DGGE analysis was performed by using the INGENYphorU system
(Ingeny International BV, Goes, The Netherlands). PCR amplicons were
resolved on 8% polyacrylamide gels (37.5:1) in 1× Tris–acetate–EDTA
(TAE) buffer (40 mM Tris–acetate, 20 mM acetic acid, 1 mM EDTA)
with a gradient of 40–60% urea–formamide denaturant (100% denaturant
corresponding to 7 Murea and 40% [v/v] formamide). DGGE gels ran
at 60 °Cwith a constant voltage to reach 1200 V-h. The DGGE gels were
stained with SYBR®Gold Nucleic Acid Gel Stain (Invitrogen, Carlsbad,
CA, USA) in 1× TAE buffer for 10 min and subsequently, visualized
and scanned on the Gel Doc XR System (Bio-Rad laboratories).
การวิเคราะห์ DGGE ได้ดำเนินการโดยใช้ระบบ INGENYphorU
(Ingeny International BV, Goes, เนเธอร์แลนด์) amplicons PCR
ได้รับการแก้ไขในวันที่8% เจลอะคริเลต (37.5: 1) ใน 1 × Tris-acetate-EDTA
(TAE) บัฟเฟอร์ (40 มิลลิ Tris-acetate 20 มิลลิกรดอะซิติก, 1 มิลลิ EDTA)
ที่มีความลาดชัน 40-60% โดย denaturant ยูเรีย formamide (100% denaturant
สอดคล้องกับ 7 Murea และ 40% [v / V] formamide) เจล DGGE
วิ่งที่60 ° Cwith แรงดันคงที่ที่จะไปถึง 1200 Vh เจล DGGE
ถูกย้อมด้วยกรดนิวคลีอิกSYBR®Goldคราบเจล(Invitrogen, Carlsbad,
CA, USA) ใน 1 ×บัฟเฟอร์ TAE เป็นเวลา 10
นาทีและต่อมามองเห็นและสแกนบนเจลหมอXR ระบบ (ห้องปฏิบัติการ Bio-Rad)
การแปล กรุณารอสักครู่..
