brevis (AB102858 [25] และ
AF405353 [11]), L. bulgaricus (Z75475), L. Casei (AB102854 [25], AF405352 [11],
AF182729 [37] และ AF121200 [38]) collinoides ลิตร (AB117957 และ AB117955)
ลิตร crispatus (AF182719 [37] และ AF074857 [38]) L. ​​curvatus (AF074858 [38],
U97135 [5] และ U97129 [5]) ลิตร delbrueckii (] AB102856 [25], AB035485 [37],
AB035484 [37], U32969 [39], U32968 [39] และ U32967 [39]) ลิตร farciminis
(AF500491 [33] และ AF500490 [33]) L. ​​fermentum (AF182720 [37]) ลิตร frumenti
( AJ616011) ลิตร gasseri (AB102860 [25], AF182721 [37] และ AF074859 [38]) ลิตร

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โดยการวิเคราะห์เชิงคุณภาพ สำหรับการตรวจคุณภาพเฉพาะ - ขยายพันธุ์ ดีเอ็นเอคือ
แยกตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ( 16 ) ก่อนหน้านี้ pcrs ได้ดำเนินการตามที่อธิบายไว้
ก่อนหน้านี้ ( 37 , 40 , 41 ) โดยใช้ ptc-200 Peltier ความร้อนรอบ ( ไบโอไซมา
, landgraaf , เนเธอร์แลนด์ ) ผลิตภัณฑ์ขยายถูกตรวจสอบโดยวิธีเจลโรส

คู่และ bromide stainingชนิดเฉพาะเชิงปริมาณแบบ PCR สำหรับการเลือกสีรองพื้นและ
ตรวจสอบลำดับ , 16s-23s ส่า spacer ภูมิภาคต่างสปีชีส์ Lactobacillus
ถูกดึงจากพบสัตว , และ ddbj ฐานข้อมูล
ดังนี้ : L . acidophilus ( ab102855 [ 25 ] af182726 [ 37 ] และ u32971 [ 39 ] ) L .
Alimentarius ( af500493 [ 33 ] และ af500492 [ 33 ] ) L amylovorus ( af182732
[ 37 ] ) Lสัตว์ ( ay526616 และ ay526614 ) ลิตร เบรวิส ( ab102858 [ 25 ] และ
af405353 [ 11 ] ) L . bulgaricus ( z75475 ) , L . casei ( ab102854 [ 25 ] af405352 [ 11 ] ,
af182729 [ 37 ] และ af121200 [ 38 ] ) L collinoides ( ab117957 และ ab117955 )
L crispatus ( af182719 [ 37 ] และ af074857 [ 38 ] , L . curvatus ( af074858 [ 38 ] ,
u97135 [ 5 ] และ u97129 [ 5 ] ) L ( ] delbrueckii ab102856 [ 25 ] ab035485 [ 37 ] ,
ab035484 [ 37 ] u32969 [ 39 ]u32968 [ 39 ] และ u32967 [ 39 ] ) L farciminis
( af500491 [ 33 ] และ af500490 [ 33 ] ) L fermentum ( af182720 [ 37 ] ) L frumenti
( aj616011 ) L gasseri ( ab102860 [ 25 ] af182721 [ 37 ] และ af074859 [ 38 ] ) L