Background and Aims The juvenile to

Background and Aims The juvenile to adult transition (JAT) in higher plants is required for them to reach reproductive competence. However, it is a poorly understood process in woody plants, where only a few genes have been definitely identified as being involved in this transition. This work aims at increasing our understanding of the mechanisms regulating the JAT in citrus.

Methods Juvenile and adult plants from Pineapple sweet orange (Citrus sinensis) and Rough lemon (C. jambhiri) were used to screen for differentially expressed transcription factors (TFs) using a 1·15K microarray developed on the basis of the CitrusTF database. Murcott tangor (C. reticulata × C. sinensis) and Duncan grapefruit (C. paradisi) were incorporated into the quantitative real-time reverse transcription–PCR validation in order to select those genes whose phase-specific regulation was common to the four species.

Key Results A browsable web database has been created with information about the structural and functional annotation related to 1152 unigenes of putative citrus TFs (CTFs). This database constitutes a valuable resource for research on transcriptional regulation and comparative genomics. Moreover, a microarray has been developed and used that contains these putative CTFs, in order to identify eight genes that showed differential expression in juvenile and adult meristems of four different species of citrus. Those genes have been characterized, and their expression pattern in vegetative and reproductive tissues has been analysed. Four of them are MADS-box genes, a family of TFs involved in developmental processes, whereas another one resembles MADS-box genes but lacks the MADS box itself. The other three showed high partial sequence similarity restricted to specific Arabidopsis protein domains but negligible outside those domains.

Conclusions The work presented here indicates that the JAT in citrus could be controlled by mechanisms that are in part common to those of Arabidopsis, but also somehow different, since specific factors without Arabidopsis orthologues have also been characterized. The potential involvement of the genes in the JAT is discussed.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พื้นหลังและมีจุดมุ่งหมายเยาวชนให้ผู้ใหญ่เปลี่ยน (JAT) ในพืชที่สูงเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการเข้าถึงความรู้ความสามารถสืบพันธุ์ อย่างไรก็ตาม มันเป็นกระบวนการความเข้าใจที่ดีในไม้ยืนต้น ซึ่งเพียงไม่กี่ยีนมีแน่นอนระบุเป็นการเกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงนี้ งานนี้มีเป้าหมายที่เพิ่มความเข้าใจกลไกการควบคุม JAT ในส้มวิธีที่โรงงานเยาวชน และผู้ใหญ่จากสับปะรดหวานส้ม (Citrus sinensis) และหยาบมะนาว (C. jambhiri) เป็นหน้าจอสำหรับ differentially แสดงปัจจัยการถอดรหัส (TFs) ใช้ microarray 1·15K ที่พัฒนาบนพื้นฐานของฐานข้อมูล CitrusTF ส้มแก้ว Murcott (C. พบ× C. sinensis) และส้มโอดันแคน (C. paradisi) ถูกรวมในการตรวจสอบเชิงปริมาณแบบเรียลไทม์กลับถอด – PCR เพื่อเลือกยีนนั้นกฎระเบียบขั้นตอนเฉพาะที่มีทั่วไปสี่สายพันธุ์ผลลัพธ์สำคัญที่มีการสร้างฐานข้อมูลเว็บสามารถเรียกดูได้ข้อมูลเกี่ยวกับคำอธิบายโครงสร้าง และการทำงานที่เกี่ยวข้องกับ 1152 unigenes ของอ้างว่าฝาส้มต้า (CTFs) ฐานข้อมูลนี้ถือเป็นทรัพยากรมีคุณค่าสำหรับวิจัยระเบียบ transcriptional และ genomics เปรียบเทียบ นอกจากนี้ microarray ได้รับการพัฒนา และใช้ที่ประกอบด้วย CTFs เหล่านี้อ้างว่าฝา เพื่อระบุยีนแปดที่แสดงแสดงส่วนต่างในเยาวชน และผู้ใหญ่ meristems สี่พันธุ์ส้ม ยีนเหล่านั้นได้ถูกลักษณะ และมีการวิเคราะห์รูปแบบนิพจน์ในเนื้อเยื่อของพืช และการเจริญพันธุ์ สี่ของพวกเขามียีนกล่อง MADS ครอบครัวของ TFs ที่เกี่ยวข้องในกระบวนการพัฒนา ขณะที่อีกหนึ่งคล้ายกับยีน MADS กล่อง แต่ขาดกล่อง MADS เอง อื่น ๆ ที่สามแสดงลำดับบางส่วนสูงคล้ายจำกัดโดเมนเฉพาะ Arabidopsis โปรตีน แต่เล็กน้อยภายนอกโดเมนเหล่านั้นบทสรุปของงานนำเสนอที่นี่บ่งชี้ว่า JAT ในส้มสามารถถูกควบคุม โดยกลไกที่ใช้กันทั่วไปในส่วนของ Arabidopsis แต่ยังอื่นอย่างใด ตั้งแต่ปัจจัยเฉพาะโดย Arabidopsis orthologues ได้ยังถูกลักษณะ มีการกล่าวถึงการมีส่วนร่วมศักยภาพของยีนใน JAT

