DNA damage and repair assays
Some assays measure DNA damage itself,rather than mutational consequences of DNA damage. They may do so directly, through such indicators as chemical adducts or strand breaks in DNA, or indirectly, through the measurement of biological repair processes. Adducts in DNA are detected by P-postlabeling, high performance liquid chromatography (HPLC), fluorescence-based method, mass spectrometry, immunological methods using antibodies against specific adducts, isotope-labeled DNA binding, and electrochemical detection. The P-postlabeling method is highly versatile, in that it is sensitive and can be applied to diverse mutagens, but it may fall short of other method for quantitative accuracy. Through a combination of methods, may classes of adducts , including those of such en widespread compounds as polynuclear aromatic hydrocarbon, can be detected . the measurement of adducts after human chemical exposures has proven useful in human monitoring, molecular dosimetry, and risk assessment. adducts in somatic cells are relevant to carcinogenesis , whereas those in reproductive cells permit molecular dosimetry for germ cell mutagenesis.
DNA stand breakage can be measured by alkaline elution and electrophoretic methods . Single-cell gel electrophoresis, comet assys,is a windely used, repid method of measuring DNA damage. In this assay cells are incorporated to electrophoresis. The DNA is stained with a fluorescent dye for observation and image analysis. Because broken DNA fragment migrate more quickly than larger pieces of DNA , a blur of fragment is observed when the DNA is extensively damaged. The extent of DNA damage can be estimated from the length and other attributes of the comet tail. Variations in the procedure permit the general detection of DAN strand breakage under alkaline conditions or the preferential detection of double-strand breaks under neutral conditions. A recent developmwnt is the combination of the comet assay with FISH to detect damage in specific regions of the genome. Although the comet assay is relatively new, it has proven to be a sensitive indicator of DNA damage with broad applicability. It has been used most commonly with human lymphocytes and other mammalian cells, but it can be adapted to diverse species, including plants, worms, mollusks and amphibians. This adaptability makes it well suited to use in EN genetic toxicology . the applicability of the comet assay and other DNA damage assays to rodent testes makes these method helpful in interpreting risks to germ cell.
The occurrence of DNA repair can serve as an easily measured indicator of DNA damage . repair assays have been developed in mircoorganisms, cultured mammaline cell, and intact mammals.
Greater toxicity of a chemical in DNA-repair-deficient strains than in their repair-proficient counterparts can serve as an indicator of DNA damage in bacteria. Bacteria repair assays find occasional application but are used less commonly today than historically. The measurement of UDS, which is a measure of excision repair, is a mammalin DNA repair assay. The occurrence of UDS, indicates that DNA has been damage. The absence of UDS, however, does not provide evidence that DNA has not been damage because some classes of damage are not readily excised, and some excisable damage may not be detected as a consequence of assay insensitivity damage . Despite these limitations, UDS assays continue to find some use because of their applicability to cultured hepatocytes with endogenous cyctochrome P450 enzyme activities and to tissues of intact animals, including hepatocytes and germinal tissue.
Beside specific DNA repair processes, the induction of general responses to genotoxic stress has been used as an indicator of genetic damage or by colorimetry, can serve as an indicator of genetic damage in bacteria. The GADD45a-GFP assay, also called TK6 cell. The stress response is detected by a green-fluorescent protein reporter in the genetic construct, and the induction of fluorescence has been observed with mutagens, clastogens, and aneugens. The assay can be conducted with s9 metabolic activation and lends itself to automated detection by flow cytometry.
ความเสียหายของดีเอ็นเอและซ่อมแซมบางส่วน )
) วัดความเสียหายของดีเอ็นเอตัวเองมากกว่าสิ่งที่เปลี่ยนแปลงผลของความเสียหายของดีเอ็นเอ พวกเขาอาจทำเช่นนั้นโดยตรงผ่านตัวชี้วัด เช่น adducts เคมีหรือกลุ่มแบ่งในดีเอ็นเอ หรือโดยอ้อมผ่านวัดของกระบวนการซ่อมแซมทางชีวภาพ adducts ในดีเอ็นเอที่ตรวจพบโดย p-postlabeling โครมาโทกราฟีของเหลวสมรรถนะสูง ( HPLC )การใช้วิธี , แมส , วิธีการรักษาโดยใช้แอนติบอดีต่อเฉพาะ adducts ไอโซโทป , ป้ายดีเอ็นเอมัด และการตรวจวัดทางเคมีไฟฟ้า การ p-postlabeling เป็นวิธีการที่หลากหลายมาก เพราะมันเป็นเรื่องละเอียดอ่อนและสามารถใช้กับหลากหลายต่าง แต่อาจตกสั้นของวิธีการอื่น ๆเพื่อความถูกต้องเชิงปริมาณ ผ่านการรวมกันของวิธีการอาจจะเรียน adducts รวมทั้งพวก เช่น ในสารประกอบที่แพร่หลายในโพลีนิวเคลียร์อะโรมาติกไฮโดรคาร์บอน สามารถตรวจพบ การวัด adducts หลังจากเปิดรับเคมีมนุษย์ได้พิสูจน์ประโยชน์ในการตรวจสอบของมนุษย์โมเลกุลขนาดยา และการประเมินความเสี่ยง adducts ในโซมาติกเซลล์เกี่ยวข้องกับมะเร็ง ,ส่วนในการสืบพันธุ์เซลล์ระดับโมเลกุลสำหรับการอนุญาตค่าเซลล์เชื้อโรค .
