Water quality monitoring techniques

Water quality monitoring techniques that target microorganisms in the order Bacteroidales are potential alternatives to conventional
methods for detection of fecal indicator bacteria. Bacteroidales and members of the genus Bacteroides have been the focus
of microbial source tracking (MST) investigations for discriminating sources of fecal pollution (e.g., human or cattle feces) in
environmental waters. For accurate source apportionment to occur, one needs to understand both the abundance of Bacteroides
in host feces and the survival of these host-associated microbial markers after deposition in the environment. Studies were undertaken
to evaluate the abundance, persistence, and potential for growth of Bacteroidales originating from poultry litter under
oxic and anoxic environmental conditions. Bacteroidales abundance, as determined by quantitative PCR (qPCR) with GenBac
primers and probe, increased 2 to 5 log gene copies ml1 and 2 log gene copies g litter1 under most conditions during incubation
of poultry litter in a variety of laboratory microcosm and field mesocosm studies. DNA sequencing of the Bacteroidales organisms
in the litter identified taxa with sequences corresponding exactly to the GenBac primer and probe sequences and that
were closely related to Bacteroides uniformis, B. ovatus, and B. vulgatus. These results suggest that MST studies using qPCR
methods targeting Bacteroidales in watersheds that are affected by poultry litter should be interpreted cautiously. Growth of
Bacteroidales originating from poultry litter in environmental waters may occur while Bacteroidales growth from other fecal
sources declines, thus confounding the interpretation of MST results.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เทคนิคจุลินทรีย์เป้าหมายลำดับ Bacteroidales ทางเลือกเป็นการทั่วไปการตรวจสอบคุณภาพน้ำวิธีการตรวจหาแบคทีเรียชี้ fecal Bacteroidales และสมาชิกของสกุล Bacteroides ได้รับโฟกัสแหล่งจุลินทรีย์ติดตามสืบสวน (MST) รับการจำแนกแหล่งมลพิษ fecal (เช่น บุคคลหรือวัวอุจจาระ) ในน้ำสิ่งแวดล้อม สำหรับแหล่งที่มาถูกต้องจัดสรรเงินให้เกิดขึ้น ต้องเข้าใจทั้งอุดมสมบูรณ์ Bacteroidesในโฮสต์อุจจาระและความอยู่รอดของเหล่านี้เชื่อมโยงโฮสต์จุลินทรีย์เครื่องหมายหลังจากสะสมในสิ่งแวดล้อม ได้ดำเนินการศึกษาเพื่อประเมินความอุดมสมบูรณ์ มีอยู่ และศักยภาพสำหรับการเจริญเติบโตของ Bacteroidales เกิดจากปีกภายใต้oxic และ anoxic สภาพแวดล้อม อุดมสมบูรณ์ Bacteroidales ที่ PCR เชิงปริมาณ (qPCR) กับ GenBacไพรเมอร์และโพรบ เพิ่ม 2 5 ml1 สำเนายีนล็อกและล็อก 2 ยีนสำเนา g litter1 ภายใต้เงื่อนไขมากที่สุดในระหว่างการบ่มของปีกหลากหลายพิภพในและฟิลด์ mesocosm ศึกษาในห้องปฏิบัติการ ลำดับดีเอ็นเอของสิ่งมีชีวิต Bacteroidalesในแคร่ที่ระบุ taxa มีลำดับที่สอดคล้องกับพื้น GenBac และโพรบลำดับ และที่อย่างใกล้ชิดเกี่ยวข้องกับ Bacteroides uniformis, ovatus เกิด และ vulgatus เกิด ผลลัพธ์เหล่านี้แนะนำที่ใช้ qPCR การศึกษา MSTควรตีความวิธีกำหนดเป้าหมาย Bacteroidales ในรูปธรรมที่ได้ผลจากปีกเดิน เจริญเติบโตของBacteroidales มาจากปีกในน้ำสิ่งแวดล้อมอาจเกิดขึ้นในขณะเจริญเติบโต Bacteroidales จากอื่น ๆ fecalแหล่งปฏิเสธ confounding ตีความผลลัพธ์ MST จึง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เทคนิคการตรวจสอบคุณภาพน้ำที่กำหนดเป้าหมายจุลินทรีย์ใน Bacteroidales เพื่อเป็นทางเลือกที่มีศักยภาพในการชุมนุม
