Species-specific markers of the blu

Species-specific markers of the blue swimming crab (Portunus pelagicus) were developed based on nuclear
DNA (RAPD) and mtDNA (COI and 12S rDNA) polymorphism. Initially, RAPD was carried out across 109
individuals of P. pelagicus originating from different geographic locations in Thai waters using 5 primers
(OPA02, OPA14, OPB10, UBC122 and UBC158) and 5 of 15 candidate species-specific RAPD fragments were
cloned and sequenced. Three RAPD-derived sequence-characterized amplified region (SCAR) markers (PPSCAR152,
PP-SCAR397 and PP-SCAR262) generated the expected product in 95%, 100% and 100% of P. pelagicus
and in all individuals of the three spot swimming crab, P. sanguinolentus (n= 10) but not in the swimming
crab, Charybdis crucifera (n= 20) and mud crabs; Scylla oceanica (n=18), S. serrata, (n=7), S. tranquebarica,
(n=9). SSCP analysis of PP-SCAR397 and PP-SCAR262 could differentiate P. pelagicus and P. sanguinolentus
unambiguously. In addition, COI (706 bp) and 12S rDNA (406 bp) gene segments of P. pelagicus were
amplified and sequenced. Gene-specific primers (PP-COI270-F/R and 12S rDNA312-F/R, respectively) were
designed. PP-COI270 was specifically found in P. pelagicus (n= 174) but not in other non-target species. In
contrast, 12S rDNA312 was successfully amplified in all species (100%). Nevertheless, the SSCP patterns of the
amplified 12S rDNA312 gene segment of each species did not overlap. Authenticating species origin of canned
crab meat was also successfully carried out by PP-COI270 and 12S rDNA312 markers.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สายเครื่องหมายของปูม้า (Portunus pelagicus) พัฒนาขึ้นจากนิวเคลียร์ดีเอ็นเอ (RAPD) และ mtDNA (COI 12S rDNA) แตกต่างกัน เริ่มแรก RAPD ดำเนินข้าม 109บุคคลของ P. pelagicus เกิดจากสถานทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกันในน่านน้ำของไทยโดยใช้ไพรเมอร์ 5(OPA02, OPA14, OPB10, UBC122 และ UBC158) และ 5 15 ผู้สมัครสายเล็ก ๆ RAPDโคลน และเรียงลำดับ เครื่องหมายอาร์เอพีดีที่ได้มาลักษณะลำดับขยายภูมิภาค (แผลเป็น) สาม (PPSCAR152PP-SCAR397 และ PP SCAR262) สร้างผลิตภัณฑ์ที่คาดไว้ใน 95%, 100% และ 100% ของ P. pelagicusและ ในบุคคลทั้งสามจุดว่ายน้ำปู P. sanguinolentus (n = 10) แต่ไม่ใช่ ในการว่ายน้ำปู Charybdis crucifera (n = 20) และโคลนปู ใช้สคิลลา (n = 18), S. ทะเล, (n = 7), S. tranquebarica(n = 9) สามารถแยกวิเคราะห์ SSCP PP SCAR397 และ PP SCAR262 P. pelagicus และ P. sanguinolentusไม่กำกวม นอกจากนี้ COI (706 bp) และ 12S rDNA (406 bp) ส่วนยีนของ P. pelagicus ถูกขยาย และเรียงลำดับ ไพรเมอร์ของยีนเฉพาะ (PP-COI270-F/R และ 12S rDNA312-F/R ตามลำดับ) ได้ออกแบบมา PP COI270 โดยเฉพาะพบใน P. pelagicus (n = 174) แต่ไม่ได้อยู่ ในสายพันธุ์ไม่ใช่เป้าหมายอื่น ๆ ในความคมชัด 12S rDNA312 แก้ไขเรียบร้อยแล้วขยายสายพันธุ์ทั้งหมด (100%) อย่างไรก็ตาม รูปแบบ SSCP ของการส่วนยีน rDNA312 12S ขยายของแต่ละสายพันธุ์ไม่เหลื่อมกัน ตรวจสอบสายพันธุ์กำเนิดของกระป๋องปูเนื้อยังเรียบร้อยดำเนินการ โดยเครื่องหมาย rDNA312 PP COI270 และ 12S

