2. Materials and methods
2.1. Feeds, fish rearing and samplings
Duplicate groups of juvenile immature rainbow trout, Oncorhynchus mykiss,
(100 fish per tank; initial body weight 139 g) were reared in our experimental fish
farm (INRA, Donzacq, France) at 18 °C under natural photoperiod in spring. Two
experimental diets were formulated and manufactured in our experimental unit as
previously described (Ducasse-Cabanot et al., 2007; Table 1). The diet HL
contained 15.5% fish oil. In the diet LL, no fish oil was added. It was mostly
replaced by fish meal. Fish were hand-fed twice a day at 1.5 and 1.3% of body
weight per day for groups HL and LL, respectively, in order to maintain similar
carbohydrate and protein intake as previously described (Ducasse-Cabanot et al.,
2007; Table 1). Fish were group-weighed each week, to adjust the rations. The
growth trial lasted for 7 weeks. At the end of the growth trial, 12 fish from each
group were randomly sampled and killed by a sharp blow on the head 8 h after
feeding which corresponds to the peak of postprandial nutrient absorption at
18 °C as previously shown (Panserat et al., 2002).
2.2. Selection of individuals highly representative of nutritional groups
Before beginning the hepatic transcriptomic analysis, we selected individuals
which were truly representative of the specific dietary treatment (HL or
LL) to avoid possible inter-individual variability in feed intake between
individuals (Kause et al., 2006a,b). In this context, we selected individuals using
the following procedure: firstly, we used data available for each fish (DucasseCabanot
et al., 2007) which would characterize each dietary group i.e. fish liver
weight, plasma triacyglycerol and free fatty acid levels (Table 2); secondly, we
selected those individuals when they possessed both tested parameters including
inside the mean ± SEM for each variable. Among the 12 sampled fish, we
selected 6 fish per diet. Total hepatic RNAs were extracted from these rainbow
trout using TRIzol® reagent (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA).
2. วัสดุและวิธีการ2.1. ตัวดึงข้อมูล ปลาการเพาะเลี้ยงและ samplingsทำซ้ำกลุ่มเยาวชน immature เรนโบว์เทราต์ mykiss สกุลปลาแซลมอนแปซิฟิก(ปลา 100 ต่อถัง เริ่มต้นน้ำหนัก 139 กรัม) มีผลิตภัณฑ์ในปลาของเราทดลองฟาร์ม (INRA, Donzacq ฝรั่งเศส) ที่ 18 ° C ภายใต้ช่วงแสงธรรมชาติในฤดูใบไม้ผลิ สองทดลองอาหารสูตร และผลิตในหน่วยของเราทดลองเป็นก่อนหน้านี้อธิบาย (Ducasse Cabanot et al., 2007 ตาราง 1) อาหาร HLมีน้ำมันปลา% 15.5 ล้านคน น้ำมันปลาไม่ถูกเพิ่มลงในอาหารจะ มันเป็นส่วนใหญ่แทนที่ ด้วยอาหารปลา ปลาที่เลี้ยงมือสองวันที่ 1.5 และ 1.3% ของร่างกายน้ำหนักต่อวันสำหรับกลุ่ม HL และ LL ตามลำดับ เพื่อรักษาคล้ายกันอธิบายไว้ก่อนหน้านี้เป็น บริโภคคาร์โบไฮเดรตและโปรตีน (Ducasse-Cabanot et al.,2007 ตาราง 1) ปลาได้น้ำหนักกลุ่มแต่ละสัปดาห์ การปรับปรุงได้ ที่ทดลองการเจริญเติบโตกินเวลา 7 สัปดาห์ ที่ปลายเติบโตทดลอง 12 ปลาจากแต่ละกลุ่มโดยการสุ่มตัวอย่าง และฆ่า โดยระเบิดคมบน h 8 หัวหลังจากอาหารซึ่งตรงกับจุดสูงสุดของการดูดซึมธาตุอาหาร postprandial ที่18 ° C เป็นแสดงก่อนหน้านี้ (Panserat et al., 2002)2.2. การเลือกบุคคลตัวแทนของกลุ่มโภชนาการสูงก่อนที่จะเริ่มวิเคราะห์ transcriptomic ตับ เราเลือกบุคคลซึ่งมีตัวแทนอย่างแท้จริงของการรักษาอาหารเฉพาะ (HL หรือLL) เพื่อหลีกเลี่ยงความแปรผันระหว่างแต่ละเป็นไปได้ในการบริโภคอาหารระหว่างบุคคล (Kause et al., 2006a, b) ในบริบทนี้ เราเลือกบุคคลที่ใช้ขั้นตอนต่อไปนี้: ประการแรก เราใช้ข้อมูลสำหรับแต่ละปลา (DucasseCabanotร้อยเอ็ด al., 2007) ซึ่งจะกำหนดลักษณะแต่ละกลุ่มอาหารเช่นปลาตับน้ำหนัก triacyglycerol พลาสม่า และระดับกรดไขมันอิสระ (ตาราง 2); ประการที่สอง เราเลือกบุคคลเหล่านั้นเมื่อพวกเขาต้องมีพารามิเตอร์ทั้งทดสอบรวมทั้งภายในเฉลี่ย± SEM สำหรับแต่ละตัวแปร หมู่ 12 ตัวอย่างปลา เราเลือกปลา 6 ต่ออาหาร RNAs รวมตับถูกสกัดจากเรนโบว์เหล่านี้เทราต์ที่ใช้รีเอเจนต์ TRIzol ® (Invitrogen คาร์ลส CA, USA)
การแปล กรุณารอสักครู่..

