A hierarchical Bayes (HIER) model f

A hierarchical Bayes (HIER) model for the quantitative genetic analysis of performance data was compared to a model based on the use of Henderson's average numerator relationship matrix (ANRM) when some pedigrees are characterized by uncertain paternity. A simulation study consisted of ten datasets characterized by 30% of animals having uncertain paternity for each of two traits: one having moderate heritabilities for direct and maternal genetic effects on weaning weight (WWT) and another having a high heritability for direct genetic effects on post weaning gain (PWG). Posterior inference on the variance components was very similar between the two models. In an application to WWT and PWG data from Brazilian Herefords, posterior inference on variance components was also very similar between ANRM and HIER. Furthermore, rank correlations on posterior means for genetic effects between the two models exceeded 0.90. Nevertheless, large differences in posterior means between these two models were observed for some animals. Furthermore, animals with uncertain paternity had generally larger posterior standard deviations of genetic effects using the HIER model compared to the ANRM model, likely because the HIER model infers upon sire assignment probabilities. Bayesian model choice criteria consistently favored the HIER model over the ANRM model in both simulation and Hereford data analysis studies

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แบบ Bayes (HIER) ลำดับชั้นสำหรับการวิเคราะห์เชิงปริมาณทางพันธุกรรมของข้อมูลประสิทธิภาพการทำงานถูกเมื่อเปรียบเทียบกับแบบจำลองขึ้นใช้เมทริกซ์ความสัมพันธ์เศษเฉลี่ยของ Henderson (ANRM) บางพันธุ์มีลักษณะ paternity แน่ การศึกษาการจำลองประกอบด้วยสิบ datasets โดย 30% ของสัตว์ที่มี paternity แน่สำหรับแต่ละลักษณะที่สอง: หนึ่งมี heritabilities ปานกลางสำหรับการลงรายการบัญชีโดยตรง และแม่พันธุกรรมผล weaning น้ำหนัก (WWT) และอื่นมี heritability สูงสำหรับผลกระทบทางพันธุกรรมโดยตรงบน weaning ได้ (PWG) ข้อหลังบนส่วนประกอบต่างคล้ายกันมากระหว่าง 2 รุ่น ในโปรแกรมประยุกต์ข้อมูล WWT และ PWG จากบราซิล Herefords ข้อหลังบนส่วนประกอบต่างยังคล้ายคลึงระหว่าง ANRM และ HIER นอกจากนี้ ความสัมพันธ์อันดับบนหลังพาหนะสำหรับลักษณะพิเศษทางพันธุกรรมระหว่าง 2 รุ่นเกิน 0.90 อย่างไรก็ตาม ขนาดใหญ่แตกในวิธีหลังรุ่นสองเหล่านี้ถูกสังเกตสำหรับสัตว์บาง นอกจากนี้ สัตว์กับ paternity แน่มีขนาดใหญ่โดยทั่วไปส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐานหลังของลักษณะทางพันธุกรรมที่ใช้รุ่น HIER เมื่อเทียบกับรุ่น ANRM อาจเนื่องจากแบบจำลอง HIER infers เมื่อเดินกำหนดกิจกรรม ทฤษฎีแบบจำลองตัวเลือกเงื่อนไขปลอดรุ่น HIER อย่างสม่ำเสมอกว่าแบบ ANRM ในการจำลองและศึกษาวิเคราะห์ข้อมูลของเฮริฟอร์ด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับชั้นเบส์ (ที่นี่) แบบจำลองสำหรับการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมเชิงปริมาณของข้อมูลประสิทธิภาพเมื่อเทียบกับรูปแบบขึ้นอยู่กับการใช้งานของเฮนเดอร์แมทริกซ์ความสัมพันธ์เศษเฉลี่ย (ANRM) เมื่อ pedigrees บางส่วนที่โดดเด่นด้วยความเป็นพ่อที่ไม่แน่นอน การศึกษาแบบจำลองประกอบด้วยสิบชุดข้อมูลที่โดดเด่นด้วย 30% ของสัตว์ที่มีพ่อแม่ลูกมีความไม่แน่นอนสำหรับแต่ละสองลักษณะหนึ่งที่มีพันธุกรรมในระดับปานกลางสำหรับผลกระทบทางพันธุกรรมโดยตรงและมารดาในหย่านมน้ำหนัก (WWT) และอื่น ๆ ที่มีพันธุกรรมสูงสำหรับผลกระทบทางพันธุกรรมโดยตรงต่อการโพสต์ กำไรหย่านม (PWG) อนุมานหลังกับองค์ประกอบความแปรปรวนเป็นอย่างมากที่คล้ายกันระหว่างทั้งสองรุ่น ในการประยุกต์ใช้ในการ WWT และข้อมูลจาก PWG Herefords บราซิลอนุมานหลังในองค์ประกอบความแปรปรวนก็ยังคล้ายกันมากระหว่าง ANRM และที่นี่ นอกจากนี้ความสัมพันธ์ในตำแหน่งหลังหมายความว่าสำหรับผลกระทบทางพันธุกรรมระหว่างสองรุ่นเกิน 0.90 แต่แตกต่างกันมากในหลังหมายถึงระหว่างทั้งสองรุ่นถูกตั้งข้อสังเกตสำหรับสัตว์บางชนิด นอกจากนี้สัตว์ที่มีพ่อแม่ลูกมีความไม่แน่นอนหลังมีขนาดใหญ่โดยทั่วไปค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของผลกระทบทางพันธุกรรมโดยใช้แบบจำลองที่นี่เมื่อเทียบกับรูปแบบ ANRM, อาจเป็นเพราะรูปแบบที่นี่อ้างถึงเมื่อความน่าจะเป็นพ่อที่ได้รับมอบหมาย เกณฑ์ที่รูปแบบทางเลือกที่ได้รับการสนับสนุนอย่างต่อเนื่องคชกรรมรูปแบบที่นี่มากกว่ารูปแบบ ANRM ทั้งในการจำลองและเฮียศึกษาวิเคราะห์ข้อมูล

