Reflecting the above considerations

Reflecting the above considerations, we have taken a two-stage approach to further development of the hematopoietic cells in the Cell Ontology. In the first stage, which is now complete, we revised current terms and added new terms so that all hematopoietic cell type terms now have textual definitions that contain all the necessary details to define the cells logically. These terms have been directly incorporated into the existing ontology. Fig. 2A shows a typical OBO term stanza for one of these new terms, “induced T-regulatory cell.”

We have also separated the hematopoietic terms from the complex hierarchy of the original CL as much as possible, so that the section of the ontology containing these terms represents a true is_a hierarchy. Fig. 1B shows the simplified hierarchy for the cell type “macrophage.” In restructuring the ontology for the hematopoietic cells, we have eliminated the multiple inheritance via the artifactual high-level terms such as “cell by histology.” “cell by nuclear number,” or “cell by function.” Instead, information about cellular qualities is captured in the textual definitions where it is relevant, and is being used to build logical definitions for the cell types in the second stage of the work, as described below.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สะท้อนให้เห็นถึงการพิจารณาข้างต้น เราได้มาเป็นสองแนวทางการพัฒนาของเซลล์กำเนิดของเม็ดเลือดในภววิทยาเซลล์ ในระยะแรก ซึ่งขณะนี้เสร็จสมบูรณ์แล้ว เราแก้ไขเงื่อนไขปัจจุบัน และเพิ่มเงื่อนไขใหม่เพื่อให้ทุกเซลล์กำเนิดของเม็ดเลือดชนิดเงื่อนไขตอนนี้มีข้อกำหนดข้อความที่ประกอบด้วยรายละเอียดที่จำเป็นทั้งหมดเพื่อกำหนดเซลล์ทางตรรกะ รวมข้อตกลงเหล่านี้เป็นภววิทยาที่มีอยู่โดยตรง Fig. 2A แสดงสแตนซ่าระยะ OBO ทั่วไปหนึ่งข้อตกลงใหม่ "ทำให้เกิดเซลล์ T กำกับดูแล"เราได้แบ่งเงื่อนไขการกำเนิดของเม็ดเลือดจากลำดับชั้นซับซ้อนของ CL เดิมมากที่สุด เพื่อให้ส่วนของภววิทยาที่ประกอบด้วยคำเหล่านี้แสดงถึงลำดับชั้น is_a จริง Fig. 1B แสดงลำดับชั้นอย่างง่ายสำหรับชนิดเซลล์ "macrophage" ในการปรับโครงสร้างภววิทยาสำหรับเซลล์กำเนิดของเม็ดเลือด เรามีตัดออกหลายที่สืบทอดผ่านเงื่อนไขสูง artifactual เช่น "เซลล์โดยมิญชวิทยา" "เซลล์ตามนิวเคลียร์" หรือ "เซลล์ โดยฟังก์ชัน" แทน ข้อมูลเกี่ยวกับโทรศัพท์มือถือคุณภาพถูกจับในข้อกำหนดข้อความที่ไม่เกี่ยวข้อง