than 10,000 bases. Sequencing of th

than 10,000 bases. Sequencing of the genomes of Streptomyces coelicolor and S. avermitilis discovered of 22 and 25 putative biosynthetic gene clusters (BGC), respectively, that could code for secondary metabolic pathways. However, genome of the filamentous fungi Aspergillus nidulans harbored greater 56 putative pathways. Typically, biosynthetic gene clusters (BGC) contains all genes required for the biosynthesis of the metabolite, its regulation, resistance and transport. Most of the clusters contain one or several central biosynthesis genes encoding extremely large multidomain, multimodular enzymes belonging to the polyketide synthases (PKSs) or non-ribosomal peptide synthetases (NRPSs) (Fig. 7). The size of metabolic gene clusters varies greatly depending on (1) the complexity of the end product of the pathway gene cluster responsible for biosynthesis of the glycosylated anthracycline nogalamycin encodes 32 enzymes , and (2) the type of biosynthetic machinery, for instance 30-kb thiostrepton gene cluster, synthesized through RiPP pathway or 128-kb daptomycin gene cluster, synthesized through NRPS pathway. Figure 7 The domains of the encoded enzymes are indicated as spheres, with the minimal domains required to form a module of the enzyme shown in red. These enzymes are flanked by a starter ACP transacylase (SAT) domain and a termination domain. The acyltransferase (AT) domain selects extender units to add to the product and transfers them to the acyl-carrier protein (ACP) domain, which loads the units to extend the product. Several types of modification can take place on each product intermediate, as indicated by the various domains that can be present in the enzyme or encoded by other genes in the cluster. Adenylation (A) domain; condensation (C) domain, which catalyses peptide bond formation; dehydratase (DH) domain; epimerization (E) domain; enoyl reductase (ER) domain; β-ketoacyl reductase (KR) domain; ketoacyl synthase (KS) domain, for decarboxylative condensation of the extender unit (usually malonyl-CoA or methylmalonyl-CoA) with an acyl thioester; methyltransferase (MT) domain; a peptidyl carrier protein (PCP) domain (also known as thiolation domain), which binds the cofactor 4′-phosphopantetheine (4′PP), to which the activated amino acid is covalently attached; 4′PP transferase (PPT) domain, which is typically encoded by another gene in the cluster; thioesterase (TE) domain.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มากกว่า 10,000 ฐาน ลำดับของจีโนมของ Streptomyces coelicolor และ S. avermitilis ค้นพบของ
22 และ 25 สมมุติกลุ่มชีวสังเคราะห์ยีน (บีจีซี) ตามลำดับที่อาจสำหรับการเผาผลาญรอง
ทุลักทุเล อย่างไรก็ตามจีโนมของเส้นใยเชื้อรา Aspergillus nidulans เก็บงำมากขึ้น 56 สูตรสมมุติ
โดยปกติกลุ่มชีวสังเคราะห์ยีน (บีจีซี) มียีนทั้งหมดที่จำเป็นสำหรับการสังเคราะห์ของ metabolite ที่ของ
