Sequence information is useful to p

Sequence information is useful to permit the conversion
of dominant to co-dominant markers. Because most
SRAP markers produce clear high-intensity bands rarely
overlapping (Figs. 1, 3), it is easier than for AFLP mark-
ers to sequence polymorphisms for them by cutting di-
rectly from the gels. We isolated 29 polymorphic bands
resulting from the amplification of the Brassica RI lines,
using seven different primer combinations. Twenty five
of the twenty nine sequences could be read to completion,
whereas four bands could be only partially read and these
were not analyzed. We found that the GC content of 16
(64%) of the sequences was over 35%, which indicates
that they possibly fall into exons, assuming similar gene
structures in Brassica and Arabidopsis (Lin 1999; Quiros
et al. 2000). After a BLAST search, we found that 15
(60%) shared significant similarity to reported gene se-
quences stored in the Genbank database (Table 2). This
finding confirmed that a large proportion of the bands
generated by SRAPs include exons in ORFs, which are
expected to be evenly distributed along all chromosomes.
Sequencing demonstrated also that SRAP polymor-
phism results from two events, fragment size changes
due to insertions and deletions, which could lead to co-
dominant markers, and nucleotide changes leading to
dominant markers. Among the sequenced bands we
selected five pairs that appeared to be co-dominant in
the gel (Fig. 3). Sequencing of both parental bands dem-
onstrated similar sequences differing only by small in-
sertions or deletions. The difference in size for each pair
of co-dominant markers determined by sequencing,
matched the sizes estimated on the gel by migration dis-
tance. Therefore, the co-dominant markers resulted from
the size change delimited by the binding sites of the two
primers. The rest of the sequenced SRAP markers were

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับข้อมูลมีประโยชน์เพื่ออนุญาตให้มีการแปลงของหลักการเครื่องหมายโดดเด่นร่วม เนื่องจากส่วนใหญ่เครื่องหมาย SRAP ผลิตวงความเข้มสูงชัดเจนไม่ค่อยซ้อน (มะเดื่อ. 1, 3), มันจะง่ายกว่าสำหรับเครื่องหมาย AFLPers การ polymorphisms ลำดับนั้นโดยตัด di-rectly จากการเจ เราแยกวง polymorphic 29เกิดจากการขยายของเส้นผัก RIใช้ผสมรองพื้นแตกต่างกันเจ็ด ยี่สิบห้าลำดับยี่สิบเก้าที่สามารถอ่านให้เสร็จสมบูรณ์ในขณะที่วงดนตรีสี่อาจจะอ่านเพียงบางส่วนและได้วิเคราะห์ เราพบว่าเนื้อหา GC 16(64%) ลำดับได้กว่า 35% ซึ่งบ่งชี้ว่า พวกเขาอาจตก exons สมมติว่ายีนคล้ายกันโครงสร้างในผักและ Arabidopsis (Lin 1999 Quiroset al. 2000) หลังจากค้นหาระเบิด เราพบว่า 15(60%) ใช้ร่วมกันอย่างมีนัยสำคัญคล้ายกับรายงานยีน se -quences ใน Genbank (ตาราง 2) นี้หายืนยันว่า สัดส่วนขนาดใหญ่ของวงดนตรีสร้างขึ้น โดย SRAPs รวม exons ใน ORFs ซึ่งเป็นคาดว่าจะสามารถกระจายไปไหนหมดลำดับแสดงยังที่ SRAP polymor-phism ผลจากสองเหตุการณ์ การเปลี่ยนแปลงขนาดของส่วนเนื่องจากการแทรกและการลบ ซึ่งอาจทำให้ co-เครื่องหมายหลัก และนิวคลีโอไทด์เปลี่ยนไปเครื่องหมายหลักการ ระหว่างการตามลำดับวงเรา เลือกคู่ที่ห้าที่ปรากฏที่จะโดดเด่นร่วมใน เจ (3 รูป) ลำดับของ dem ทั้งวงโดยผู้ปกครอง-ลำดับคล้าย onstrated ที่แตกต่างกัน โดยขนาดเล็กในsertions หรือลบ ความแตกต่างในขนาดสำหรับแต่ละคู่เครื่องหมายร่วมหลักที่ถูกกำหนด โดยลำดับตรงขนาดประมาณบนเจ โดยโยกย้ายส่ง-tance ดังนั้น เครื่องหมายร่วมหลักเกิดจากการเปลี่ยนแปลงขนาดโดยเว็บไซต์รวมทั้งสองไพรเมอร์ ส่วนเหลือหมาย SRAP ตามลำดับได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับข้อมูลเป็นประโยชน์ที่จะอนุญาตให้มีการแปลง
ของที่โดดเด่นเพื่อเครื่องหมายร่วมที่โดดเด่น เพราะส่วนใหญ่
เครื่องหมาย SRAP ผลิตวงดนตรีที่ความเข้มสูงที่ชัดเจนไม่ค่อย
ทับซ้อนกัน (มะเดื่อ. 1, 3) มันเป็นเรื่องง่ายกว่าสำหรับ AFLP mark-
ERS ลำดับความหลากหลายสำหรับพวกเขาโดยการตัดดิ
rectly จากเจล เราแยก 29 วงดนตรีที่ polymorphic
เป็นผลมาจากการขยายของสาย Brassica RI ที่
ใช้รวมกันเจ็ดไพรเมอร์ที่แตกต่างกัน ยี่สิบห้า
ของยี่สิบเกลำดับสามารถอ่านจะเสร็จสมบูรณ์
ในขณะที่สี่วงดนตรีที่สามารถอ่านเพียงบางส่วนและสิ่งเหล่านี้
ไม่ได้ถูกนำมาวิเคราะห์ เราพบว่าเนื้อหา GC 16
(64%) ของลำดับได้มากกว่า 35% ซึ่งบ่งชี้
ว่าพวกเขาอาจจะตกอยู่ใน exons สมมติว่ายีนที่คล้ายกัน
ในโครงสร้าง Brassica และ Arabidopsis (หลิน 1999; Quiros
. et al, 2000) หลังจากการค้นหาระเบิดเราพบว่า 15
(60%) ที่ใช้ร่วมกันความคล้ายคลึงกันอย่างมีนัยสำคัญในการเลือกใช้รายงานยีน
quences เก็บไว้ในฐานข้อมูล Genbank (ตารางที่ 2) นี้
การค้นพบยืนยันว่าเป็นสัดส่วนใหญ่ของวงดนตรี
ที่เกิดจากการรวม SRAPs exons ใน ORFs ซึ่งมีการ
คาดว่าจะมีการกระจายอย่างสม่ำเสมอพร้อมโครโมโซมทั้งหมด.
