AbstractBackgroundEscherichia coli

Abstract
Background
Escherichia coli is a model prokaryote, an important pathogen, and a key organism for industrial biotechnology. E. coli W (ATCC 9637), one of four strains designated as safe for laboratory purposes, has not been sequenced. E. coli W is a fast-growing strain and is the only safe strain that can utilize sucrose as a carbon source. Lifecycle analysis has demonstrated that sucrose from sugarcane is a preferred carbon source for industrial bioprocesses.

Results
We have sequenced and annotated the genome of E. coli W. The chromosome is 4,900,968 bp and encodes 4,764 ORFs. Two plasmids, pRK1 (102,536 bp) and pRK2 (5,360 bp), are also present. W has unique features relative to other sequenced laboratory strains (K-12, B and Crooks): it has a larger genome and belongs to phylogroup B1 rather than A. W also grows on a much broader range of carbon sources than does K-12. A genome-scale reconstruction was developed and validated in order to interrogate metabolic properties.

Conclusions

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

นามธรรมพื้นหลัง

Escherichia coli เป็นโปรคารีโอรูปแบบการติดเชื้อที่สำคัญและสิ่งมีชีวิตที่สำคัญสำหรับอุตสาหกรรมเทคโนโลยีชีวภาพ อีเมล coli กว้าง (ATCC 9637) หนึ่งในสี่สายพันธุ์ที่กำหนดว่าปลอดภัยสำหรับการตรวจทางห้องปฏิบัติการยังไม่ได้รับติดใจ อีเมล coli กว้างเป็นสายพันธุ์ที่เติบโตอย่างรวดเร็วและเป็นสายพันธุ์ที่ปลอดภัยเท่านั้นที่สามารถใช้น้ำตาลซูโครสเป็นแหล่งคาร์บอนการวิเคราะห์วงจรชีวิตแสดงให้เห็นว่าน้ำตาลจากอ้อยเป็นแหล่งคาร์บอนที่ต้องการสำหรับกระบวนการทางชีวภาพอุตสาหกรรม.


ผลที่เราได้ติดใจและข้อเขียนจีโนมของ e coli กว้าง โครโมโซมเป็น 4,900,968 bp และ encodes 4764 orfs สองพลาสมิด, prk1 (102,536 bp) และ prk2 (5,360 bp), นอกจากนี้ยังมีในปัจจุบัน กว้างมีคุณสมบัติที่ไม่ซ้ำกันเมื่อเทียบกับสายพันธุ์อื่น ๆ ห้องปฏิบัติการติดใจ (k-12,ขและค) ก็มีจีโนมขนาดใหญ่และเป็น phylogroup b1 มากกว่า กว้างยังเติบโตในช่วงที่กว้างมากของแหล่งคาร์บอนกว่า k-12 ฟื้นฟูจีโนมขนาดได้รับการพัฒนาและตรวจสอบเพื่อสอบปากคำคุณสมบัติการเผาผลาญ.

ข้อสรุป

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

นามธรรม
พื้น
Escherichia coli เป็นโปรคาริโอตรุ่น การศึกษาสำคัญ และสิ่งมีชีวิตที่สำคัญสำหรับอุตสาหกรรมเทคโนโลยีชีวภาพ E. coli W (ATCC 9637), หนึ่งในสี่สายพันธุ์ที่กำหนดว่ามีความปลอดภัยสำหรับห้องปฏิบัติการ ไม่มีการเรียงลำดับ E. coli W จะต้องใช้เพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็ว และเป็นสายพันธุ์เฉพาะเซฟสามารถใช้ซูโครสเป็นแหล่งคาร์บอน การวิเคราะห์วงจรได้สาธิตว่าซูโครสจากอ้อยแหล่งคาร์บอนที่ต้องการสำหรับอุตสาหกรรม bioprocesses

ผล
เราได้เรียงลำดับ และใส่คำอธิบายประกอบจีโนมของ E. coli ปริมาณ โครโมโซมเป็น 4,900,968 bp และจแมป 4,764 ORFs สอง plasmids, pRK1 (102,536 bp) และ pRK2 (5,360 bp), ยังอยู่ W มีลักษณะเฉพาะสัมพันธ์กับสายพันธุ์อื่น ๆ ปฏิบัติตามลำดับ (K-12 B และจาก Crooks): มีกลุ่มใหญ่ และเป็นสมาชิกของ phylogroup B1 มากกว่า A. W ยังขยายบนมากกว้างช่วงของแหล่งคาร์บอนมากกว่า K-12 ไม่ ฟื้นฟูระดับจีโนมพัฒนา และตรวจสอบการไต่สวนคุณสมบัติเผาผลาญ

บทสรุป

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

พื้นหลังและมีเพียงเชื้ออีริคีอาเป็นนามธรรมคือ prokaryote รุ่นที่เชื้อที่สำคัญและสัตว์ปุ่มที่ด้าน เทคโนโลยีชีวภาพ อุตสาหกรรม E .ผล W ( atcc 9637 )หนึ่งในสี่พันธุ์ได้รับมอบหมายให้เป็นผู้ส่งที่ ปลอดภัย สำหรับการตรวจทางห้องปฏิบัติการไม่มีการเรียงซีเควนซ์ E . W ผลเป็นสายพันธุ์กำลังเติบโตอย่างรวดเร็วและเป็นเพียงความเมื่อยล้าตู้นิร ภัย ที่สามารถใช้ซูโครสเป็นแหล่งคาร์บอนที่การวิเคราะห์ตลอดอายุการใช้งานได้แสดงให้เห็นว่าซูโครสจากอ้อยเป็นแหล่งคาร์บอนที่ต้องการสำหรับ bioprocesses อุตสาหกรรม.

ผล
เรามีอักษรเรียงลำดับ\และรับหนังสือจดทะเบียนยีนของผล E . W โครโมโซมคือ 4,900,968 BP และเข้ารหัส 4,764 orfs สอง plasmids prk 1 ( 102,536 BP )และ prk 2 ( 5,360 BP )มีอยู่ด้วย W มีความโดดเด่นที่เป็นเอกลักษณ์เมื่อเทียบกับพันธุ์อื่นในห้องปฏิบัติการอื่นๆ( K - 12 เปิดห้องเรียนB และนักโจรกรรมบนโลกไซเบอร์)มียีนที่มีขนาดใหญ่กว่าและเป็นของ phylogroup B 1 มากกว่า A . W นอกจากนี้ยังเพิ่มขึ้นมากในช่วงที่กว้างของแหล่งคาร์บอนกว่าไม่ K - 12 . สร้างยีนขนาดใหญ่ที่ได้รับการพัฒนาขึ้นและได้รับการตรวจสอบในการสั่งซื้อจะซักถามอาการโรคทางเมตาบอลิซึมคุณสมบัติ( Properties )

ข้อสรุป