Rapid and accurate diagnosis of avi

Rapid and accurate diagnosis of avian influenza virus infections of poultry and humans comprises detection, subtyping, and, in case of subtypes H5 and H7, pathotyping of such viruses. Reliable methods for pathotyping of H5 avian influenza viruses (AIV) are based on determination of the intravenous pathogenicity index (IVPI) in specific pathogen free (SPF) chickens and on characterization of the hemagglutinin (HA) gene cleavage site by sequencing. The number of basic amino acids (arginine and lysine) at the cleavage site is an important indicator of pathogenicity. In this paper, a new rapid method for pathotyping of H5 subtype avian influenza viruses is described which is based on RT-PCR and restriction enzyme cleavage pattern (RECP) assay using the MboII restriction enzyme. Validation of the method using 28 H5 subtype reference isolates from different animal species revealed good performance characteristics regarding sensitivity and specificity, especially when targeting recent highly pathogenic AIV (HPAIV) of subtype H5N1 and Asian origin. In addition, RECP results were validated by testing 47 field samples from different sources and by sequencing of their RT-PCR products. This approach for H5 AIV pathotyping proved to be fast, reliable, and comparatively sensitive and is suitable especially for laboratories lacking sequencing or in vivo pathotyping facilities.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วินิจฉัยอย่างรวดเร็ว และถูกต้องของการติดเชื้อไวรัสไข้หวัดนกสัตว์ปีกและมนุษย์ประกอบด้วยการตรวจจับ ลูกผสม สาม และ ใน กรณี subtypes H5 และ H7, pathotyping ของไวรัสดังกล่าว วิธีที่เชื่อถือได้สำหรับ pathotyping ของไวรัสไข้หวัดนก H5 (AIV) ขึ้นอยู่กับกำหนดดัชนี pathogenicity ทางหลอดเลือดดำ (IVPI) ไก่ (SPF) ฟรีเฉพาะการศึกษา และคุณสมบัติของ hemagglutinin (ฮา) ยีนปริไซต์ โดยลำดับ จำนวนพื้นฐานกรดอะมิโน (อาร์จินีนและไลซีน) ที่ไซต์ปริเป็นตัวบ่งชี้สำคัญ pathogenicity ในเอกสารนี้ อย่างรวดเร็ววิธีใหม่สำหรับ pathotyping ของไวรัสไข้หวัดนกชนิดย่อย H5 ได้อธิบายไว้ซึ่งขึ้นอยู่กับ RT-PCR และใช้เอนไซม์จำกัด MboII วิเคราะห์รูปแบบ (RECP) ของปริเอนไซม์จำกัด ตรวจสอบวิธีการใช้การอ้างอิงชนิดย่อย H5 28 แยกจากสายพันธุ์สัตว์ต่าง ๆ ลักษณะประสิทธิภาพดีเปิดเผยเกี่ยวกับความไวและ specificity โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อกำหนดเป้าหมายล่าสุดอุบัติ AIV (HPAIV) ของชนิดย่อย H5N1 และเอเชียมา นอกจากนี้ ผล RECP ถูกตรวจสอบ โดยทดสอบ 47 ตัวอย่างเขตข้อมูลจากแหล่งต่าง ๆ และจัดลำดับผลิตภัณฑ์ RT-PCR วิธีการนี้สำหรับ H5 AIV pathotyping พิสูจน์ให้รวดเร็ว เชื่อถือ ได้ และดีอย่างหนึ่งที่สำคัญโดยเฉพาะอย่างยิ่งการขาดสิ่ง pathotyping ลำดับเบส