DNAsequence manipulations were perf

DNA
sequence manipulations were performed using the SeqApp program,
version 1.9a169 [22], and phylogenetic analyses were implemented
through PHYLIP 5.57 [23]. Distance matrix analyses were according
to the method of Jukes and Cantor [24] with a masking function to
exclude ambiguous data, and phylogenetic tree construction was by
neighbour joining [25]. Phylogenetic analysis was performed for 287
positions which could be unambiguously aligned for all sequences used
in the analysis. Bootstrapping was conducted with 100 replicates using
the program SeqBoot [23]. Bootstrap supports for the sequence clusters
were similar to those found previously [17]. Recovered sequences were
also tested for homology to known sequences in the EMBL databank
using the FastA program [26]. Bands whose nucleotide sequences were
determined have been given labels in Figures 2 and 3 which correspond
to the sequence names beginning with a `B’ in Figure 1. The addition of
an asterisk to a band label (Figures 2 and 3) indicates a difference of one
base pair from the given numbered sequence. These differences have
been shown to be introduced at the ambiguous position of the reverse
primer by PCR [18] and have not been included in the phylogenetic
analysis.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ดีเอ็นเอกิจวัตรลำดับได้ดำเนินการโดยใช้โปรแกรม SeqApp, รุ่น 1.9a169 [22], และการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการถูกนำมาใช้ผ่านPHYLIP 5.57 [23] การวิเคราะห์เมทริกซ์ระยะทางเป็นไปตามวิธีการของจุกส์และคันทอร์ [24] ด้วยฟังก์ชั่นการหลอกลวงจะไม่รวมข้อมูลที่ไม่ชัดเจนและการก่อสร้างต้นไม้สายวิวัฒนาการโดยเพื่อนบ้านมาร่วมงาน[25] การวิเคราะห์วิวัฒนาการได้ดำเนินการ 287 ตำแหน่งซึ่งอาจจะสอดคล้องอย่างไม่น่าสงสัยสำหรับลำดับทั้งหมดที่ใช้ในการวิเคราะห์ ร่วมมือได้ดำเนินการกับ 100 ซ้ำโดยใช้โปรแกรมSeqBoot [23] สนับสนุนเงินทุนสำหรับกลุ่มลำดับมีความคล้ายคลึงกับที่พบก่อนหน้านี้ [17] ลำดับที่กู้คืนได้รับการทดสอบที่คล้ายคลึงกันสำหรับลำดับที่รู้จักกันในคลังข้อมูล EMBL ใช้โปรแกรม FASTA [26] วงดนตรีที่มีลำดับเบสถูกกำหนดได้รับฉลากในรูปที่ 2 และ 3 ซึ่งสอดคล้องกับชื่อลำดับเริ่มต้นด้วย'B' ในรูปที่ 1 นอกเหนือจากเครื่องหมายฉลากวงหนึ่ง(2 รูปที่ 3) แสดงให้เห็นความแตกต่างของ หนึ่งในฐานคู่จากลำดับหมายเลขที่กำหนด ความแตกต่างเหล่านี้ได้รับการแสดงที่ได้รับการแนะนำในตำแหน่งที่ไม่ชัดเจนของกลับไพรเมอร์โดยวิธีPCR [18] และยังไม่ได้รับการรวมอยู่ในสายวิวัฒนาการการวิเคราะห์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

manipulations ลำดับดีเอ็นเอ
) มีการใช้โปรแกรม seqapp
, รุ่น 1.9a169 [ 22 ] และการวิเคราะห์ phylogenetic ดำเนินผ่าน phylip
7 [ 23 ] การวิเคราะห์เมทริกซ์ระยะทางได้ตามวิธีการจูกส์
5 [ 24 ] และด้วยกาวหน้าที่

รวมข้อมูลคลุมเครือและสร้าง phylogenetic ต้นไม้โดย
เพื่อนบ้านร่วม [ 25 ] การวิเคราะห์ phylogenetic แสดงสำหรับ 287
ตำแหน่งซึ่งอาจจะชิดกันทุกลําดับที่ใช้
ในการวิเคราะห์ bootstrapping จำนวน 100 แบบ โดยใช้โปรแกรม seqboot
[ 23 ] บูทสนับสนุนสำหรับลำดับกลุ่ม
มีความคล้ายคลึงกับที่พบก่อนหน้านี้ [ 17 ] กู้คืนเป็นลำดับ
ยังทดสอบที่มีลำดับเป็นที่รู้จักในสัตว databank
ใช้โปรแกรม fasta [ 26 ]วงดนตรีที่มีลำดับเบสเป็น
กำหนดได้รับป้ายในรูปที่ 2 และ 3 ซึ่งสอดคล้องกับลำดับชื่อขึ้นต้นด้วย
' B ' ในรูปที่ 1 โดย
เครื่องหมายดอกจันเพื่อวงป้าย ( ร่าง 2 และ 3 ) พบว่ามีความแตกต่างของหนึ่ง
คู่ฐานจากระบุหมายเลขลำดับ ความแตกต่างเหล่านี้มี
ถูกแสดงเป็นแนะนำที่ตำแหน่งที่คลุมเครือของย้อนกลับ
โดย PCR ไพรเมอร์ [ 18 ] และยังไม่ได้ถูกรวมอยู่ในการวิเคราะห์ phylogenetic