ในเวลาเช้ามืดของวันที่ 19 เมษายน พ.ศ. 2550 เพียงหนึ่งเดือนก่อนการครบรอบการเป็นซูเปอร์จูเนียร์ของกยูฮย็อน กยูฮย็อนกับสมาชิกซูเปอร์จูเนียร์ อีทึก, ชินดง, อึนฮย็อก และผู้จัดการสองคน ได้ถูกนำส่งเข้าโรงพยาบาล เพราะอุบัติเหตุทางรถยนต์ในขณะกำลังกลับจากการอัดรายการวิทยุ ซูเปอร์จูเนียร์ คิส เดอะ เรดิโอ คนขับรถสูญเสียการควบคุมเครื่องยนต์ และรถตู้ก็พลิกคว่ำไปทางด้านขวาของตัวรถ[5] กยูฮย็อน ผู้นั่งอยู่ด้านหลังเบาะคนขับเมื่อเกิดอุบัติเหตุ เขาได้รับบาดเจ็บมากที่สุด มีกระดูกสะโพกแตก ปอดทะลุจากกระดูกซี่โครงที่หัก และรอยถลอกฟกช้ำบนใบหน้า[6][7] เขารู้สึกตัวบ้าง ไม่รู้สึกตัวบ้าง และไม่พูดเลยเนื่องจากอาการช็อค[8][9]เขาถูกช่วยและปฐมพยาบาลทีหลัง เนื่องจากอาการภายนอกโดยรวมแล้วดูไม่สาหัส อีทึก หัวหน้าวงซูเปอร์จูเนียร์เลยได้รับความช่วยเหลือก่อน เพราะมีบาดแผลภายนอกที่เห็นได้อย่างชัดเจนมากกว่า กยูฮย็อนอยู่ห้องไอซียูตลอดตั้งแต่เกิดอุบัติเหตุ แต่หลังจากนั้นหกวันเขาได้ถูกย้ายไปอยู่ในห้องธรรมดาของโรงพยาบาล โดยไม่คาดคิดว่าเขาจะฟื้นตัวได้อย่างรวดเร็ว[10] กยูฮย็อนไม่ต้องใช้เครื่องช่วยหายใจแล้ว[11] ถึงแม้จะกล่าวกันว่า เขาสามารถเดินได้ด้วยตัวเองในหนึ่งเดือนหลังจากเกิดอุบัติเหตุ แต่กยูฮย็อนก็ออกจากโรงพยาบาลเมื่อวันที่ 5 กรกฎาคม พ.ศ. 2550 ซึ่งเป็นเวลาหลังจากนั้น 78 วัน