ลำดับแสดงให้เห็นว่า SRAP polymor-
ผล phism จากสองเหตุการณ์การเปลี่ยนแปลงขนาดชิ้นส่วน
เกิดจากการแทรกและลบ ซึ่งอาจนำไปสู่การร่วมมือกันผนึก
เครื่องหมายที่โดดเด่นและการเปลี่ยนแปลงเบื่อหน่ายที่นำไปสู่
​​เครื่องหมายที่โดดเด่น ในบรรดาวงดนตรีที่ติดใจเรา
เลือกห้าคู่ที่ดูเหมือนจะเป็นร่วมที่โดดเด่นใน
เจล (รูปที่. 3) การเรียงลำดับของทั้งสองวงดนตรีที่ผู้ปกครอง dem-
ลำดับที่คล้ายกัน onstrated ที่แตกต่างกันโดยหเล็ก ๆ เท่านั้น
sertions หรือลบ ความแตกต่างในขนาดสำหรับแต่ละคู่
ของตัวบ่งชี้ที่โดดเด่นร่วมกำหนดโดยลำดับ
การจับคู่ขนาดประมาณเจลโดยการโยกย้ายปรากฏ
ในระยะ ดังนั้นเครื่องหมายร่วมที่โดดเด่นเป็นผลมาจาก
การเปลี่ยนแปลงขนาดคั่นด้วยเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันของทั้งสอง
ไพรเมอร์ ส่วนที่เหลือของเครื่องหมาย SRAP ติดใจอยู่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ข้อมูลที่เป็นประโยชน์ เพื่ออนุญาตให้มีการแปลงลำดับของเด่น co เด่นเครื่องหมาย เพราะมากที่สุดsrap เครื่องหมายผลิตวงชัดเจน ไม่ค่อยสูงซ้อนกัน ( Figs 1 , 3 ) , มันง่ายกว่าสำหรับเอเอฟ - มาร์คERS ดับความหลากหลายสำหรับพวกเขาโดยการตัดตี้rectly ให้จากเจล เราแยก 29 เกิดแถบดีเอ็นเอเป็นผลจากการเพิ่มปริมาณของผักกาดริ เส้นใช้เจ็ดชุดไพรเมอร์ที่แตกต่างกัน ยี่สิบห้าจากยี่สิบเก้าลำดับอาจจะอ่าน เพื่อความสมบูรณ์ส่วนสี่วงอาจจะมีเพียงบางส่วนเท่านั้นที่อ่านเหล่านี้ไม่ได้วิเคราะห์ เราพบว่า GC เนื้อหา 16( 64 ) ของลำดับมากกว่า 35% ซึ่งบ่งชี้ว่าที่พวกเขาอาจตกอยู่ในที่มียีนที่คล้ายกัน สมมุติว่าและโครงสร้างใน Brassica Arabidopsis ( หลิน 1999 ; กิโรสet al . 2000 ) หลังจากระเบิดค้นหา เราพบว่า 15( 60% ) ที่ใช้ร่วมกันอย่างมีนัยสำคัญความคล้ายคลึงกับยีนเซ - รายงานขนาด quences เก็บไว้ในฐานข้อมูล ( ตารางที่ 2 ) นี้การยืนยันว่าสัดส่วนขนาดใหญ่ของวงที่สร้างขึ้นโดย sraps รวมที่มีใน orfs ซึ่งคาดว่าจะกระจายอยู่ทั่วไปบนโครโมโซมลำดับนั้น srap polymor - แสดงผล phism จากสองเหตุการณ์ การเปลี่ยนแปลงขนาดของส่วนและเนื่องจากแทรกลบ , ซึ่งอาจนำไปสู่ Co -เด่นเครื่องหมาย และการเปลี่ยนแปลงที่จะนำนิวคลีโอไทด์เด่นเครื่องหมาย ระหว่างนี้วงเราเลือกห้าคู่ที่ปรากฏอยู่คือ เด่น ในเจล ( รูปที่ 3 ) ลำดับของทั้งสองวงเด็ม - ผู้ปกครองonstrated ดับเหมือนกับที่แตกต่างกันโดยเฉพาะขนาดเล็กในsertions หรือลบ . ความแตกต่างในขนาดของแต่ละคู่บริษัทเด่นเครื่องหมายกำหนดโดยจัดลำดับตรงกับขนาด ผลจากการโยกย้าย - เจลโดยไป . ดังนั้น คือ เด่นเครื่องหมายเป็นผลมาจากขนาดเปลี่ยนล้อมรอบเว็บไซต์ผูกพันของทั้งสองรองพื้น ส่วนที่เหลือของยีน srap เครื่องหมายคือ