2. วัสดุและวิธีการ
2.1 ฟีด, การเลี้ยงปลาและเก็บตัวอย่าง
ซ้ำกลุ่มเรนโบว์เทราท์ที่ยังไม่บรรลุนิติภาวะเด็กและเยาวชน Oncorhynchus mykiss,
(100 ปลาต่อถัง; น้ำหนักตัวเริ่มต้น 139 กรัม) ได้รับการเลี้ยงปลาในการทดลองของเรา
ฟาร์ม (INRA, Donzacq ฝรั่งเศส) ที่ 18 ° C ภายใต้แสงธรรมชาติ ในฤดูใบไม้ผลิ สอง
อาหารทดลองสูตรและผลิตในหน่วยทดลองของเราเป็น
อธิบายไว้ก่อนหน้า (Ducasse-Cabanot et al, 2007. ตารางที่ 1) HL อาหาร
ที่มีน้ำมันปลา 15.5% LL ในอาหารน้ำมันปลาไม่ถูกบันทึก มันเป็นส่วนใหญ่
แทนที่ด้วยปลาป่น ปลามีมือที่เลี้ยงวันละสองครั้งที่ 1.5 และ 1.3% ของ
น้ำหนักต่อวันสำหรับกลุ่ม HL และ LL ตามลำดับเพื่อรักษาคล้าย
คาร์โบไฮเดรตและโปรตีนตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (Ducasse-Cabanot, et al.
2007; ตารางที่ 1 ) ปลากลุ่มชั่งน้ำหนักในแต่ละสัปดาห์เพื่อปรับการปันส่วน
การเจริญเติบโตของการพิจารณาคดีดำเนินไปเป็นเวลา 7 สัปดาห์ ในตอนท้ายของการพิจารณาคดีการเจริญเติบโต 12 ปลาจากแต่ละ
กลุ่มที่ได้รับการสุ่มและถูกฆ่าโดยระเบิดที่คมชัดบนหัว 8 ชั่วโมงหลังจาก
การให้อาหารซึ่งสอดคล้องกับจุดสูงสุดของการดูดซึมสารอาหารภายหลังตอนกลางวันที่
18 องศาเซลเซียสตามที่แสดงไว้ก่อนหน้านี้ (Panserat et al, , 2002).
2.2 การคัดเลือกบุคคลที่เป็นตัวแทนของกลุ่มสูงทางโภชนาการ
ก่อนที่จะเริ่มการวิเคราะห์ transcriptomic ตับเราเลือกบุคคล
ซึ่งเป็นตัวแทนที่แท้จริงของการรักษาที่เฉพาะเจาะจงอาหาร (HL หรือ
LL) เพื่อหลีกเลี่ยงความแปรปรวนระหว่างบุคคลที่เป็นไปได้ในปริมาณอาหารที่กินระหว่าง
บุคคล (Kause et al., 2006a b) ในบริบทนี้เราเลือกบุคคลที่ใช้
ขั้นตอนต่อไป: ประการแรกเราใช้ข้อมูลที่มีอยู่ในแต่ละปลา (DucasseCabanot
ซึ่งจะเป็นลักษณะการบริโภคอาหารแต่ละกลุ่มเช่นตับปลา et al, 2007.)
