We took advantage of the availabili

We took advantage of the availability of the M. trunca- tula genome sequence [46] to develop high-density SNP (single nucleotide polymorphism) markers for fine map- ping of the Mt-NS1 locus. SNPs were genotyped either by converting to CAPS (cleaved amplified polymorphic sequences) markers or by direct sequencing. Phenotyp- ing and genotyping a total of 3,900 F2 plants using the SNP markers allowed us to delimit the Mt-NS1 locus be- tween SNP103 and SNP127 (Figure 3B), which span ~50 kb based on the genome sequence of Jemalong A17 (Nod + Fix-). The 50-kb genomic sequence of Jemalong A17 contains at least six predicted genes based on the Medicago truncatula genome release version 4.0 (http://www.jcvi.org/medicago) (Figure 3C).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เราเอาประโยชน์ของการมีอยู่ของม. trunca-tula จีโนมลำดับ [46] ในการพัฒนาเครื่องหมาย (เดียวนิวคลีโอไทด์โพลีมอร์ฟิซึม) SNP high-density ในแผนที่ดีปิงของโลกัสโพล Mt NS1 SNPs genotyped ได้ โดยการแปลงเครื่องหมายหมวก (แหวกเอาต์ polymorphic ลำดับ) หรือ ตามลำดับโดยตรงได้ Phenotyp-ing และ genotyping จำนวน 3900 F2 พืชโดยใช้เครื่องหมายของ SNP ให้เรากำหนดเขตโลกัสโพล Mt NS1 tween จะ SNP103 และ SNP127 (รูปที่ 3B), ซึ่งครอบคลุม ~ 50 kb ตามลำดับกลุ่มของ Jemalong A17 (พยักหน้า + แก้ไข-) ลำดับ genomic 50 kb ของ Jemalong A17 ประกอบด้วยน้อย 6 ยีนคาดการณ์ตาม Medicago truncatula จีโนมรุ่น 4.0 (http://www.jcvi.org/medicago) (รูปที่ 3C)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เราใช้ประโยชน์จากความพร้อมของเอ็ม trunca- Tula ลำดับจีโนม [46] ในการพัฒนา SNP ความหนาแน่นสูง (polymorphism เดี่ยวเบื่อหน่าย) เครื่องหมายสำหรับ ping map- ที่ดีของสถ​​านที่ Mt-NS1 SNPs ถูก genotyped ทั้งโดยการแปลงไปเป็นตัวพิมพ์ใหญ่ (แยกขยายลำดับ polymorphic) เครื่องหมายหรือโดยการจัดลำดับโดยตรง Phenotyp- ไอเอ็นจีและ genotyping ทั้งหมด 3,900 โรง F2 ใช้เครื่องหมาย SNP ให้เราเพื่อกำหนดเขตที Mt-NS1 โดยสลับทวี SNP103 และ SNP127 (รูปที่ 3B) ซึ่งครอบคลุม ~ 50 กิโลขึ้นอยู่กับลำดับจีโนมของ Jemalong A17 (พยักหน้า + Fix-) ลำดับจีโนม 50 กิโลไบต์ของ Jemalong A17 มีอย่างน้อยหกยีนที่คาดการณ์บนพื้นฐานของ Medicago truncatula รุ่นจีโนม 4.0 (http://www.jcvi.org/medicago) (รูปที่ 3 C)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เราเอาประโยชน์จากความพร้อมของ trunca - ตุลาจีโนมลำดับ [ 46 ] เพื่อพัฒนาความหนาแน่นสูง ( SNP ) ซิงเกิลนิวคลีโอไทด์ ) เครื่องหมายสำหรับแผนที่ค่ะ ปิงของ mt-ns1 ความเชื่อ . snps เป็น genotyped โดยการแปลงไปเป็นหมวก ( ของ amplified polymorphic ลำดับ ) เครื่องหมายหรือโดยการโดยตรง phenotyp - ing และการอ่านทั้งหมดของ 3900 F2 พืชที่ใช้ SNP เครื่องหมายอนุญาตให้เราจำกัดจำนวนการ mt-ns1 ความเชื่อและเป็น snp103 ทวี snp127 ( รูปที่ 3B ) ซึ่งช่วง ~ 50 KB ตามลำดับจีโนมของ jemalong A17 ( การแก้ไข ) 50 KB จีโนมลำดับ jemalong A17 มีอย่างน้อยหกทำนายยีนตาม MEDICAGO truncatula จีโนมปล่อยเวอร์ชั่น 4.0 ( http://www.jcvi.org/medicago ) ( รูปที่ 3 )