A microsatellite-based high-density

A microsatellite-based high-density linkage map for oil palm (Elaeis guinensis Jacq.) was constructed from a cross between two heterozygous parents, a tenera palm from the La Mé population (LM2T) and a dura palm from the Deli population (DA10D). A set of 390 simple sequence repeat (SSR) markers was developed in oil palm from microsatellite-enriched libraries and evaluated for polymorphism along with 21 coconut SSRs. A dense and genome-wide microsatellite framework as well as saturating amplified fragments length polymorphisms (AFLPs) allowed the construction of a linkage map consisting of 255 microsatellites, 688 AFLPs and the locus of the Sh gene, which controls the presence or absence of a shell in the oil palm fruit. An AFLP marker E-Agg/M-CAA132 was mapped at 4.7 cM from the Sh locus. The 944 genetic markers were distributed on 16 linkage groups (LGs) and covered 1,743 cM. Our linkage map is the first in oil palm to have 16 independent linkage groups corresponding to the plant’s 16 homologous chromosome pairs. It is also the only high-density linkage map with as many microsatellite markers in an Arecaceae species and represents an important step towards quantitative trait loci analysis and physical mapping in the E. guineensis species.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มีความหนาแน่นสูงแผนที่เชื่อมโยงไมโครที่ใช้สำหรับปาล์มน้ำมัน (elaeis guinensis Jacq.) ถูกสร้างขึ้นจากการข้ามระหว่างสองพ่อแม่ heterozygous, ปาล์มเทเนอราปาล์มจากประชากรฉันลา (lm2t) และ Dura ปาล์มจากประชากรเดลี่ (da10d) .390 ชุดของการทำซ้ำลำดับง่าย (SSR) เครื่องหมายได้รับการพัฒนาปาล์มน้ำมันจากห้องสมุด microsatellite ที่อุดมด้วยและการประเมินความหลากหลายพร้อมกับ 21 SSRS มะพร้าว กรอบไมโครหนาแน่นและจีโนมทั้งที่เป็นเศษเล็กเศษน้อย saturating ขยายระยะเวลาในความหลากหลาย (aflps) ได้รับอนุญาตการก่อสร้างของการเชื่อมโยงแผนที่ประกอบด้วย 255 ไมโคร,688 aflps และสถานทีของยีนดวลจุดโทษซึ่งควบคุมการมีหรือไม่มีของเปลือกผลไม้ในปาล์มน้ำมัน e-agg/m-caa132 เครื่องหมาย aflp ถูกแมปที่ 4.7 ซม. จากสถานทีดวลจุดโทษ 944 เครื่องหมายทางพันธุกรรมมีการกระจายใน 16 กลุ่มการเชื่อมโยง (LGS) และปกคลุม 1,743 เซนติเมตรแผนที่การเชื่อมโยงของเราเป็นครั้งแรกในปาล์มน้ำมันที่จะมีการเชื่อมโยงทั้ง 16 กลุ่มที่เป็นอิสระที่เกี่ยวข้องกับพืช 16 คู่โครโมโซมคล้ายคลึงกัน ก็ยังเป็นแผนที่เพียงการเชื่อมโยงมีความหนาแน่นสูงที่มีเครื่องหมายไมโครเป็นจำนวนมากในสายพันธุ์ปาล์มและแสดงให้เห็นถึงขั้นตอนสำคัญต่อการวิเคราะห์ลักษณะตำแหน่งเชิงปริมาณและการทำแผนที่ทางกายภาพในอีเมล