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็นแบบเบส์ ( ที่นี่ ) รูปแบบการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมเชิงปริมาณของข้อมูลประสิทธิภาพเมื่อเทียบกับรูปแบบขึ้นอยู่กับการใช้ เฮนเดอร์สันมีเศษความสัมพันธ์เมทริกซ์ ( รถ ) เมื่อบิดาตาย มีลักษณะไม่แน่นอน การจำลองการศึกษา 10 ข้อมูลลักษณะ โดย 30% ของความเป็นสัตว์ที่มีความไม่แน่นอนสำหรับแต่ละสองลักษณะ :หนึ่งที่มีค่าอัตราพันธุกรรมปานกลาง โดยตรง และผลทางพันธุกรรมของน้ำหนักหย่านม ( นั่น ) และอีกมีอัตราสูงสำหรับผลกระทบทางพันธุกรรมโดยตรงในการโพสต์หย่านมได้ ( PWG ) การอนุมานด้านหลังในองค์ประกอบความแปรปรวนที่คล้ายคลึงกันมากระหว่างสองรุ่น ในโปรแกรมนั่น และข้อมูลจาก herefords PWG บราซิล ,การอนุมานขององค์ประกอบความแปรปรวนยังคล้ายกันมากระหว่างรถกับที่นี่ . นอกจากนี้ อันดับ 6 บนหมายถึงหลังผลทางพันธุกรรมระหว่างสองรุ่นเกิน 1 . อย่างไรก็ตาม , ความแตกต่างในวิธีการของทั้งสองรุ่นเป็นสังเกตสำหรับสัตว์บาง นอกจากนี้สัตว์ที่มีความเป็นพ่อที่ไม่แน่นอนมีขนาดใหญ่และส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐานของผลทางพันธุกรรมโดยใช้ที่นี่รุ่นเมื่อเทียบกับรถรุ่น อาจเป็นเพราะที่นี่แบบอนุมาน เมื่อท่านกำหนดความน่าจะเป็น แบบจำลองเบเลือกเกณฑ์อย่าง ชอบที่นี่มากกว่ารถรุ่นทั้งในรูปแบบการจำลองและการวิเคราะห์ข้อมูลการศึกษา


เฮอร์ฟอร์ด