With thousands of genes and dozens

With thousands of genes and dozens of experiments, the immense
amount of biological data produced by microarrays cannot be evaluated
purely by humans. Computer analysis and visualization of this information
is therefore an important area of research. This paper explores effi-
cient algorithms for one step of displaying such data in a way that it can
be analyzed by humans: ordering the genes on the display to best illustrate
trends in gene expression. A general formulation of this unrestricted
problem is computationally intractable (see Section 2.1). A natural alternative
approach, suggested by Eisen et al. [6], is to restrict the orderings
to those illustrating a high-quality hierarchical clustering of the genes
(see Figure 1). In such a diagram one can easily observe both the expression
profiles of similar genes and the clusters formed by the clustering
algorithm. As a consequence, this approach has been used successfully
to analyze many experiments; see for example [1, 14, 17, 21, 22] and many
others.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พันยีนและหลายการทดลอง รองไม่สามารถประเมินข้อมูลชีวภาพที่ผลิต โดย microarraysโดยมนุษย์เพียงอย่างเดียว คอมพิวเตอร์วิเคราะห์และแสดงสถานะของข้อมูลนี้ดังนั้นจึงเป็นพื้นที่สำคัญของการวิจัย กระดาษนี้สำรวจ effi-อัลกอริทึม cient ขั้นตอนหนึ่งของการแสดงข้อมูลดังกล่าวในลักษณะที่สามารถวิเคราะห์ได้ โดยมนุษย์: ลำดับยีนในการแสดงผลเพื่อแสดงส่วนแนวโน้มในการแสดงออกของยีน กำหนดทั่วไปนี้ไม่จำกัดปัญหาเป็น computationally intractable (ดูหัวข้อ 2.1) ทางธรรมชาติวิธี แนะนำโดย Eisen et al. [6], จะจำกัด orderingsผู้แสดงมีคุณภาพลำดับคลัสเตอร์ของยีน(ดูรูปที่ 1) ในไดอะแกรมดังกล่าว หนึ่งสามารถได้ปฏิบัติทั้งสองนิพจน์ของยีนที่คล้ายกันและคลัสเตอร์ที่เกิดขึ้นจากการคลัสเตอร์อัลกอริทึมการ ผล วิธีการนี้มีการใช้เรียบร้อยแล้วการวิเคราะห์การทดลองมากมาย ดูตัวอย่าง [1, 14, 17, 21, 22] และหลายผู้อื่น

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ที่มีมากมายของยีนและนับสิบของการทดลองที่ใหญ่ปริมาณของข้อมูลทางชีวภาพที่ผลิตโดยไมโครอะเรย์ไม่สามารถประเมินได้อย่างหมดจดโดยมนุษย์ การวิเคราะห์คอมพิวเตอร์และการมองเห็นของข้อมูลนี้จึงเป็นพื้นที่สำคัญของการวิจัย กระดาษนี้จะสำรวจที่สุดนั่นคือขั้นตอนวิธีการเพียงพอสำหรับขั้นตอนหนึ่งในการแสดงข้อมูลดังกล่าวในทางที่จะสามารถได้รับการวิเคราะห์โดยมนุษย์: การสั่งซื้อยีนบนจอแสดงผลที่ดีที่สุดที่จะแสดงให้เห็นถึงแนวโน้มในการแสดงออกของยีน สูตรทั่วไปของไม่ จำกัด นี้ปัญหาคือคอมพิวเตอร์ว่ายาก(ดูมาตรา 2.1) ทางเลือกที่เป็นธรรมชาติวิธีที่แนะนำโดย Eisen et al, [6] คือการ จำกัด การ orderings ให้กับผู้ประกอบการที่มีคุณภาพสูงการจัดกลุ่มตามลำดับชั้นของยีน(ดูรูปที่ 1) เช่นในแผนภาพหนึ่งสามารถสังเกตทั้งการแสดงออกโปรไฟล์ของยีนที่คล้ายกันและกลุ่มที่เกิดขึ้นจากการจัดกลุ่มอัลกอริทึม เป็นผลให้วิธีการนี้ถูกนำมาใช้ประสบความสำเร็จในการวิเคราะห์การทดลองหลาย ดูตัวอย่าง [1, 14, 17, 21, 22] และหลายคนอื่นๆ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มีหลายพันของยีนและนับสิบของการทดลอง ปริมาณมหาศาลของข้อมูลทางชีวภาพที่ผลิตโดยการแสดง

ไม่สามารถประเมินได้อย่างหมดจดโดยมนุษย์ คอมพิวเตอร์ การวิเคราะห์และการมองเห็นของข้อมูลนี้
จึงเป็นพื้นที่สำคัญของการวิจัย งานวิจัยนี้พิจารณา effi -
cient ขั้นตอนวิธีสำหรับขั้นตอนหนึ่งของการแสดงข้อมูลดังกล่าวในทางที่จะสามารถ
ถูกวิเคราะห์โดยมนุษย์ :สั่งยีนส์บนจอแสดงผลที่ดีที่สุดสำหรับ
แนวโน้มในการแสดงออกของยีน สูตรทั่วไปของปัญหาไม่จำกัด
นี่ computationally แก่นแก้ว ( ดูมาตรา 2.1 ) ทางเลือก
ธรรมชาติ วิธีการที่แนะนำโดยไอเซ็น et al . [ 6 ] คือการ จำกัด อย่างง่ายที่แสดงลำดับชั้น
ที่มีการจัดกลุ่มของยีน
( ดูรูปที่ 1 )เช่นแผนภาพหนึ่งสามารถสังเกตได้อย่างง่ายดาย ทั้งการแสดงออก
โปรไฟล์ของยีนที่คล้ายกันและกลุ่มที่ก่อตั้งโดยกลุ่ม
ขั้นตอนวิธี อย่างไรก็ดี วิธีการนี้ถูกใช้เรียบร้อยแล้ว
วิเคราะห์การทดลองมากมาย เห็นตัวอย่าง [ 1 , 14 , 17 , 21 , 22 ] และหลายๆ

.