high-quality RNA extremely difficul

high-quality RNA extremely difficult and the gene expression analysis challenging. This study was aimed to improve existing methods for extracting total RNA from Jerusalem artichoke dry seeds and to assess the applicability of the improved method in other plant species. Five RNA extraction methods were evaluated on Jerusalem artichoke seeds and two were modified. One modified method with the significant improvement was applied to assay seeds of diverse Jerusalem artichoke accessions, sunflower, rice, maize, peanut and marigold. The effectiveness of the improved method to extract total RNA from seeds was assessed using qPCR analysis of four selected genes. The improved method of Ma and Yang (2011) yielded a maximum RNA solubility and removed most interfering substances. The improved protocol generated 29 to 41 µg RNA/30 mg fresh weight. An A260/A280 ratio of 1.79 to 2.22 showed their RNA purity. Extracted RNA was effective for downstream applications such as first-stranded cDNA synthesis, cDNA cloning and
OPEN ACCESS
Plants 2013, 2 303
qPCR. The improved method was also effective to extract total RNA from seeds of sunflower, rice, maize and peanut that are rich in polyphenols, lipids and polysaccharides

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

อาร์เอ็นเอมีคุณภาพสูงมากยากและวิเคราะห์ยีนนิพจน์ที่ท้าทาย การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์ เพื่อปรับปรุงวิธีการที่มีอยู่สำหรับแยกอาร์เอ็นเอทั้งหมดจากเมล็ดแห้งแก่น และ เพื่อประเมินความเกี่ยวข้องของของวิธีการปรับปรุงในพืชชนิดอื่น ๆ วิธีสกัดอาร์เอ็นเอห้าถูกประเมินในเมล็ดแก่น และสองถูกปรับเปลี่ยน หนึ่งวิธีการแก้ไข ด้วยการปรับปรุงที่สำคัญใช้ assay เมล็ดหลากหลาย accessions แก่น ทานตะวัน ข้าว ข้าวโพด ถั่วลิสง และดาวเรือง ประสิทธิผลของวิธีการปรับปรุงแยกอาร์เอ็นเอทั้งหมดจากเมล็ดที่ประเมิน qPCR การวิเคราะห์ยีนสี่เลือกใช้ วิธีการปรับปรุงของ Ma และยาง (2011) ผลละลายเป็นอาร์เอ็นเอสูงสุด และเอาสารรบกวนมากที่สุด โพรโทคอลปรับปรุงสร้าง 29-41 ไมโครกรัมเป็นเครื่องอาร์เอ็น เอ/30 มิลลิกรัมต่อน้ำหนักสด อัตราส่วนของ 1.79-2.22 A260/A280 แสดงให้เห็นว่าความบริสุทธิ์ของอาร์เอ็นเอ แยกอาร์เอ็นเอมีประสิทธิภาพสำหรับการใช้งานปลายน้ำเช่นการสังเคราะห์ cDNA ควั่นแรก cDNA โคลน และ
เข้าเปิด
พืช 2013, 2 303
qPCR การ ยังมีวิธีการปรับปรุงประสิทธิภาพสกัดอาร์เอ็นเอทั้งหมดจากเมล็ดทานตะวัน ข้าว ข้าวโพด และถั่วลิสงที่อุดมไปด้วยโพลีฟีน โครงการ และ polysaccharides

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

คุณภาพสูงระดับยากมาก และการแสดงออกของยีนการวิเคราะห์ความท้าทาย การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาวิธีการสกัด RNA จากที่มีอยู่ทั้งหมดแก่นตะวันแห้ง เมล็ดพืช และเพื่อประเมินการประยุกต์ใช้การปรับปรุงวิธีการในพืชชนิดอื่น ๆ ห้าวิธีการสกัด RNA จำนวนเมล็ดอาร์ติโช้คเยรูซาเล็มและทั้งสองถูกแก้ไขแก้ไขวิธีหนึ่งที่มีการปรับปรุงอย่างมีนัยสำคัญจะใช้วิธีหลากหลาย แก่นตะวันสายพันธุ์เมล็ดทานตะวัน ข้าว ข้าวโพด ถั่วลิสง และดาวเรือง ผลของการปรับปรุงวิธีการสกัดอาร์เอ็นเอรวมจากเมล็ดถูกประเมินโดยใช้การวิเคราะห์ qpcr สี่เลือกยีนการปรับปรุงวิธีการของหม่า หยาง ( 2011 ) ให้ค่าการละลายสูงสุดและลบมากที่สุด รบกวน RNA สาร การปรับปรุงโปรโตคอลสร้าง 29 ถึง 41 µ g . / 30 มิลลิกรัมต่อน้ำหนักสด . การ a260 / a280 เท่ากับ 1.79 2.22 ของ RNA มีความบริสุทธิ์ สกัด RNA เป็นที่มีประสิทธิภาพสำหรับการใช้งานต่อเนื่อง เช่น การสังเคราะห์ cDNA cDNA แรกติดโคลนแล้ว

เปิดโรงงาน 2013 , 2 /
qpcr .การปรับปรุงวิธีก็มีประสิทธิภาพเพื่อสกัดอาร์เอ็นเอทั้งหมดจากเมล็ดทานตะวัน ข้าว ข้าวโพด และถั่วที่อุดมไปด้วย โพลีฟีนอล ลิพิด และ พอลิแซ็กคาไรด์