The precise form of this potential

The precise form of this potential function is a choice for which there are many options. In particular, different forms for the van der Waals interactions and the dihedrals are in common use and the bonds are often constrained in simulations. However, the form given here is reasonably general, and shows the most important assumptions that are made: only pair-additive interactions are taken into account (non-bonded interactions involving three or more atoms are neglected), atoms are represented as point charges (electronic polarizability is neglected) and simple quadratic forms are used for computational efficiency.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แบบละเอียดของฟังก์ชันนี้อาจเป็นทางเลือกซึ่งมีหลายตัวเลือก โดยเฉพาะ แบบฟอร์มต่าง ๆ สำหรับการโต้ตอบที่ van der Waals และ dihedrals จะร่วมใช้ และพันธบัตรมักจะจำกัดในสถานการณ์จำลอง อย่างไรก็ตาม แบบฟอร์มที่นี่เป็นทั่วไปสม และสมมติฐานที่สำคัญที่สุดที่จะแสดง: เฉพาะการบวกคู่โต้ตอบพิจารณา (เกี่ยวข้องกับอย่าง น้อยสามอะตอมโต้ไม่ถูกผูกมัดเป็นที่ไม่มีกิจกรรม), อะตอมจะแสดงเป็นค่าธรรมเนียมจุด (polarizability อิเล็กทรอนิกส์เป็นที่ไม่มีกิจกรรม) และรูปแบบกำลังสองอย่างจะใช้สำหรับการคำนวณประสิทธิภาพการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รูปแบบที่แม่นยำของฟังก์ชั่นที่มีศักยภาพนี้เป็นทางเลือกที่มีตัวเลือกมากมาย โดยเฉพาะอย่างยิ่งในรูปแบบที่แตกต่างกันสำหรับแวนเดอร์ Waals ปฏิสัมพันธ์และ dihedrals มีการใช้งานร่วมกันและพันธบัตรมักจะมีข้อ จำกัด ในการจำลอง แต่รูปแบบที่ได้รับนี้จะเป็นเหตุผลทั่วไปและแสดงให้เห็นสมมติฐานที่สำคัญที่สุดที่จะทำ: การสื่อสารเพียงคู่สารถูกนำเข้าบัญชี (การสื่อสารที่ไม่ถูกผูกมัดที่เกี่ยวข้องกับสามหรือมากกว่าอะตอมถูกทอดทิ้ง) อะตอมจะแสดงเป็นค่าใช้จ่ายที่จุด ( polarizability อิเล็กทรอนิกส์ถูกทอดทิ้ง) และรูปแบบสมการกำลังสองที่ง่ายจะใช้สำหรับการคำนวณประสิทธิภาพ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แบบฟอร์มที่ชัดเจนของศักยภาพการทำงานนี้เป็นทางเลือกที่มีตัวเลือกมากมาย โดยเฉพาะรูปแบบที่แตกต่างกันสำหรับแวนเดอวาลส์ปฏิสัมพันธ์และ dihedrals ในการใช้งานทั่วไปและพันธบัตรมักจะ จำกัด ในการจำลอง . อย่างไรก็ตาม รูปแบบให้ที่นี่คือเหตุผลทั่วไป การแสดง และสำคัญที่สุด สันนิษฐานว่า สร้าง :เพียงคู่เพิ่มการโต้ตอบจะเข้าบัญชี ( ไม่ผูกพันปฏิสัมพันธ์เกี่ยวข้องกับสามหรือมากกว่าอะตอมจะหลง ) อะตอมจะแสดงเป็นค่าจุด ( polarizability อิเล็กทรอนิกส์ถูกทอดทิ้ง ) และรูปแบบกำลังสองง่ายใช้สำหรับประสิทธิภาพในการคำนวณ