และถูกใช้ในการสร้างข้อกำหนดตรรกะสำหรับชนิดของเซลล์ในระยะที่สองของงาน เป็นช่อง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สะท้อนให้เห็นถึงการพิจารณาดังกล่าวข้างต้นเราได้นำวิธีการสองขั้นตอนที่จะส่งเสริมการพัฒนาของเซลล์เม็ดเลือดในอภิปรัชญาเซลล์ ในขั้นตอนแรกซึ่งขณะนี้เสร็จแล้วเราปรับปรุงข้อกำหนดในปัจจุบันและเพิ่มเงื่อนไขใหม่เพื่อให้ทุกแง่ชนิดเซลล์เม็ดเลือดในขณะนี้มีความหมายกับใจที่มีรายละเอียดที่จำเป็นทั้งหมดเพื่อกำหนดเซลล์เหตุผล คำเหล่านี้ได้รับการจดทะเบียนโดยตรงในอภิปรัชญาที่มีอยู่ มะเดื่อ 2A แสดงฉันท์ระยะ OBO ทั่วไปสำหรับหนึ่งในเงื่อนไขใหม่เหล่านี้ "เหนี่ยวนำเซลล์ T กำกับดูแล." เราได้แยกออกจากกันนอกจากนี้ยังมีเงื่อนไขเม็ดเลือดจากลำดับชั้นที่ซับซ้อนของเดิม CL มากที่สุดเท่าที่เป็นไปได้เพื่อให้ส่วนของอภิปรัชญาที่มี คำเหล่านี้แสดงให้เห็นถึงลำดับชั้น is_a จริง มะเดื่อ 1B แสดงให้เห็นถึงลำดับชั้นง่ายสำหรับเซลล์ชนิด "macrophage." ในการปรับโครงสร้างอภิปรัชญาสำหรับเซลล์เม็ดเลือดที่เราได้ตัดผ่านมรดกหลายแง่ระดับสูง artifactual เช่น "เซลล์จากเนื้อเยื่อ." "เซลล์โดยจำนวนนิวเคลียร์" หรือ "เซลล์โดยฟังก์ชั่น." แต่ข้อมูลเกี่ยวกับคุณภาพของโทรศัพท์มือถือที่ถูกจับในคำจำกัดความเกี่ยวกับใจที่มันมีความเกี่ยวข้องและจะถูกใช้ในการสร้างคำจำกัดความที่เหมาะสมสำหรับเซลล์ชนิดในขั้นตอนที่สองของการทำงานตามที่อธิบายไว้ด้านล่าง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สะท้อนให้เห็นถึงการพิจารณาข้างต้น เราได้ถ่ายสองแนวทางการพัฒนาต่อไปของเซลล์ ในเซลล์เม็ดโลหิตอภิปรัชญา . ในขั้นตอนแรก ซึ่งตอนนี้เสร็จสมบูรณ์ เราแก้ไขเงื่อนไขและเพิ่มเงื่อนไขใหม่เพื่อให้ทุกเซลล์เม็ดโลหิตชนิดเงื่อนไขขณะนี้มีคำนิยามเดิมที่มีทั้งหมดที่จำเป็นรายละเอียดเพื่อกำหนดเซลล์อย่างมีเหตุผลเงื่อนไขเหล่านี้ได้โดยตรง รวมอยู่ในอภิปรัชญาที่มีอยู่ รูปที่ 2A แสดงให้เห็นโดยทั่วไปในระยะหนึ่งของโอโบ ฉันท์ เงื่อนไขใหม่เหล่านี้ " t - บังคับเหนี่ยวนำเซลล์ "

เรายังแยกเม็ดโลหิตจากเงื่อนไขซับซ้อนลำดับชั้นของเดิม CL มากที่สุด ดังนั้นในส่วนของอภิปรัชญาที่มีเงื่อนไขเหล่านี้แสดงลำดับชั้น is_a จริง ภาพประกอบ1B แสดงแบบลำดับชั้นสำหรับประเภท " เซลล์แมคโครฟาจ " ในการปรับโครงสร้างอภิปรัชญาในเซลล์เม็ดโลหิต เราได้กำจัดมรดกหลายทาง artifactual ระดับสูงเงื่อนไขเช่น " โดยเนื้อเยื่อ เซลล์ " เซลล์โดยนิวเคลียร์หมายเลข " หรือ " เซลล์ ฟังก์ชัน แทนข้อมูลเกี่ยวกับคุณภาพโทรศัพท์มือถือถูกจับใน ข้อความที่เป็นคำนิยามที่เกี่ยวข้องและถูกใช้ในการสร้างความหมายเชิงตรรกะสำหรับเซลล์ในขั้นตอนที่สองของงาน ตามที่อธิบายไว้ด้านล่าง