2.3. Bacterial identification by 16

2.3. Bacterial identification by 16S rRNA gene sequence analysis
A few representative isolates from each distinct RAPD group were identified using 16S rRNA gene sequence analysis. Primers fD1 and rD1 were used to amplify about 1500 base pairs(bp) genome fragment with 16S rRNA gene sequences (Weisburg et al., 1991). The primers are described in Table 1. The amplification reaction was performed under the following conditions: preliminary denaturation for 5 min at 94 °C, then 30 cycles of 94 °C for 30 s, 56 °C for 30 s, and 72 °C for 1 min, and final extension at 72 °C for 10 min. The PCR productswere sequenced by a commercial sequencing facility (Shanghai Sangon Biotechnology Corporation, Shanghai). The 16S rRNA gene sequences were used to identify the isolates using EzTaxonserver aswell as NCBI database

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.3. รหัสแบคทีเรีย โดยการวิเคราะห์ลำดับของยีน 16S rRNA กี่ตัวแทนที่แยกได้จากแต่ละกลุ่มอาร์เอพีดีได้ระบุโดยใช้การวิเคราะห์ลำดับของยีน 16S rRNA ไพรเมอร์ fD1 และ rD1 ถูกใช้เพื่อขยายส่วนกลุ่มฐาน pairs(bp) 1500 กับ 16S rRNA ยีนลำดับ (Weisburg et al. 1991) ไพรเมอร์ที่อธิบายไว้ในตารางที่ 1 ปฏิกิริยาขยายดำเนินการต่อไปนี้: แปรสภาพเบื้องต้นสำหรับ 5 นาทีที่ 94 ° C จากนั้นรอบ 30 94 ° c 30 s, 56 ° C 30 s และ 72 ° C เป็นเวลา 1 นาที และส่วนสุดท้ายที่ 72 ° C เป็นเวลา 10 นาที Productswere PCR ที่เรียงลำดับตามลำดับเชิงพาณิชย์วงเงิน (เซี่ยงไฮ้ Sangon เทคโนโลยีชีวภาพ Corporation เซี่ยงไฮ้) 16S rRNA ยีนลำดับถูกใช้ในการระบุแยกใช้เช่น EzTaxonserver เป็นฐานข้อมูล NCBI

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.3 บัตรประจำตัวของเชื้อแบคทีเรียโดยการวิเคราะห์ 16S rRNA ยีนลำดับ
ตัวแทนไม่กี่แยกจากแต่ละกลุ่มที่แตกต่างกัน RAPD ถูกระบุโดยใช้ 16S rRNA วิเคราะห์ลำดับยีน ไพรเมอร์และ FD1 Rd1 ถูกนำมาใช้ในการขยายฐานประมาณ 1500 คู่ (BP) ชิ้นส่วนจีโนมกับ 16S rRNA ลำดับยีน (Weisburg et al., 1991) ไพรเมอร์ได้อธิบายไว้ในตารางที่ 1 ปฏิกิริยาขยายได้ดำเนินการภายใต้เงื่อนไขดังต่อไปนี้: denaturation เบื้องต้นสำหรับ 5 นาทีที่ 94 ° C แล้ว 30 รอบจาก 94 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 30 วินาที, 56 ° C เป็นเวลา 30 วินาทีและ 72 ° C เป็นเวลา 1 นาทีและส่วนสุดท้ายที่ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 10 นาที PCR productswere ติดใจด้วยสิ่งอำนวยความสะดวกลำดับในเชิงพาณิชย์ (Shanghai Sangon เทคโนโลยีชีวภาพคอร์ปอเรชั่นเซี่ยงไฮ้) 16S rRNA ลำดับยีนถูกนำมาใช้ในการระบุสายพันธุ์โดยใช้ EzTaxonserver ตลอดจนฐานข้อมูล NCBI

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.3 โดยการวิเคราะห์ลำดับเบส 16S rRNA จุลินทรีย์ตัวยีนตัวแทนไม่กี่ที่แยกได้จากแต่ละที่แตกต่างกันโดยกลุ่มที่ระบุการใช้ลำดับเบส 16S rRNA ยีนการวิเคราะห์ ไพรเมอร์เพื่อการวิเคราะห์ rd1 และนำมาขยายประมาณ 1500 คู่เบส ( BP ) จีโนมลำดับเบส 16S rRNA ยีนจำเพาะกับ ( weisburg et al . , 1991 ) ไพรเมอร์อธิบายไว้ในตารางที่ 1 โดยการเพิ่มปฏิกิริยาที่ดำเนินการภายใต้เงื่อนไขดังต่อไปนี้ : เบื้องต้น ( สำหรับ 5 นาทีที่ 94 ° C แล้ว 30 รอบ 94 ° C เป็นเวลา 30 วินาที , 56 ° C เป็นเวลา 30 วินาที กับ 72 ° C เป็นเวลา 1 นาที และเบอร์สุดท้ายที่ 72 องศา C นาน 10 นาที การตรวจยีนโดยลำดับและเชิงพาณิชย์ สิ่งอำนวยความสะดวก ( Shanghai แสงอ่อน บริษัท เทคโนโลยีชีวภาพเซี่ยงไฮ้ ) การลำดับเบส 16S rRNA ยีนถูกใช้เพื่อระบุว่าใช้ eztaxonserver ncbi และฐานข้อมูล