วิธีการตรวจหาเชื้อแบคทีเรียตัวบ่งชี้อุจจาระ Bacteroidales และสมาชิกของแบคทีเรียประเภทได้รับความสนใจ
ของแหล่งที่มาของเชื้อจุลินทรีย์ติดตาม (MST) การตรวจสอบหาแหล่งที่มาของมลพิษแบ่งแยกอุจจาระ (เช่นมนุษย์หรืออุจจาระวัว) ใน
น่านน้ำสิ่งแวดล้อม สำหรับแหล่งที่มาของการแบ่งปันที่ถูกต้องที่จะเกิดขึ้นหนึ่งต้องเข้าใจทั้งความอุดมสมบูรณ์ของแบคทีเรีย
ในอุจจาระโฮสต์และความอยู่รอดของตัวบ่งชี้จุลินทรีย์โฮสต์ที่เกี่ยวข้องเหล่านี้หลังจากที่การสะสมในสิ่งแวดล้อม การศึกษาได้รับการดำเนินการ
ในการประเมินความอุดมสมบูรณ์, การติดตาและศักยภาพในการเจริญเติบโตของ Bacteroidales ที่มาจากครอกสัตว์ปีกภายใต้
ออกซิกและสภาพแวดล้อมซิก ความอุดมสมบูรณ์ Bacteroidales ที่กำหนดโดยวิธี PCR เชิงปริมาณ (qPCR) กับ GenBac
ไพรและสอบสวนเพิ่มขึ้น 2-5 ล็อกสำเนายีน ML1 และ 2 เข้าสู่ระบบยีนสำเนากรัม litter1 ภายใต้เงื่อนไขที่มากที่สุดในช่วงฟักตัว
ของครอกสัตว์ปีกในความหลากหลายของพิภพในห้องปฏิบัติการและภาคสนามการศึกษา mesocosm . ลำดับดีเอ็นเอของสิ่งมีชีวิต Bacteroidales
ในครอกที่ระบุแท็กซ่ากับลำดับที่สอดคล้องตรงกับไพรเมอร์ GenBac และลำดับการสอบสวนและ
มีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับ uniformis แบคทีเรีย B. ovatus และบี vulgatus ผลการศึกษานี้ชี้ให้เห็นว่าการศึกษา MST qPCR ใช้
วิธีการกำหนดเป้าหมาย Bacteroidales ในแหล่งต้นน้ำที่ได้รับผลกระทบจากครอกสัตว์ปีกควรจะตีความด้วยความระมัดระวัง การเจริญเติบโตของ
Bacteroidales ที่มาจากครอกสัตว์ปีกในน่านน้ำด้านสิ่งแวดล้อมที่อาจเกิดขึ้นในขณะที่การเจริญเติบโต Bacteroidales จากอุจจาระอื่น ๆ
ลดลงแหล่งที่มาจึงรบกวนการแปลผล MST

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การตรวจสอบจุลินทรีย์ในเทคนิคที่เป้าหมายเพื่อ bacteroidales เป็นทางเลือกที่มีศักยภาพวิธีการตรวจหาแบคทีเรียโคลิ
ตัวบ่งชี้คุณภาพน้ำ bacteroidales และสมาชิกของสกุล bacteroides ได้โฟกัส
แหล่งจุลินทรีย์ ( MST ) เพื่อจำแนกติดตามสืบสวนแหล่งที่มาของมลพิษอุจจาระ ( เช่นมนุษย์หรืออุจจาระ
โค )น้ำสิ่งแวดล้อม เพื่อความถูกต้องแหล่งกําเนิดเกิดขึ้น หนึ่งความต้องการที่จะเข้าใจทั้งความอุดมสมบูรณ์ของ bacteroides
ในอุจจาระของโฮสต์และการอยู่รอดของจุลินทรีย์เหล่านี้โฮสต์ที่เครื่องหมายหลังจากสะสมในสิ่งแวดล้อม การศึกษาปัญหา
เพื่อประเมินความอุดมสมบูรณ์ , เก็บรักษา และศักยภาพการเติบโตของ bacteroidales ที่มาจากครอกสัตว์ปีกภายใต้
เรียนนอก และสภาพสิ่งแวดล้อม bacteroidales ความอุดมสมบูรณ์ , ตามที่กำหนดโดยวิธีเชิงปริมาณ ( qpcr ) ด้วยไพรเมอร์ genbac
และสอบสวนเพิ่มขึ้น 5 บันทึกสำเนาของ ml1 2 ล็อกยีนชุด G litter1 ภายใต้เงื่อนไขที่สุดในระหว่างการบ่ม
แคร่สัตว์ปีกในความหลากหลายของ mesocosm พิภพห้องปฏิบัติการและเขตการศึกษา การหาลำดับเบสของดีเอ็นเอของสิ่งมีชีวิต bacteroidales
ในครอกและสอดคล้องกับลำดับระบุว่าการ genbac ไพรเมอร์และตรวจสอบลำดับและที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับ bacteroides
) ซึ่ง บี ovatus และพ. vulgatus . ผลลัพธ์เหล่านี้ชี้ให้เห็นว่า MST การศึกษาโดยใช้ qpcr
วิธีการเป้าหมาย bacteroidales ในลุ่มน้ำที่ได้รับผลกระทบจากขยะสัตว์ปีกควรตีความด้วยความระมัดระวัง . การเจริญเติบโตของ
bacteroidales ที่มาจากสัตว์ปีกออกลูกในน้ำสิ่งแวดล้อมที่อาจเกิดขึ้นในขณะที่ bacteroidales การเจริญเติบโตจากแหล่งอื่น )
ลดลง จึงเพิ่มโอกาสเสี่ยงการตีความผล MST .