หรือสัตว์ทดลองในห้องปฏิบัติการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวินิจฉัยอย่างรวดเร็วและถูกต้องของการติดเชื้อไวรัสไข้หวัดนกสัตว์ปีกและมนุษย์ประกอบด้วยการตรวจสอบ subtyping และในกรณีของเชื้อ H5 และ H7, pathotyping ของไวรัสดังกล่าว วิธีการที่เชื่อถือได้สำหรับ pathotyping ของ H5 ไวรัสไข้หวัดนก (AIV) จะขึ้นอยู่กับการตัดสินใจของดัชนีทำให้เกิดโรคทางหลอดเลือดดำ (IVPI) ในเชื้อโรคฟรี (SPF) ไก่ที่เฉพาะเจาะจงและลักษณะของ hemagglutinin (HA) เว็บไซต์ความแตกแยกยีนโดยลำดับ จำนวนของกรดอะมิโนขั้นพื้นฐาน (อาร์จินีนและไลซีน) ที่เว็บไซต์ความแตกแยกเป็นตัวบ่งชี้ที่สำคัญของการเกิดโรค ในบทความนี้วิธีการที่รวดเร็วใหม่สำหรับ pathotyping ของ H5 ย่อยไวรัสไข้หวัดนกจะอธิบายซึ่งจะขึ้นอยู่กับ RT-PCR และการ จำกัด รูปแบบความแตกแยกเอนไซม์ (RECP) ทดสอบการใช้ข้อ จำกัด เอนไซม์ MboII การตรวจสอบของวิธีการใช้การอ้างอิง H5 28 ชนิดย่อยที่แยกจากสายพันธุ์สัตว์ที่แตกต่างกันพบว่าลักษณะการทำงานที่ดีเกี่ยวกับความไวและความจำเพาะโดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อกำหนดเป้​​าหมายที่ผ่านมาทำให้เกิดโรคสูง AIV (HPAIV) ของ H5N1 ชนิดย่อยและต้นกำเนิดในเอเชีย นอกจากนี้ผลการตรวจสอบได้รับการ RECP โดยการทดสอบ 47 ตัวอย่างเขตข้อมูลจากแหล่งข้อมูลที่แตกต่างกันและโดยการจัดลำดับของผลิตภัณฑ์ RT-PCR ของพวกเขา วิธีการ H5 AIV pathotyping นี้พิสูจน์แล้วว่าเป็นไปอย่างรวดเร็วและเชื่อถือได้และมีความละเอียดอ่อนและมีความได้เปรียบโดยเปรียบเทียบที่เหมาะสมโดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับห้องปฏิบัติการขาดลำดับหรือสิ่งอำนวยความสะดวกใน pathotyping วิฟ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

อย่างรวดเร็วและถูกต้อง การวินิจฉัยการติดเชื้อไวรัสไข้หวัดนกในสัตว์ปีกและมนุษย์ ประกอบด้วย การตรวจสอบ subtyping และในกรณีของชนิดย่อยและ h5 ) pathotyping เช่นไวรัสวิธีการที่เชื่อถือได้สำหรับ pathotyping ของ h5 ไข้หวัดใหญ่ไวรัส ( aiv ) จะขึ้นอยู่กับการกำหนดดัชนีการฉีด ( ivpi ) เฉพาะในปลอดโรค ( SPF ) ไก่ และคุณลักษณะของฮีแมกกูตินิน ( ฮา ) ของเว็บไซต์ โดยตัวของ จำนวนของกรดอะมิโนพื้นฐาน ( อาร์จินีนและไลซีน ) ที่ตัวเว็บไซต์ที่เป็นตัวบ่งชี้สำคัญของการก่อโรค .ในกระดาษนี้เป็นวิธีที่รวดเร็วใหม่สำหรับ pathotyping h5 ชนิดย่อยของไวรัสไข้หวัดนก อธิบาย ซึ่งจะขึ้นอยู่กับวิธีการและรูปแบบเอนไซม์ ( recp ) assay โดยใช้ mboii เอนไซม์ . การตรวจสอบความถูกต้องของวิธีที่ใช้ h5 28 กลุ่มอ้างอิงที่แยกจากสัตว์ชนิดที่แตกต่างกันเปิดเผยดี ลักษณะการดำเนินงานด้านความไวและความจำเพาะโดยเฉพาะเมื่อเป้าหมายล่าสุดสูง aiv ( hpaiv ) ของเชื้อโรคไข้หวัดนกทั้งในเอเชียและประเทศ . นอกจากนี้ ผล recp ถูกตรวจสอบโดยการทดสอบ 47 เขตตัวอย่างจากแหล่งต่าง ๆโดยการจัดลำดับของผลิตภัณฑ์และเทคนิคของพวกเขา วิธีการนี้สำหรับ h5 aiv pathotyping พิสูจน์เป็น รวดเร็ว เชื่อถือได้และการเปรียบเทียบความอ่อนไหวและเหมาะอย่างยิ่งสำหรับห้องปฏิบัติการขาดลำดับหรือโดย pathotyping สิ่งอำนวยความสะดวก