Wehave presented anew protein–prote

Wehave presented anew protein–proteindocking approach to model heterodimeric structures based on
the conformations of the monomeric units. The conventional modeling method relies on superimposing
two monomeric structures onto the crystal structure of a homologous protein dimer. The resulting
structure may exhibit severe backbone clashes at the dimeric interface depending on the backbone
dissimilarity between the target and template proteins. Our method overcomes the backbone clashing
problem and requires noa prioriknowledge of the dimeric structure of a homologous protein. Here we
used human Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator (CFTR), a chloride channel whose
dysfunction causes cystic fibrosis, for illustration. The two intracellular nucleotide-binding domains
(NBDs) of CFTR control the opening and closing of the channel. Yet, the structure of the CFTR’s NBD1–
NBD2 complex has not been experimentally determined. Thus, correct modeling of this heterodimeric
structure is valuable for understanding CFTR functions and would have potential applications for drug
design for cystic fibrosis treatment. Based on the crystal structure of human CFTR’s NBD1, we
constructed a model of the NBD1–NBD2 complex.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Wehave นำเสนอแบบจำลองโครงสร้าง heterodimeric ตามวิธีนั้นใหม่โปรตีน – proteindocking
conformations หน่วย monomeric นั้น วิธีสร้างโมเดลทั่วไปอาศัย superimposing
โครงสร้าง monomeric สองลงในโครงสร้างผลึกของการผลิตของ dimer homologous โปรตีน งบ
โครงสร้างอาจแสดงแกนหลักอย่างรุนแรงปะทะกันที่อินเทอร์เฟซ dimeric ขึ้นอยู่กับแกนหลัก
dissimilarity ระหว่างโปรตีนเป้าหมายและแม่ วิธีของเรา overcomes แกนหลัก clashing
ปัญหา และต้อง prioriknowledge noa ของโครงสร้าง dimeric ของโปรตีน homologous ที่นี่เรา
ใช้มนุษย์โบรซิ Transmembrane ต้านทานควบคุม (CFTR), คลอไรด์เป็นช่องที่
รซิ ประกอบทำให้ทำ โดเมนนิวคลีโอไทด์ผูก intracellular สอง
(NBDs) ของ CFTR ควบคุมเปิดและปิดของสถานี ยัง โครงสร้างของ NBD1 ของ CFTR –
NBD2 คอมเพล็กซ์ไม่ experimentally ตัดสินได้ ดัง แก้ไขโมเดลนี้ heterodimeric
โครงสร้างจะมีประโยชน์ต่อการทำความเข้าใจเกี่ยวกับฟังก์ชัน CFTR และจะมีโปรแกรมประยุกต์ที่เป็นไปได้สำหรับยา
ออกแบบไฟโบรซิรักษา ตามโครงสร้างผลึกของมนุษย์ CFTR NBD1 เรา
สร้างแบบจำลองของอาคาร NBD1 – NBD2

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

wehave นำเสนอวิธีการใหม่โปรตีน proteindocking แบบโครงสร้าง heterodimeric ตาม
conformations ของหน่วย monomeric วิธีการสร้างแบบจำลองการชุมนุมอาศัยซ้อน
สองโครงสร้าง monomeric บนโครงสร้างผลึกของโปรตีน dimer คล้ายคลึงกัน ส่งผลให้
โครงสร้างอาจมีการปะทะกันอย่างรุนแรงที่กระดูกสันหลังอินเตอร์เฟซ dimeric ขึ้นอยู่กับกระดูกสันหลัง
แตกต่างระหว่างเป้าหมายและแม่โปรตีน วิธีการของเราจะเข้าครอบงำปะทะแกนนำ
ปัญหาและต้อง prioriknowledge อะของโครงสร้าง dimeric ของโปรตีนที่คล้ายคลึงกัน ที่นี่เรา
ใช้มนุษย์เปาะพังผืด Transmembrane สื่อกระแสไฟฟ้า Regulator (CFTR) ช่องคลอไรด์ที่มี
ความผิดปกติที่ทำให้เกิดโรคปอดเรื้อรังเพื่อประกอบการอธิบาย สองเซลล์เบื่อหน่ายปกโดเมน
(NBDs) ของ CFTR ควบคุมการเปิดและปิดของช่อง แต่โครงสร้างของ CFTR ของ NBD1-
NBD2 ซับซ้อนยังไม่ได้รับการพิจารณาการทดลอง ดังนั้นการสร้างแบบจำลองที่ถูกต้องของ heterodimeric นี้
โครงสร้างมีคุณค่าสำหรับฟังก์ชั่นความเข้าใจ CFTR และจะมีการใช้ยาเสพติดที่มีศักยภาพสำหรับ
การออกแบบสำหรับการรักษาเปาะพังผืด ขึ้นอยู่กับโครงสร้างผลึกของ CFTR มนุษย์ NBD1 เรา
สร้างรูปแบบที่ซับซ้อน NBD1-NBD2

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เรานำเสนอแนวทางใหม่สำหรับ proteindocking โปรตีนแบบ heterodimeric โครงสร้างตามโครงสร้างของหน่วยเกิด
. ใช้วิธีอาศัยซ้อน
โครงสร้างเกิดสองลงบนผลึกโครงสร้างของฟังก์ชันโปรตีนไดเมอร์ . ซึ่งอาจมีการปะทะรุนแรง
โครงสร้างกระดูกสันหลังที่ท้องเฟ้ออินเตอร์เฟซขึ้นอยู่กับความกล้า
ความแตกต่างระหว่างเป้าหมายและโปรตีนแม่แบบ วิธีการเอาชนะปัญหา และต้องทนทุกข์ทรมานกระดูกสันหลัง clashing
prioriknowledge ของโครงสร้างท้องเฟ้อของโปรตีนที่คล้ายคลึงกัน . ที่นี่เราใช้หัวมนุษย์
Cystic Fibrosis ระบบ Regulator ( cftr ) , ช่องทางคลอไรด์ที่มี
บกพร่องสาเหตุ cystic fibrosis , ภาพประกอบ สองชนิดผูกโดเมน
เบส( nbds ) ควบคุมการเปิดและปิดของช่อง cftr . แต่โครงสร้างของ cftr nbd1 –
nbd2 ซับซ้อนได้ โดยกำหนด ดังนั้น การแก้ไขนี้ heterodimeric
โครงสร้างมีค่าเพื่อความเข้าใจการทำงาน cftr และจะมีการใช้งานที่มีศักยภาพสำหรับการออกแบบยา
สำหรับ Cystic Fibrosis รักษา บนพื้นฐานของโครงสร้างผลึกของมนุษย์ cftr เป็น nbd1 เรา
การสร้างโมเดลของ nbd1 – nbd2 ซับซ้อน