น้ำหนัก triacyglycerol พลาสมาและระดับกรดไขมันอิสระ (ตารางที่ 2 ); ประการที่สองเรา
เลือกบุคคลเหล่านั้นเมื่อพวกเขามีทั้งพารามิเตอร์รวมทั้งการทดสอบ
ภายในเฉลี่ย± SEM สำหรับแต่ละตัวแปร ในบรรดาปลา 12 ตัวอย่างเรา
เลือก 6 ต่อปลาอาหาร RNAs ตับรวมสกัดจากนี้รุ้ง
ปลาเทราท์โดยใช้น้ำยาTRIzol® (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA)
การแปล กรุณารอสักครู่..

2 . วัสดุและวิธีการ
2.1 . อาหารสัตว์ , การเลี้ยงปลาโดยกลุ่มเยาวชนวัยรุ่น
ซ้ำปลาเรนโบว์เทราท์คอรินชัส mykiss
, , ( 100 ตัว ต่อถัง น้ำหนัก 139 กรัมต่อต้น ) ที่เลี้ยงในฟาร์มปลา
ทดลองของเรา ( ทีมนักวิจัยของ donzacq , ฝรั่งเศส ) ที่ 18 ° C ภายใต้แสงจากธรรมชาติในฤดูใบไม้ผลิ 2
ทดลองสูตรที่ 1 และผลิตในหน่วยทดลองของเรา
อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ( ดูแค ี่ cabanot et al . , 2007 ; ตารางที่ 1 ) อาหาร HL
ที่มีอยู่ 15.5% น้ำมันปลา ในอาหารจะไม่มีน้ำมันปลา คือเพิ่ม มันเป็นส่วนใหญ่
แทนที่ปลาป่น เลี้ยงปลามือสองวัน 1.5 และ 1.3 เปอร์เซ็นต์ ของน้ำหนักตัว ต่อวัน และกลุ่ม hl
ll ตามลำดับ การรักษาที่คล้ายกัน
คาร์โบไฮเดรตและปริมาณโปรตีนตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ( ดูแค ี่ cabanot et al . ,
2007 ;ตารางที่ 1 ) ปลาถูกกลุ่มหนักในแต่ละสัปดาห์เพื่อปรับอาหาร
ตัวอย่างการเจริญเติบโตเป็นเวลา 7 สัปดาห์ เมื่อสิ้นสุดการทดลองของแต่ละกลุ่มจาก 12 ปลา
สุ่มตัวอย่างและฆ่าด้วยระเบิดที่คมชัดบนหัว 8 ชั่วโมงหลังจาก
อาหารซึ่งสอดคล้องกับจุดสูงสุดของการดูดซึมสารอาหารที่ 18 ° C
หลังอาหารที่แสดงก่อนหน้านี้ ( panserat et al . , 2002 ) .
2.2 .การเลือกของบุคคลอย่างมาก ตัวแทนของกลุ่มโภชนาการ
ก่อนที่จะเริ่มต้นการวิเคราะห์ transcriptomic ตับ เราคัดสรรบุคคล
ซึ่งเป็นตัวแทนของการรักษาอย่างแท้จริงอาหารเฉพาะ ( HL หรือ LL
) เพื่อหลีกเลี่ยงความเป็นไปได้ระหว่างบุคคลในการกินอาหารระหว่าง
บุคคล ( kause et al . , 2006a , B ) ในบริบทนี้เราเลือกใช้
บุคคลขั้นตอนดังต่อไปนี้ ประการแรก เราใช้ข้อมูลที่มีอยู่ในปลา ( ducassecabanot
et al . , 2007 ) ซึ่งจะเป็นลักษณะอาหารแต่ละกลุ่ม เช่น น้ำหนักตับ
ปลา triacyglycerol พลาสมาและระดับของกรดไขมันอิสระ ( ตารางที่ 2 ) ; ประการที่สองเรา
เลือกบุคคลเหล่านั้นเมื่อพวกเขามีทั้งทดสอบพารามิเตอร์รวมทั้ง
ภายในหมายถึง ± SEM สำหรับแต่ละตัวแปร ระหว่าง 12 ตัวอย่างปลาเรา
เลือก 6 ตัว ต่ออาหาร สกัดจากตับ RNAs ทั้งหมดเหล่านี้ใช้ trizol รุ้ง
ปลาเทราท์® Reagent ( Invitrogen Carlsbad , CA , USA )
การแปล กรุณารอสักครู่..