guineensis ชนิด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แผนที่เชื่อมโยง high-density ตามชนิด microsatellite สำหรับปาล์มน้ำมัน (ปาล์มน้ำมัน guinensis Jacq.) ถูกสร้างขึ้นจากการข้ามระหว่างสองครอบครัว heterozygous ปาล์ม tenera จากประชากร Mé ลา (LM2T) และปาล์มดูร่าจากประชากรเดลี่ (DA10D) ชุด 390 ลำดับซ้ำเครื่องหมาย (SSR) ถูกพัฒนาในปาล์มน้ำมันจากไลบรารีชนิด microsatellite อุดมไป และโพลีมอร์ฟิซึมกับมะพร้าว 21 SSRs ประเมิน กรอบหนา และจีโนมทั้งชนิด microsatellite เป็น saturating ชิ้นส่วนเอาต์ยาว polymorphisms (AFLPs) ได้สร้างแผนที่เชื่อมโยงประกอบด้วย 255 microsatellites 688 AFLPs และโลกัสโพลของยีนดี ซึ่งควบคุมสถานะการของเชลล์ในผลปาล์มน้ำมัน เครื่องหมาย AFLP E-Agg/M-CAA132 ถูกแมปที่ 4.7 ซมจากโลกัสโพล Sh เครื่องหมายพันธุ 944 ได้กระจายกลุ่มเชื่อมโยง 16 (แอลจีเอส) และครอบคลุม 1,743 ซม. แผนที่ของเราเชื่อมโยงเป็นครั้งแรกในน้ำมันปาล์มมี 16 อิสระเชื่อมโยงกลุ่มที่สอดคล้องกับคู่โครโมโซม homologous 16 ของพืช มันเป็นแผนที่เชื่อมโยง high-density เฉพาะ มีเมตตามากในการพันธุ์ปาล์ม และแสดงถึงขั้นตอนสำคัญต่อการวิเคราะห์เชิงปริมาณติด loci และแมปจริงในชนิด E. แสดงออก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แผนที่การเชื่อมโยงแบบความหนาแน่นสูง microsatellite สำหรับน้ำมันปาล์ม( elaeis guinensis jacq .)ได้ถูกสร้างขึ้นจากการข้ามระหว่างสองตัวพ่อแม่ heterozygous Palm tenera จาก La mé ประชากร( LM 2 T )และ Palm dura ที่สดใหม่จากประชากร( da 10 d )ตั้งค่าของ 390 ตามลำดับแบบเรียบง่ายซ้ำ( SSR )ประกบสองตัวได้รับการพัฒนาขึ้นในต้นปาล์มน้ำมันจากไลบรารี microsatellite และประเมินผลเพื่อ polymorphism พร้อมด้วย ssrs. 21 หัวกะทิ ที่มีความหนาแน่นมากและยีน - หลากหลาย microsatellite กรอบและ saturating แอมพลิฟายเศษความยาว polymorphisms ( aflps )ได้รับอนุญาตให้ที่การก่อสร้างการเชื่อมโยงแผนที่ประกอบไปด้วย 255 microsatellites ,688 aflps และ สภาพ ของยีน SH ซึ่งจะควบคุมการทำงานมาร่วมหรือขาดการประชุมของเชลล์ในผลปาล์มน้ำมัน ที่ aflp เครื่องหมาย e - agg / M - CAA 132 ก็ถูกแม็ปกับไคลเอ็นต์ที่ 4.7 ซม.จาก สภาพ SH 944 เครื่องหมายทางพันธุกรรมที่มีการเผยแพร่ในวันที่ 16 กลุ่มการเชื่อมโยง(แอลจี)และแบบมีหลังคา 1,743 ซม.การเชื่อมโยงแผนที่ของเราเป็นคนแรกในต้นปาล์มน้ำมันจะมี 16 กลุ่มเชื่อมโยงเป็นอิสระที่เกี่ยวข้องกับคู่ 16 โครโมโซมซึ่งมีตำแหน่งอย่างเดียวกันของโรงงาน นอกจากนี้ยังเป็นเพียงความหนาแน่นสูงการเชื่อมโยงแผนที่พร้อมด้วยเป็นจำนวนมาก microsatellite markers ใน arecaceae สายพันธุ์และที่สำคัญขั้นตอนทางเชิงปริมาณลักษณะ สภาพ และการวิเคราะห์ทาง กายภาพ การทำแผนที่ใน e . guineensis สายพันธุ์.