Step 3: Scoring mefhod. Once an ami

Step 3: Scoring mefhod. Once an amino acid sequence
fits the defined mass tolerance, the sequence is evaluated
by using several different criteria. First, the number
(n,) of predicted fragment ions that match ions
observed in the spectrum within + 1 u and their aburdances
(i,) are summed. The continuity of an ion
series is considered by incrementing a component of
the score (p) for each consecutive fragment ion
matched. If an immonium ion for the ammo acids His,
Tyr, Trp, Met, and Phe is present in the spectrum
along with the associated amino acid, then an additional
component of the score ( p) is incremented. If the
amino acid is not present in the sequence, then p is
decreased. The values used for B and p are 0.075 and
0.15, respectively. The total number of predicted sequence
ions is also noted (n,). A score is calculated for
each amino acid sequence by using the relationship

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ขั้นตอนที่ 3: คะแนน mefhod มีกรดอะมิโนลำดับครั้งพอดีกับค่าเผื่อมวลที่กำหนด ลำดับการประเมินโดยใช้เกณฑ์ต่าง ๆ หลายเกณฑ์ ครั้งแรก จำนวน(n,) ของไอออนคาดการณ์ส่วนที่ตรงกับไอออนสังเกตในสเปกตรัมภายใน + 1 คุณและ aburdances ของพวกเขา(i,) จะถูกบวกรวมกัน ไอออนเป็นไปอย่างต่อเนื่องชุดนี้ถือว่าเพิ่มส่วนประกอบของการให้คะแนน (p) สำหรับแต่ละไอออนส่วนติดต่อกันจับคู่ ถ้าไอออนมี immonium สำหรับกรดกระสุนของเขาTyr, Trp, Met และเพอยู่ในสเปกตรัมพร้อมกับกรดอะมิโนเกี่ยวข้อง แล้วเพิ่มเติมส่วนประกอบของการให้คะแนน (p) เพิ่มขึ้น ถ้าการไม่มีกรดอะมิโนในลำดับ แล้วเป็น pลดลง ค่าที่ใช้สำหรับ B และ p มี 0.075 และ0.15 ตามลำดับ จำนวนของลำดับที่คาดการณ์ประจุยังเป็นระบุ (n,) คะแนนคำนวณได้สำหรับแต่ละลำดับกรดอะมิโน โดยใช้ความสัมพันธ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ขั้นตอนที่ 3: การให้คะแนน mefhod เมื่อลำดับกรดอะมิโนที่
เหมาะกับความอดทนมวลกำหนดลำดับการประเมิน
โดยใช้เกณฑ์ที่แตกต่างกัน ครั้งแรกจำนวน
(n) ของชิ้นส่วนที่คาดการณ์ไอออนไอออนที่ตรงกับ
ข้อสังเกตในคลื่นความถี่ภายใน 1 + U และ aburdances ของพวกเขา
(ผม) จะสรุป ความต่อเนื่องของไอออน
ชุดคือการพิจารณาโดยการเพิ่มองค์ประกอบของ
คะแนน (P) สำหรับแต่ละชิ้นส่วนไอออนติดต่อกัน
จับคู่ หากไอออน immonium กรดกระสุนของเขา
เทอร์, Trp พบและเพอยู่ในสเปกตรัม
พร้อมด้วยกรดอะมิโนที่เกี่ยวข้องแล้วเพิ่ม
องค์ประกอบของคะแนน (P) จะเพิ่มขึ้น ถ้า
กรดอะมิโนที่ไม่อยู่ในลำดับแล้ว P จะ
ลดลง ค่าที่ใช้สำหรับ B และ P เป็น 0.075 และ
0.15 ตามลำดับ จำนวนทั้งหมดของการคาดการณ์ลำดับ
ไอออนยังตั้งข้อสังเกต (n) คะแนนจะถูกคำนวณสำหรับ
แต่ละลำดับกรดอะมิโนโดยใช้ความสัมพันธ์