3. Results
A total of 762 LAB isolates were recovered and purified from
samples 1 to 9. All isolates were primarily confirmed to belong to the
LAB group as they manifested Gram-positive, no catalase activity, and
positive results for glucose fermentative ability (data not shown). Of
these, only two LAB isolates were recovered from sample 1. One
hundred LAB isolates were recovered each from samples 2 to 8, and 60
LAB isolates were recovered from sample 9 as listed in Table 2.
It was found that the two selected primers were able to amplify the
16S rDNA fragment of each LAB isolate resulting in an amplicon of
approximately 1463 bp in size (data not shown). The two chosen
tetrameric enzymes (either Acc II or Hae III) for restriction digestions
of the amplicons were able to differentiate all 762 LAB isolates into 6
restriction patterns. These patterns, or ARDRA profiles, were assigned
A, B, C, D, E, and F as shown in Fig. 1 and listed in Table 1. Representative
isolates from each profile were analyzed for their 16S rDNA sequences.
Homology searches of the sequences revealed (with 99–100%
homology) that profile A belonged to Lactococcus garvieae, profile B
belonged to Streptococcus bovis, profile C belonged to Weissella cibaria,
profile D belonged to Pediococcus pentosaceus, profile E belonged to
Lactobacillus plantarum, and profile F belonged to Lactobacillus
fermentum. These sequences were deposited into the GenBank
database. Their sequence accession numbers are shown in Table 1.
The frequency of isolation of each species from the 100 isolates taken
at each sample time is listed in Table 2.
Only two isolates of LAB (Lc. garvieae and S. bovis) were recovered
from the raw materials after mixing (sample 1). Subsequently, thirty
3. ผล
รวมเป็น 762 สายพันธุ์ LAB ถูกกู้คืนและบริสุทธิ์จาก
ตัวอย่างที่ 1 ถึง 9 สายพันธุ์ทั้งหมดได้รับการยืนยันเป็นหลักในการเป็นสมาชิกของ
กลุ่ม LAB ที่พวกเขาประจักษ์แกรมบวกไม่มีกิจกรรม catalase และ
ผลในเชิงบวกสำหรับความสามารถในการหมักน้ำตาลกลูโคส (ข้อมูล ไม่แสดง) ของ
เหล่านี้เพียงสองสายพันธุ์ LAB ถูกกู้คืนจากกลุ่มตัวอย่าง 1 หนึ่ง
ร้อยสายพันธุ์ LAB หายจากแต่ละตัวอย่าง 2-8 และ 60
สายพันธุ์ LAB ถูกกู้คืนจากกลุ่มตัวอย่างที่ 9 ตามที่ระบุไว้ในตารางที่ 2
พบว่าทั้งสองไพรเมอร์ที่เลือกได้ สามารถที่จะขยาย
ชิ้นส่วน 16S rDNA ของแต่ละแยก LAB ผลใน amplicon ของ
ประมาณ 1,463 bp ในขนาด (ไม่ได้แสดงข้อมูล) ทั้งสองได้รับการแต่งตั้ง
tetrameric เอนไซม์ (ทั้ง Acc II หรือแฮ III) สำหรับการย่อยข้อ จำกัด
ของ amplicons ก็สามารถที่จะแยกความแตกต่างทั้งหมด 762 LAB ที่แยกออกเป็น 6
รูปแบบการ จำกัด รูปแบบเหล่านี้หรือโปรไฟล์ ARDRA ซึ่งได้รับมอบหมาย
A, B, C, D, E, F และดังแสดงในรูป 1 และแสดงในตารางที่ 1 ตัวแทน
แยกจากแต่ละโปรไฟล์ได้วิเคราะห์หาลำดับ 16S rDNA ของพวกเขา.
ค้นหาคล้ายคลึงกันของลำดับเปิดเผย (มี 99-100%
ที่คล้ายคลึงกัน) รายละเอียดของ A เป็น Lactococcus garvieae โปรไฟล์ B
เป็น Streptococcus bovis โปรไฟล์ C เป็น Weissella cibaria,
รายละเอียด D เป็น Pediococcus pentosaceus โปรไฟล์ E เป็น
Lactobacillus plantarum และรายละเอียด F เป็น Lactobacillus
fermentum ลำดับเหล่านี้มีเงินเข้ามาใน GenBank
ฐานข้อมูล หมายเลขภาคยานุวัติลำดับของพวกเขาจะแสดงในตารางที่ 1.
ความถี่ของการแยกของแต่ละชนิดจาก 100 แยกดำเนินการ
ในแต่ละช่วงเวลาตัวอย่างที่ระบุไว้ในตารางที่ 2
เพียงสองสายพันธุ์ของ LAB (Lc. garvieae และ S. bovis) ได้รับการกู้คืน
จาก วัตถุดิบหลังจากผสม (ตัวอย่าง 1) ต่อมาสามสิบ
การแปล กรุณารอสักครู่..