Community structure, population dyn

Community structure, population dynamics and diversity of fungi were monitored in a full-scale membrane bioreactor (MBR) operated throughout four experimental phases (Summer 2009, Autumn 2009, Summer 2010 and Winter, 2012) under different conditions, using the 18S-rRNA gene and the intergenic transcribed spacer (ITS2-region) as molecular markers, and a combination of temperature-gradient gel electrophoresis and 454-pyrosequencing. Both total and metabolically-active fungal populations were fingerprinted, by amplification of molecular markers from community DNA and retrotranscribed RNA, respectively. Fingerprinting and 454-pyrosequencing evidenced that the MBR sheltered a dynamic fungal community composed of a low number of species, in accordance with the knowledge of fungal diversity in freshwater environments, and displaying a medium-high level of functional organization with few numerically dominant phylotypes. Population shifts were experienced in strong correlation with the changes of environmental variables and operation parameters, with pH contributing the highest level of explanation. Phylotypes assigned to nine different fungal Phyla were detected, although the community was mainly composed of Ascomycota, Basidiomycota and Chytridiomycota/Blastocladiomycota. Prevailing fungal phylotypes were affiliated to Saccharomycetes and Chytridiomycetes/Blastocladiomycetes, which displayed antagonistic trends in their relative abundance throughout the experimental period. Fungi identified in the activated sludge were closely related to genera of relevance for the degradation of organic matter and trace-organic contaminants, as well as genera of dimorphic fungi potentially able to produce plant operational issues such as foaming or biofouling. Phylotypes closely related to genera of human and plant pathogenic fungi were also detected.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ติดตามโครงสร้างชุมชน พลศาสตร์ประชากร และความหลากหลายของเชื้อราในการเต็มรูปแบบเมมเบรนถังปฏิกรณ์ชีวภาพ (MBR) ดำเนินตลอดสี่ทดลองระยะ (2552 ฤดูร้อน ฤดูใบไม้ร่วง 2009, 2010 ฤดูร้อน และฤดู หนาว 2012) ภายใต้เงื่อนไขที่แตกต่างกัน ใช้ยีน 18 ปี rRNA และ intergenic การทับศัพท์ในรูป spacer (ITS2 ภูมิภาค) โมเลกุลเครื่องหมาย และอิเจไล่ระดับอุณหภูมิและ 454 pyrosequencing ประชากรเชื้อราทั้งรวม และใช้ งาน metabolically ถูกพิมพ์ลายนิ้วมือ โดยการขยายของโมเลกุลเครื่องหมายจากชุมชนดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอ retrotranscribed ตามลำดับ ลายและ 454 pyrosequencing เห็นว่า MBR กำบังชุมชนเชื้อราแบบไดนามิกประกอบด้วยจำนวนต่ำสุดของสายพันธุ์ ตามความรู้ที่หลากหลายในสภาพแวดล้อมน้ำจืด เชื้อรา และการแสดง phylotypes หลักตัวเลขไม่กี่องค์กรที่ทำงานในระดับปานกลาง-สูง ประชากรกะผู้มีประสบการณ์ในความสัมพันธ์กับการเปลี่ยนแปลงของสิ่งแวดล้อมตัวแปรและพารามิเตอร์การดำเนินการ มีค่า pH ระดับสูงสุดของคำอธิบายที่เอื้อต่อ Phylotypes ที่กำหนดให้กับอาณาจักรเชื้อราต่าง ๆ เก้าพบ แม้ว่าชุมชนส่วนใหญ่ประกอบด้วย Ascomycota, Basidiomycota และ Chytridiomycota/Blastocladiomycota อัตราเชื้อรา phylotypes ถูกสังกัด Saccharomycetes และ Chytridiomycetes/Blastocladiomycetes ซึ่งแสดงแนวโน้มต่อต้านของพวกเขามากมายญาติตลอดระยะเวลาทดลอง เชื้อราที่พบตะกอนงานมีสัมพันธ์ใกล้ชิดกับสกุลที่เกี่ยวข้องสำหรับย่อยสลายของอินทรีย์ และสิ่งปนเปื้อนอินทรีย์ติดตาม เป็นสกุลของเชื้อรา dimorphic อาจสามารถผลิตพืชปัญหาการดำเนินงานเช่นโฟมหรือ biofouling Phylotypes สัมพันธ์ใกล้ชิดกับสกุลของมนุษย์ และยังตรวจพบเชื้อราก่อโรคพืช