ระเบียบต้านทานและการขนส่ง ส่วนใหญ่ของกลุ่มมีหนึ่งหรือหลายยีนสังเคราะห์กลาง
เข้ารหัส multidomain ขนาดใหญ่มากเอนไซม์ multimodular เป็นของ synthases polyketide (PKSs) หรือ
ไม่ใช่โซมอล synthetases เปปไทด์ (NRPSs) (รูป. 7) ขนาดของกลุ่มยีนการเผาผลาญอาหารแตกต่างกันมาก
ขึ้นอยู่กับ (1) ความซับซ้อนของผลิตภัณฑ์สุดท้ายของกลุ่มยีนเดินรับผิดชอบในการสังเคราะห์ของ
glycosylated anthracycline nogalamycin ถอดรหัส 32 เอนไซม์และ (2) ประเภทของเครื่องจักรชีวสังเคราะห์สำหรับ
อินสแตนซ์ 30 กิโล thiostrepton คลัสเตอร์ยีนสังเคราะห์ผ่าน Ripp ทางเดินหรือ 128 กิโลไบต์ daptomycin คลัสเตอร์ยีน
สังเคราะห์ผ่าน NRPS ทางเดิน
รูปที่ 7 โดเมนของเอนไซม์เข้ารหัสจะถูกระบุเป็นทรงกลมที่มีโดเมนที่น้อยที่สุดที่จำเป็นในการ
รูปแบบโมดูลของเอนไซม์แสดงในสีแดง เอนไซม์เหล่านี้จะถูกขนาบข้างด้วยเริ่มต้น ACP transacylase (SAT)
โดเมนและโดเมนของการเลิกจ้าง acyltransferase (AT) โดเมนเลือกหน่วยขยายที่จะเพิ่มให้กับผลิตภัณฑ์
และการถ่ายโอนไปยังโปรตีน acyl ผู้ให้บริการ (ACP) โดเมนซึ่งโหลดหน่วยที่จะขยายสินค้า หลาย
ประเภทของการปรับเปลี่ยนสามารถใช้สถานที่ในแต่ละผลิตภัณฑ์กลางตามที่ระบุโดยโดเมนต่างๆที่สามารถ
จะอยู่ในเอนไซม์หรือเข้ารหัสโดยยีนอื่น ๆ ในกลุ่ม adenylation (A) โดเมน การควบแน่น (C)
โดเมนซึ่ง catalyses ก่อพันธะเปปไทด์; dehydratase (DH) โดเมน epimerization (E) โดเมน enoyl
reductase (ER) โดเมน β-ketoacyl reductase (KR) โดเมน ketoacyl เทส (KS) โดเมนสำหรับ decarboxylative
ควบแน่นของหน่วยขยาย (โดยปกติ malonyl-CoA หรือ Methylmalonyl-CoA) กับ acyl thioester;
ใบพัด (MT) โดเมน เป็นโปรตีนที่ให้บริการ peptidyl (PCP) โดเมน (ยังเป็นที่รู้จักกันในชื่อโดเมน thiolation) ซึ่ง
ผูกปัจจัย 4'-phosphopantetheine (4'PP) ซึ่งเปิดใช้งานกรดอะมิโนที่แนบมาโควาเลนต์; 4'PP
transferase (PPT) โดเมนซึ่งจะถูกเข้ารหัสโดยยีนอื่นในคลัสเตอร์มักจะ; thioesterase (TE) โดเมน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

กว่า๑๐,๐๐๐ฐาน การจัดลำดับของ genomes ของ Streptomyces coelicolor และ s. avermitilis ถูกค้นพบของ
22และ25คลัสเตอร์ยีนสังเคราะห์ (BGC), ตามลำดับ, ที่สามารถรหัสสำหรับการเผาผลาญรอง
ทางเดิน . อย่างไรก็ตามจีโนมของเชื้อรา Aspergillus nidulans ฮาร์เบื่อมากขึ้น๕๖ทางเดิน.
โดยทั่วไป, กลุ่มยีนสังเคราะห์ชีวภาพ (BGC) ประกอบด้วยยีนทั้งหมดที่จำเป็นสำหรับการสังเคราะห์ของสาร.
ควบคุมความต้านทานและการขนส่ง ส่วนใหญ่ของกลุ่มที่มีหนึ่งหรือหลายยีนสังเคราะห์กลาง
การเข้ารหัสหลายโดเมนขนาดใหญ่มาก, เอนไซม์ multidomain ที่เป็น polyketide synthases (PKSs) หรือ
synthetases เปปไทด์ที่ไม่ใช่ไรโบโซม (NRPSs) (รูปที่ 7) ขนาดของคลัสเตอร์ยีนการเผาผลาญอาหารแตกต่างกันมาก
ขึ้นอยู่กับ (1) ความซับซ้อนของผลิตภัณฑ์ที่สิ้นสุดของยีนทางเดินที่มีความรับผิดชอบสำหรับการสังเคราะห์ทางชีวภาพของ
โควซิน anthracycline nogalamycin เข้ารหัส๓๒เอนไซม์, และ (2) ประเภทของเครื่องจักรชีวสังเคราะห์, สำหรับ
อินสแตนซ์ที่ 30-kb thiostrepton คลัสเตอร์ยีน, สังเคราะห์ผ่านทางเดิน RiPP หรือ๑๒๘-kb daptomycin ยีน,
สังเคราะห์ผ่านทางเดิน NRPS
รูปที่7โดเมนของเอนไซม์ที่เข้ารหัสจะแสดงเป็นทรงกลมโดยมีโดเมนน้อยที่จำเป็นในการ
