the fractional adhesion oF the STEC

the fractional adhesion oF the STEC 0157 strains to Cac-2 cells
is highly variable with a frequency distribution resembling an overall
skewed distribution(average 0.16, median 0.11), Higher fractions are
more rare and concentrated in the human strains(Fig. 1), Mapping of
the individual sequences to the reference genome resulted in the iden
tification of 27,980 SNps among the tiotal set of 38 test strains. When
the totality of iden tified SNps was used to infer the population stru&ure,
at least three separate populations could be identified(Fig, 2). Fig 2
shows the principal coordinate plot of the 38 strains, with 12.4% of
the variance explained by the first axis, and 8,9% by the second axis
The three identified populations in Fig, 2 reHect the LSPA lineages wi
in STEC 0157(U, LILU and UI)as described by Franz et a,(2012).
After application of the most basic linear regression model(w 11 ou3
correcting for population stmcture), 17 SNPs appeared to» e sigr fica]'
associated with increased adherence to Cac2 cells(Fi&3, Ta» le 2)
1hatis, usinga MAFz0.05 and a significancelevel a-10-4,17 positions

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การยึดเกาะที่เป็นเศษส่วนของ STEC 0157 สายพันธุ์ให้กับเซลล์ Cac-2
เป็นตัวแปรที่มีการแจกแจงความถี่คล้ายโดยรวมการกระจายเบ้ (ค่าเฉลี่ย 0.16, เฉลี่ย 0.11) เศษส่วนที่สูงขึ้นเป็นที่หายากมากขึ้นและความเข้มข้นในสายพันธุ์ของมนุษย์(รูปที่ 1)., ทำแผนที่ของลำดับจีโนมของบุคคลที่จะอ้างอิงผลในiDEN tification ของ 27980 SNPs ในหมู่ชุด tiotal 38 สายพันธุ์ทดสอบ เมื่อจำนวนทั้งสิ้นของ iDEN tified SNPs ถูกใช้ในการสรุปประชากร stru และ ure, อย่างน้อยสามประชากรแยกต่างหากสามารถระบุได้ (รูปที่ 2) รูปที่ 2 แสดงให้เห็นถึงการประสานงานหลักของพล็อต 38 สายพันธุ์ที่มี 12.4% ของความแปรปรวนอธิบายโดยแกนแรกและ8,9% โดยแกนที่สองสามระบุประชากรในรูปที่ 2 reHect LSPA lineages ไร้ ใน STEC 0157 (U, Lilu และ UI) ตามที่อธิบายไว้โดยฟรานซ์และการ (2012). หลังจากที่ใช้มากที่สุดพื้นฐานรูปแบบการถดถอยเชิงเส้น (w 11 ou3 แก้ไขสำหรับ stmcture ประชากร) 17 SNPs ดูเหมือน» E sigr fica] ที่เกี่ยวข้องกับการเพิ่มขึ้น ยึดมั่นในเซลล์ Cac2 (Fi และ 3 ตา» le 2) 1hatis, usinga MAFz0.05 และ significancelevel A-10-4,17 ตำแหน่ง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การยึดเกาะที่เป็นเศษส่วนของ STEC สายพันธุ์ O157 cac-2 เซลล์
สูงตัวแปรที่มีการแจกแจงความถี่คล้ายรวม
การแจกแจงแบบเบ้ ( เฉลี่ย 0.16 , เฉลี่ย 0.11 ) เศษส่วนสูงกว่า
มากขึ้นที่หายากและเข้มข้นในสายพันธุ์มนุษย์ ( รูปที่ 1 ) แผนที่
ลำดับแต่ละอ้างอิง ส่งผลให้เกิด tification จีโนม iDEN
27 ,980 snps ระหว่างชุด tiotal 38 ทดสอบสายพันธุ์ เมื่อ
รวมของ iDEN tified snps ใช้ สรุปว่าประชากรของ& ure
, ประชากรแยกอย่างน้อยสามอาจจะระบุ ( รูปที่ 2 ) รูปที่ 2 แสดงหลักประสานงาน
พล็อตของ 38 สายพันธุ์ กับ 12.4% ของ
แปรปรวนอธิบายโดยแกนแรกและ 8,9 % โดย
แกนที่สองสามระบุว่าประชากรในกอก2 rehect ที่ lspa พันธุ์วี N ( U , E
ใน STEC ลิลูและ UI ) ตามที่อธิบายไว้โดยฟรานซ์ ET , ( 2555 )
หลังจากการใช้พื้นฐานของตัวแบบการถดถอยเชิงเส้น ( W 11 ou3
แก้ไขสำหรับ stmcture ประชากร ) , 17 snps ปรากฏ» E sigr fica ] '
เกี่ยวข้องกับการเพิ่มการ cac2 เซลล์ ( Fi & 3 ตา»เลอ 2 )
1hatis การ mafz0.05 , และระดับนัยสำคัญทางสถิติ a-10-4,17 ตำแหน่ง