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โครงสร้างชุมชน, การเปลี่ยนแปลงของประชากรและความหลากหลายของเชื้อราถูกตรวจสอบในเต็มรูปแบบเมมเบรนเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพ (MBR) ดำเนินการตลอดทั้งสี่ขั้นตอนการทดลอง (ฤดูร้อนปี 2009 ในฤดูใบไม้ร่วงปี 2009 ในช่วงฤดูร้อนปี 2010 และฤดูหนาว 2012) ภายใต้เงื่อนไขที่แตกต่างกันโดยใช้ยีน 18S-rRNA และ intergenic คัดลอก spacer (ITS2 ภูมิภาค) เป็นเครื่องหมายโมเลกุลและการรวมกันของอุณหภูมิลาดข่าวคราวและ 454-pyrosequencing รวมและเมตาบอลิใช้งานประชากรเชื้อราทั้งสองถูกพิมพ์ลายนิ้วมือโดยใช้เครื่องขยายเสียงของเครื่องหมายโมเลกุลดีเอ็นเอจากชุมชนและ retrotranscribed RNA ตามลำดับ พิมพ์ลายนิ้วมือและ 454-pyrosequencing หลักฐานว่า MBR กำบังชุมชนเชื้อราแบบไดนามิกประกอบด้วยจำนวนต่ำของสายพันธุ์ให้สอดคล้องกับความรู้ของความหลากหลายของเชื้อราในสภาพแวดล้อมที่น้ำจืดและการแสดงระดับกลางสูงขององค์กรการทำงานที่มีไม่กี่ที่โดดเด่น phylotypes ตัวเลข การเปลี่ยนแปลงประชากรมีประสบการณ์ในความสัมพันธ์ที่แข็งแกร่งกับการเปลี่ยนแปลงของตัวแปรด้านสิ่งแวดล้อมและพารามิเตอร์การดำเนินงานที่มีค่า pH ที่เอื้อในระดับสูงสุดของคำอธิบาย Phylotypes มอบหมายให้เก้า Phyla เชื้อราที่แตกต่างกันพบแม้จะเป็นชุมชนส่วนใหญ่ประกอบด้วย Ascomycota, โคตาและ Chytridiomycota / Blastocladiomycota แลกเปลี่ยน phylotypes เชื้อราร่วมกับ Saccharomycetes และ Chytridiomycetes / Blastocladiomycetes ซึ่งแสดงแนวโน้มปฏิปักษ์ในความอุดมสมบูรณ์ของญาติตลอดระยะเวลาการทดลอง เชื้อราที่ระบุไว้ในตะกอนมีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับจำพวกของความเกี่ยวข้องสำหรับการย่อยสลายของสารอินทรีย์และติดตามอินทรีย์สารปนเปื้อนเช่นเดียวกับจำพวกของเชื้อราที่อาจเกิดขึ้น dimorphic สามารถในการผลิตพืชปัญหาการดำเนินงานเช่นการเกิดฟองหรือ biofouling Phylotypes ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับจำพวกของเชื้อราที่ทำให้เกิดโรคของมนุษย์และพืชตรวจพบยัง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โครงสร้างของชุมชน ประชากรพลวัตและความหลากหลายของเชื้อราในถังปฏิกรณ์ชีวภาพเมมเบรนถูกเต็มรูปแบบ ( MBR ) ดำเนินการตลอดสี่ขั้นตอนการทดลอง ( ฤดูร้อน 2009 ฤดูใบไม้ร่วง 2009 , ฤดูร้อนและฤดูหนาว 2012 ) ภายใต้เงื่อนไขที่แตกต่างกันโดยใช้ 18S rRNA ยีนและส่าแกะ Spacer ( its2 ภูมิภาค ) เป็นเครื่องหมายโมเลกุลและการรวมกันของ อุณหภูมิลาดเจลอิเลคโตรโฟรีซีสและ 454 ไพโรซีเควนซิง . ทั้งรวมและ metabolically ปราดเปรียวประชากรเชื้อราเป็นจีโนม , โดยการเพิ่มเครื่องหมายโมเลกุลดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอ retrotranscribed จากชุมชนตามลำดับ ตรวจสอบลายนิ้วมือและ 454 ไพโรซีเควนซิงเป็นหลักฐานที่ MBR ซุ้มแบบไดนามิกของชุมชนประกอบด้วยจำนวนต่ำของชนิด ตามความรู้ที่มีความหลากหลายในสภาพแวดล้อมที่น้ำจืด และแสดงระดับการทำงานองค์กรขนาดกลางด้วย phylotypes พบมากน้อย กะจำนวนประสบการณ์ในความสัมพันธ์กับการเปลี่ยนแปลงของสิ่งแวดล้อมและพารามิเตอร์การดำเนินงานที่มี pH มีผลต่อระดับของคำอธิบาย phylotypes มอบหมายให้เก้าที่แตกต่างกันทั้งหมดตรวจพบเชื้อรา แม้ว่าชุมชนจะประกอบด้วยส่วนใหญ่ของโคไมโคตา Basidiomycota ไคตริโ ายโคตา , และ / blastocladiomycota . เกิดเชื้อรา phylotypes เป็นเครือ และ saccharomycetes chytridiomycetes / blastocladiomycetes ซึ่งแสดงแนวโน้มปฏิปักษ์ของญาติมากมายตลอดระยะเวลาทดลอง เชื้อราที่ระบุในกากตะกอนน้ำเสียมีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับสกุลของความเกี่ยวข้องการสลายตัวของอินทรียวัตถุและติดตามสารปนเปื้อนอินทรีย์เช่นเดียวกับสกุลไดมอร์ฟิค เชื้อราอาจสามารถผลิตพืชการดำเนินงานปัญหา เช่น โฟม หรือ biofouling . phylotypes อย่างใกล้ชิดที่เกี่ยวข้องกับสกุลของมนุษย์และโรคพืช เชื้อรา นอกจากนี้ยังตรวจพบ