รูปแบบโมดูลของเอนไซม์ที่แสดงเป็นสีแดง เอนไซม์เหล่านี้จะขนาบข้างด้วยโดยผู้เริ่มต้น ACP transacylase (SAT)
โดเมนและโดเมนการเลิกจ้าง โดเมน acylโอน (AT) เลือกหน่วย extender เพื่อเพิ่มลงในผลิตภัณฑ์
และโอนไปยังโดเมนของผู้ให้บริการ acyl-โปรตีน (ACP) ซึ่งโหลดหน่วยเพื่อขยายผลิตภัณฑ์ หลาย
ประเภทของการปรับเปลี่ยนอาจเกิดขึ้นในแต่ละผลิตภัณฑ์ระดับกลางตามที่ระบุโดยโดเมนต่างๆที่สามารถ
อยู่ในเอนไซม์หรือเข้ารหัสโดยยีนอื่นๆในคลัสเตอร์ การระเหย (A) โดเมน; การควบแน่น (C)
โดเมนซึ่งจะเร่งการก่อตัวของพันธะเปปไทด์ โดเมน (DH); โดเมน epimerization (E); การมี
(ER) โดเมน; โดเมนβ-ketoacyl (KR); โดเมน ketoacyl synthase (KS) สำหรับ decarboxylative
การควบแน่นของหน่วย extender (โดยปกติ malonyl-CoA หรือ methylmalonyl) กับ acyl thioester;
โดเมน methylโอน ase (MT); โดเมน (หรือที่เรียกว่าโดเมน thiolation) ซึ่ง
ผูก cofactor 4 ′-สารเรืองแสง (4 ′ PP) ซึ่งเป็นกรดอะมิโนที่เปิดใช้งานเป็นที่แนบมา; 4′ PP
โอนย้ายโดเมน (PPT) ซึ่งมักจะเข้ารหัสโดยยีนอื่นในคลัสเตอร์; thioesterase (TE) โดเมน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มากกว่าหนึ่งร้อยแสนฐาน การวิเคราะห์ลำดับจีโนมของ Streptomyces Streptomyces cerevisiae และ
มีกลุ่มของยีนที่สันนิษฐานว่า 22and 25 ตามลำดับซึ่งสามารถเข้ารหัสเมแทบอลิซึมทุติยภูมิ
เส้นทาง อย่างไรก็ตามจีโนมของเชื้อรา Aspergillus oryzae มี 56 เส้นทางที่เป็นไปได้
โดยปกติ bgc ประกอบด้วยยีนทั้งหมดที่จำเป็นสำหรับการสังเคราะห์ทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์ที่เผาผลาญ
ปรับลากและการขนส่ง กลุ่มส่วนใหญ่ประกอบด้วยหนึ่งหรือมากกว่าหนึ่งยีนสังเคราะห์กลาง
ขนาดใหญ่หลายโดเมนหรือหลายรูปแบบของเอนไซม์ที่เป็นของ PKS
ที่ไม่ใช่ไรโบโซมเปปไทด์ซินเนส การเปลี่ยนแปลงขนาดใหญ่ในขนาดของกลุ่มยีนเมแทบอลิซึม
ขึ้นอยู่กับความรับผิดชอบ
กลูโคสที่ใช้ในการเข้ารหัสเอนไซม์ชนิดที่สองและชนิดของกลไกทางชีวภาพที่ใช้
ตัวอย่าง 30KB ซัลเฟต Streptomycin ยีนกลุ่มที่สังเคราะห์โดยวิธี Ripp หรือ 128kb Taptomycin กลุ่มยีน
สังเคราะห์โดยวิธี NRPS
โดเมนโครงสร้างของเอนไซม์ที่เข้ารหัสเป็นทรงกลมที่มีความต้องการโครงสร้างน้อยที่สุด
รูปแบบโมดูลเอนไซม์สีแดง ปีกด้านข้างของเอนไซม์เหล่านี้เป็นเริ่มต้น ACP ทรานสเฟอเรส
เขตข้อมูลและการสิ้นสุดของเขตข้อมูล เลือกหน่วยขยายที่คุณต้องการเพิ่มไปยังผลิตภัณฑ์ของคุณ
มันถูกโอนไปยังโดเมนโครงสร้างของ ACP ซึ่งเป็นหน่วยโหลดเพื่อขยายผลิตภัณฑ์ จำนวนเล็กน้อย
ประเภทต่างๆของการปรับเปลี่ยนที่สามารถทำสำหรับแต่ละผลิตภัณฑ์ระดับกลางถ้าเป็นไปได้
ที่มีอยู่ในเอนไซม์หรือเข้ารหัสโดยยีนอื่นๆในกลุ่ม โดเมนโครงสร้างของอะดีโนซีนที่เป็นกรด
โดเมนโครงสร้างของเปปไทด์พันธบัตรที่เร่งปฏิกิริยาโดเมนโครงสร้างของ DH ความแตกต่างของพอลิเมอไรเซชัน
เอ้อโดเมนโครงสร้างของบีตาคีโตซิลรีดักเทสโดเมนโครงสร้างของคีโตซิลเทสที่ใช้ในการดีคาร์บอกซิล
การหดตัวของหน่วยขยายโซ่มักจะได้หรือเมทิลเมทาคริเลตโคและอิลซัลเฟอร์เอสเทอร์
โดเมนโครงสร้างของ MT หรือที่รู้จักกันเป็นซัลเฟอร์โครงสร้างโดเมนของเปปไทด์พาหะโปรตีน
การรวมกันของปัจจัยเสริม 4-p-p-p เปิดใช้งานกรดอะมิโนที่เกี่ยวข้องกับโควาเลนต์ของ
โครงสร้างของ PPT โดเมนมักจะเข้ารหัสด้วยยีนอื่นในกลุ่มโครงสร้างของซัลเฟอร์ esterase โดเมน