All PCR reagents
were acquired from Promega, and fluorescently labeled primers
were synthesized by Integrated DNA Technologies. Triplicate 50 ml
PCRs contained 10 ml of 5 GoTaq Flexi Buffer, 3 ml of 25 mM MgCl2,
5 ml of dNTPs for 250 mM final concentration each, 4 ml of a 5 mM
stock of the forward primer 341F or EukA, 4 ml of a 5 mM stock of the
reverse primer 926R or Euk570rev, 0.5 ml 10 mg/ml acetylated BSA,
and 100 ng of template. Reactions were heated to 95 8C for 2 min,
then held at 80 8C while 1 U GoTaq Flexi DNA polymerase (Promega)
was added, and amplification was performed for 30 cycles of 95 8C
for 30 s, 57 8C (16S) or 55 8C (18S) for 30 s, and 72 8C for 1 min,
followed by a final extension at 72 8C for 5 min and a 4 8C hold. PCR
products were visualized on 1.2% agarose gels to confirm
amplification of products of the expected size. Replicate PCR
products were pooled and purified with Promega Wizard SV Gel and
PCR Clean-up System. The DNA was quantified by PicoGreen
staining (Invitrogen) and a Turner Designs TBS-380 Mini Fluorome-
ter. PCR products were treated with Klenow fragment (from
Promega) to fill in partially single-stranded amplicons (Egert
and Friedrich, 2005).
ทั้งหมดได้มาจาก promega pcr reagents
,
fluorescently ติดป้ายและไพรเมอร์สังเคราะห์โดยดีเอ็นเอเทคโนโลยีแบบบูรณาการ ทำสำเนาสามฉบับ 50 ml
pcrs ที่มีอยู่ 10 ml 5 gotaq Flexi บัฟเฟอร์ , 3 ml ชุด 25 มม. ,
5 มิลลิลิตร dntps 250 มิลลิเมตรสุดท้ายของแต่ละ , 4 ml 5 mm
หุ้นของส่งต่อรองพื้น 341f หรือ euka , 4 ml 5 มิลลิเมตรหุ้นของ
กลับ 926r รองพื้นหรือ euk570rev , 0 .10 มก. / มล. ( ยาว 5 ml
100 ng ของแม่แบบ ปฏิกิริยาความร้อน 95 8C 2 มิน
จากนั้นจัดขึ้นที่ 80 8C ในขณะที่ 1 u gotaq ดีเอ็นเอพอลิเมอเรส ( promega Flexi )
ถูกเพิ่มและขยายได้ 30 รอบ 95 8C
30 , 57 8C ( 16S ) หรือ 55 8C ( 18S ) 30 , และ 72 8C สำหรับ 1 นาที ตามด้วยนามสกุล
สุดท้ายที่ 72 8C เป็นเวลา 5 นาทีและ 4 8C ถือ ผลิตภัณฑ์ PCR
เป็นภาพบน 12% ( เจลยืนยัน
( ผลิตภัณฑ์ที่คาดหวัง ) เลียนแบบผลิตภัณฑ์ PCR
ถูกรวมและทำให้บริสุทธิ์ ด้วยเจล SV ตัว promega
PCR และทำความสะอาดระบบ ดีเอ็นเอ quantified โดย picogreen
staining ( Invitrogen ) และหมุนแบบ tbs-380 มินิ fluorome -
เธอ . ผลิตภัณฑ์ทั้งหมดจะถูกรักษาด้วย klenow ~ (
promega ) เพื่อเติมเต็มในบางส่วนเดียวติด amplicons
( เอเกิร์ตและ ฟรีดริช , 2005 )
การแปล กรุณารอสักครู่..