The initial structure was submitted as a rigid body and refined
using REFMAC5 [50]. The Rfactor and Rfree converged to 23.41% and
25.59%, respectively. The structure was modeled using COOT [53].
The IAA molecule was added to the structure using COOT [53]. A
poor electronic density was observed in the region between residues
117 and 122, and it was not possible to add the corresponding
residues (Ser117, Asn118, Thr119, Ser120, His121 and
Glu122) to the density, which has been reported in several other
studies of this class of proteins [36,54]. A total of 60 water molecules
were added using COOT [53], and a second restrained
refinement was performed resulting in a Rfactor of 20.63% and
a Rfree of 22.54%.
โครงสร้างเริ่มต้นถูกส่งเป็นร่างแข็ง และกลั่นใช้ REFMAC5 [50] Rfactor และ Rfree converged 23.41% และ25.59% ตามลำดับ โครงสร้างถูกจำลองใช้ COOT [53]โมเลกุล IAA ถูกเพิ่มลงในโครงสร้างที่ใช้ COOT [53] Aพบว่า ความหนาแน่นต่ำอิเล็กทรอนิกส์ในภูมิภาคระหว่างตกค้าง117 และ 122 และมันไม่ได้เพิ่มสอดคล้องกันตกค้าง (Ser117, Asn118, Thr119, Ser120, His121 และGlu122) เพื่อความหนาแน่น ซึ่งได้รับการรายงานในหลายการศึกษาระดับนี้ของโปรตีน [36,54] จำนวนโมเลกุลของน้ำ 60ถูกเพิ่มโดยใช้ COOT [53], และเสี้ยววินาทีทำการปรับแต่งใน Rfactor 20.63% และเป็น Rfree 22.54%
การแปล กรุณารอสักครู่..

โครงสร้างเบื้องต้นได้ส่งเป็นร่างกายแข็งและการกลั่นการใช้ refmac5 [ 50 ] และที่ rfactor rfree แปรสภาพเพื่อเข้าล้านบาท2 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ โครงสร้างถูกออกแบบโดยใช้คูท [ 53 ]IAA โมเลกุลถูกเพิ่มไปยังโครงสร้างโดยใช้คูท [ 53 ] เป็นความหนาแน่นของอิเล็กตรอนที่น่าสงสารก็ถูกพบในภูมิภาคระหว่างตกค้างและ 122 และมันเป็นไปไม่ได้ที่จะเพิ่มที่สอดคล้องกันตกค้าง ( ser117 asn118 , thr119 ser120 his121 , , , และglu122 ) ความหนาแน่นซึ่งได้รับการรายงานในหลาย ๆการศึกษาระดับโปรตีน [ 36,54 ] นี้ ทั้งหมด 60 น้ำโมเลกุลเพิ่มการทำลาย [ 53 ] , และสองมัดการกระทำที่เกิดขึ้นใน rfactor ของ 20.63 ล้านบาทเป็น rfree ของ 22.54 %
การแปล กรุณารอสักครู่..