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ประวัติความเป็นมาและมีเป้าหมายที่เด็กและเยาวชนเพื่อการเปลี่ยนแปลงสำหรับผู้ใหญ่ (JAT) ในพืชที่สูงขึ้นเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับพวกเขาไปถึงความสามารถในการสืบพันธุ์ แต่มันเป็นกระบวนการที่เข้าใจได้ไม่ดีในไม้ยืนต้นที่มีเพียงไม่กี่ยีนได้รับการระบุแน่นอนกับการมีส่วนร่วมในการเปลี่ยนแปลงนี้ งานนี้มีจุดมุ่งหมายที่เพิ่มความเข้าใจในกลไกที่ควบคุม JAT ในส้มของเรา. วิธีเยาวชนและผู้ใหญ่พืชจากสับปะรดหวานสีส้ม (Citrus sinensis) และมะนาวขรุขระ ( C. jambhiri) ถูกนำมาใช้หน้าจอสำหรับแสดงถอดความปัจจัยที่แตกต่างกัน (TFS) โดยใช้ 1 · 15K microarray พัฒนาบนพื้นฐานของฐานข้อมูล CitrusTF ที่ Murcott tangor ( C. reticulata × C. sinensis) และดันแคนส้มโอ ( C. Paradisi) ถูกรวมเข้าไปในปริมาณเวลาจริงการตรวจสอบย้อนกลับถอดความ-PCR ในการสั่งซื้อเพื่อเลือกผู้ที่มียีนเฟสเฉพาะกฎระเบียบเป็นเรื่องธรรมดาไปสี่ชนิดผลการค้นหาที่สำคัญฐานข้อมูลบนเว็บสามารถเรียกดูได้ถูกสร้างขึ้นด้วยข้อมูลเกี่ยวกับคำอธิบายประกอบโครงสร้างและการทำงานที่เกี่ยวข้องกับ 1152 unigenes ของ TFS ส้มสมมุติ (CTFs) ฐานข้อมูลนี้ถือเป็นทรัพยากรที่มีคุณค่าสำหรับการวิจัยในการควบคุมการถอดรหัสและฟังก์ชั่นการเปรียบเทียบ นอกจากนี้ microarray ได้รับการพัฒนาและใช้งานที่มีสมมุติ CTFs เหล่านี้เพื่อที่จะระบุแปดยีนที่แสดงให้เห็นการแสดงออกที่แตกต่างกันในเด็กและเยาวชนและผู้ใหญ่ meristems ของสี่ชนิดที่แตกต่างกันของส้ม ยีนเหล่านั้นมีลักษณะและรูปแบบการแสดงออกของพวกเขาในการเจริญเติบโตและการเจริญพันธุ์เนื้อเยื่อได้รับการวิเคราะห์ สี่ของพวกเขามียีน MADS กล่องครอบครัวของ TFS มีส่วนร่วมในกระบวนการพัฒนาในขณะที่อีกคนหนึ่งที่มีลักษณะคล้ายกับยีน MADS กล่อง แต่ขาด MADS กล่องตัวเอง อีกสามคนแสดงให้เห็นว่าสูงคล้ายคลึงกันลำดับบางส่วน จำกัด ให้โปรตีนโดเมน Arabidopsis เฉพาะ แต่เล็กน้อยนอกโดเมนเหล่านั้น. สรุปผลงานนำเสนอที่นี่แสดงให้เห็นว่า JAT ในส้มจะถูกควบคุมโดยกลไกที่อยู่ในส่วนหนึ่งร่วมกันกับบรรดาของ Arabidopsis แต่ยังแตกต่างกันอย่างใด เนื่องจากปัจจัยที่เฉพาะเจาะจงโดยไม่ต้อง orthologues Arabidopsis ยังได้รับการโดดเด่น การมีส่วนร่วมที่มีศักยภาพของยีนใน JAT จะกล่าวถึง