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เครื่องหมายสายพันธุ์ที่เฉพาะเจาะจงของปูม้า (ปูม้า) ได้รับการพัฒนาบนพื้นฐานของนิวเคลียร์
ดีเอ็นเอ (RAPD) และ mtDNA (COI และ 12S rDNA) ความแตกต่าง ตอนแรกอาร์เอพีได้ดำเนินการออกไปทั่ว 109
บุคคลพี pelagicus เกิดจากสถานที่ทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกันในน่านน้ำไทยโดยใช้ไพรเมอร์ 5
(OPA02, OPA14, OPB10, UBC122 และ UBC158) และ 5 ของ 15 ชิ้นส่วนดีเอ็นเอผู้สมัครสายพันธุ์เฉพาะที่ถูก
โคลนและหาลำดับ สามดีเอ็นเอที่ได้มาจากลำดับที่โดดเด่นในภูมิภาคขยาย (SCAR) เครื่องหมาย (PPSCAR152,
PP-SCAR397 และ PP-SCAR262) สร้างผลิตภัณฑ์ที่คาดว่าจะอยู่ใน 95%, 100% และ 100% ของพี pelagicus
และบุคคลทั้งหมดของว่ายน้ำสามจุด ปูพี sanguinolentus (n = 10) แต่ไม่ได้อยู่ในว่ายน้ำ
ปูชาริบดิส crucifera (n = 20) และโคลนปู; สกิลลา Oceanica (n = 18), เอส serrata (n = 7) เอส tranquebarica,
(n = 9) วิเคราะห์ SSCP ของ PP-SCAR397 และ PP-SCAR262 สามารถแยกความแตกต่าง pelagicus พีพี sanguinolentus
อย่างไม่น่าสงสัย นอกจากนี้ COI (706 BP) และ 12S rDNA (406 BP) กลุ่มยีนพี pelagicus ถูก
ขยายและลำดับขั้นตอน ไพรเมอร์ยีนที่เฉพาะเจาะจง (PP-COI270-F / R และ 12S rDNA312-F / R ตามลำดับ) ได้รับการ
ออกแบบ PP-COI270 ถูกพบเฉพาะในพี pelagicus (n = 174) แต่ไม่ได้อยู่ในสปีชีส์ไม่ใช่เป้าหมายอื่น ๆ ใน
ทางตรงกันข้าม 12S rDNA312 ถูกขยายประสบความสำเร็จในทุกชนิด (100%) อย่างไรก็ตามรูปแบบการ SSCP ของ
ส่วนขยายของยีน 12S rDNA312 ของแต่ละสายพันธุ์ที่ไม่ทับซ้อนกัน ตรวจสอบแหล่งที่มาของสายพันธุ์กระป๋อง
เนื้อปูยังได้ดำเนินการเรียบร้อยแล้วออกจาก PP-12S และ COI270 rDNA312 เครื่องหมาย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ชนิดเครื่องหมายเฉพาะของปูม้า ( ปูม้า ) ถูกพัฒนาขึ้นจากนิวเคลียร์DNA ( RAPD ) และแสดง ( ผม และ 12s rDNA ) ) . เริ่มต้น โดยดำเนินการผ่าน 109บุคคลหน้าพื้นที่ที่มาจากต่างทางภูมิศาสตร์ที่ตั้งอยู่ในน่านน้ำไทยโดยใช้ 5 ไพรเมอร์( opa02 opa14 opb10 , , , และ ubc122 ubc158 ) และ 5 15 ผู้สมัครเฉพาะ - ขยายพันธุ์ด้วยเศษคือและตัวนี้ 3 ) ลักษณะของภูมิภาคโดยลำดับ ( แผลเป็น ) ( ppscar152 เครื่องหมาย ,pp-scar397 pp-scar262 ) สร้างและคาดว่าผลิตภัณฑ์ 95% , 100% และ 100% ของพื้นที่หน้าและบุคคลทั้งสามจุดปูม้า , หน้า sanguinolentus ( N = 10 ) แต่ไม่ใช่ในว่ายน้ำปู crucifera คาริบดิส ( n = 20 ) และปูโคลน ; ซิลล่า OCEANICA ( n = 18 ) , S . ใน ( n = 7 ) , tranquebarica s ,( n = 9 ) การวิเคราะห์ยีนของ pp-scar397 pp-scar262 สามารถแยกแยะและพื้นที่หน้า sanguinolentus และ Pอย่างไม่น่าสงสัย . นอกจากนี้ ลำปาง ( 706 BP ) และ 12s rDNA ( 406 BP ) ส่วนของหน้าพื้นที่มียีนและในปัจจุบันนี้ โดยเฉพาะยีน ( pp-coi270-f / R และ 12s rdna312-f / R , ตามลำดับ ) คือออกแบบ pp-coi270 ถูกพบในพื้นที่โดยเฉพาะ P ( n = 100 ) แต่ไม่ใช่เป้าหมายไม่ใช่สายพันธุ์อื่น ๆ ในความคมชัด 12s rdna312 ได้เรียบร้อยแล้วขยายในสายพันธุ์ทั้งหมด ( 100% ) อย่างไรก็ตาม รูปแบบของยีนขยายส่วนของ 12s rdna312 ยีนแต่ละชนิดไม่ทับซ้อนกัน ตรวจสอบสายพันธุ์ต้นกำเนิดของกระป๋องปูยังได้ดำเนินการโดย pp-coi270 12s rdna312 และเครื่องหมาย