All samples were tested at leastin

All samples were tested at least
in triplicates. A sample was classified as nptII and/or nptIII positive,
if PCR amplification occurred before crossing point (¼Cp) 40. A
single positive replicate was sufficient to classify the sample as
positive. Samples producing only replicates with amplification
curves above Cp  40 were re-extracted. A sample was rated as
nptII and/or nptIII negative only, if the 16S rRNA TaqMan assay was
positive (see Section 2.6) and all nptII/nptIII replicates showed no
amplification in the respective PCR assay. All samples were checked
for inhibition by analyzing 1:5 and 1:25 serial dilutions. Taking into
account a DNA recovery rate from soil of approx. 60% as established
for the PowerSoil procedure (see 2.3) and according to the validation
results of the quantitative PCR assays (see 2.7) the 95%
detection limit for nptII and nptIII was approx. 500e700 copies per
gram soil.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ทดสอบตัวอย่างทั้งหมดน้อยใน triplicates ตัวอย่างถูกจัดเป็น nptII หรือบวก nptIIIปลักเกิดก่อนข้ามจุด (¼Cp) 40 Aจำลองแบบบวกที่เดียวไม่เพียงพอในการจัดประเภทอย่างเป็นบวก ตัวอย่างที่ผลิตเท่านั้นเหมือนกับขยายเส้นโค้งเหนือ Cp 40 แยกอีกครั้งได้ ตัวอย่างที่ได้รับคะแนนเป็นnptII หรือ nptIII เป็นลบเท่านั้น ถ้าการ 16S rRNA TaqMan assay เป็นบวก (ดูส่วน 2.6) และแสดงให้เห็นไม่เหมือนทั้งหมด nptII/nptIIIขยายในทดสอบ PCR ตามลำดับ ตัวอย่างทั้งหมดได้ถูกตรวจสอบสำหรับยับยั้งโดยวิเคราะห์ dilutions อนุกรม 1:5 และ 1:25 ในการบัญชีอัตราการกู้คืนของดีเอ็นเอจากดินประมาณ 60% ได้จัดสำหรับกระบวนการ PowerSoil (ดู 2.3) และการตรวจสอบผลลัพธ์ของ assays PCR การเชิงปริมาณ (ดู 2.7) 95%ตรวจสอบวงเงิน nptII และ nptIII ถูกสำเนาประมาณ 500e700 ต่อกรัมดิน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ตัวอย่างทั้งหมดได้รับการทดสอบอย่างน้อย
ใน triplicates ตัวอย่างถูกจัดเป็น nptII และ / หรือ nptIII บวก
ถ้าขยาย PCR ที่เกิดขึ้นก่อนที่จะจุดข้าม (¼Cp) 40
ซ้ำบวกเดียวก็เพียงพอที่จะจำแนกกลุ่มตัวอย่างที่เป็น
บวก ตัวอย่างการผลิตเพียงการลอกเลียนแบบด้วยการขยาย
เส้นโค้งดังกล่าวข้างต้น Cp? 40 เป็นอีกครั้งที่สกัด ตัวอย่างได้รับการจัดอันดับให้เป็น
nptII และ / หรือ nptIII เชิงลบเท่านั้นถ้าการทดสอบ 16S rRNA TaqMan เป็น
บวก (ดูมาตรา 2.6) และทุก nptII / nptIII ซ้ำพบว่าไม่มี
การขยายในแต่ละ PCR ทดสอบ ตัวอย่างทั้งหมดได้รับการตรวจสอบ
ในการยับยั้งโดยการวิเคราะห์ 1: เจือจางอนุกรม 5 และ 1:25 คำนึงถึง
บัญชีอัตราการฟื้นตัวดีเอ็นเอจากดินประมาณ 60% ที่จัดตั้งขึ้น
สำหรับขั้นตอน PowerSoil (ดู 2.3) และเป็นไปตามการตรวจสอบ
ผลของการตรวจ PCR เชิงปริมาณ (ดู 2.7) 95%
การตรวจสอบวงเงินสำหรับ nptII และ nptIII เป็นประมาณ 500e700 สำเนาต่อ
กรัมของดิน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ตัวอย่างทดสอบอย่างน้อย3 ซ้ำ . ตัวอย่างจัดเป็น nptii และ / หรือ nptiii บวกถ้า PCR ( เกิดก่อนข้ามจุด ( ¼ CP ) 40 เป็นโสดบวกมากเพียงพอที่จะแยกประเภทตัวอย่างบวก ตัวอย่างการผลิตซ้ำกับแบบเท่านั้นเส้นโค้งด้านบน CP 40 อยู่อีกแยก ตัวอย่างคะแนนnptii และ / หรือ nptiii ลบเท่านั้น ถ้าเบส 16S rRNA taqman assay คือบวก ( ดูมาตรา 2.6 ) และ nptii / nptiii ซ้ำพบว่าไม่มีการสื่อสารในวิธี PCR ที่เกี่ยวข้อง ตัวอย่างทั้งหมดจะถูกตรวจสอบยับยั้งโดยการวิเคราะห์อนุกรมเจือจาง 1 : 5 และ 1 : 25 . เข้าบัญชีอัตราการกู้คืน ดีเอ็นเอจากดินประมาณ 60 % เป็นตั้งขึ้นสำหรับขั้นตอน powersoil ( 2.3 ) และจากการตรวจสอบผลของวิธี PCR เชิงปริมาณ ( 2.7 ) 95%ขีดจำกัดสำหรับ nptii nptiii คือประมาณ 500e700 สำเนาต่อและกรัมของดิน