แตกยืนดีเอ็นเอที่สามารถวัดได้โดยใช้ด่างและวิธีการรูปแบบ . เซลล์เดียวเจลอิเล็ก assys ดาวหางเป็น windely ตัวอย่างเลือด ขนาดเล็กใช้วิธีการวัดความเสียหายของดีเอ็นเอ ในการทดสอบนี้เซลล์จะรวมกับเรสดีเอ็นเอที่เปื้อนด้วยสีเรืองแสงสำหรับการสังเกตและการวิเคราะห์ภาพ เพราะชิ้นส่วนดีเอ็นเอแตกโยกย้ายเร็วกว่าชิ้นใหญ่ ดีเอ็นเอ เบลอขนาดเป็นที่สังเกตเมื่อดีเอ็นเอเกิดความเสียหายอย่างกว้างขวาง ขอบเขตของความเสียหายของดีเอ็นเอสามารถประมาณได้จากความยาวและคุณสมบัติอื่น ๆของดาวหางหางการเปลี่ยนแปลงในกระบวนการอนุญาตให้ตรวจสอบทั่วไปของการแตกแดนสาระภายใต้เงื่อนไขที่เป็นด่างหรือการตรวจสอบพิเศษของคู่เกลียวแบ่งภายใต้เงื่อนไขที่เป็นกลาง เป็น developmwnt ล่าสุดคือการรวมกันของดาวหางวิเคราะห์กับปลาเพื่อตรวจสอบความเสียหาย โดยเฉพาะส่วนของโครโมโซม . แม้ว่าดาวหางวิเคราะห์ที่ค่อนข้างใหม่มันได้พิสูจน์ให้เป็นตัวบ่งชี้ที่สำคัญของความเสียหายของดีเอ็นเอกับกว้างการบังคับใช้ มันถูกใช้มากที่สุด มีเม็ดเลือดขาวและเซลล์ของมนุษย์ ) อื่น ๆ แต่สามารถปรับให้เข้ากับหลากหลายชนิดรวมทั้งพืช หนอน หอย และสัตว์ครึ่งบกครึ่งน้ำ . การปรับตัวนี้ทำให้มันเหมาะที่จะใช้ในและพิษวิทยาพันธุกรรมการบังคับใช้ของดาวหางและความเสียหายของดีเอ็นเอในเลือดอื่น ๆหนูอัณฑะทำให้วิธีการนี้เป็นประโยชน์ในการตีความจากเซลล์สืบพันธุ์ .
เกิดการซ่อมแซมดีเอ็นเอสามารถใช้เป็นตัวบ่งชี้วัดได้อย่างง่ายดายความเสียหายดีเอ็นเอ สามารถซ่อมแซมได้ถูกพัฒนาขึ้นใน mircoorganisms เพาะเลี้ยงเซลล์ , mammaline เหมือนเดิม
, สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมมากกว่าความเป็นพิษของสารเคมีในการซ่อมแซมดีเอ็นเอสายพันธุ์กว่าการซ่อมมีคู่ของพวกเขาสามารถใช้เป็นตัวบ่งชี้ของความเสียหายของดีเอ็นเอในแบคทีเรีย แบคทีเรียสามารถหาโปรแกรมซ่อมแซมเป็นครั้งคราว แต่ใช้น้อยกว่าปกติในวันนี้กว่าในอดีต การวัดของเธอ ซึ่งเป็นวัดในการขับไล่ซ่อมแซมเป็น mammalin การซ่อมแซมดีเอ็นเอการทดสอบ เธอเกิด ,พบว่าดีเอ็นเอที่ได้รับความเสียหาย การขาดหายไปของเธอ แต่ไม่ได้ให้หลักฐานดีเอ็นเอที่ได้รับความเสียหายเนื่องจากบางประเภทของความเสียหายจะไม่ยอมตัด และความเสียหายบางอย่าง excisable อาจไม่สามารถตรวจพบได้โดยผลของความเสียหายที่ต่อต้านแบคทีเรีย แม้จะมีข้อ จำกัด เหล่านี้เธอพยายาม ยังคงหาใช้ เพราะจะประยุกต์ใช้กับเซลล์ตับ เลี้ยงใน cyctochrome พีเอนไซม์กิจกรรมและเนื้อเยื่อสัตว์เหมือนเดิม รวมทั้งต่อเชื้อโรคและเนื้อเยื่อ .
นอกจากกระบวนการซ่อมแซมดีเอ็นเอที่เฉพาะเจาะจง การตอบสนองทั่วไปเน้นต่อยได้ถูกใช้เป็นตัวบ่งชี้ของความเสียหายทางพันธุกรรมหรือเม็ด ,
การแปล กรุณารอสักครู่..
