As part of the M3B model, water mol

As part of the M3B model, water molecules are also coarse
grained into spherical beads with a proper size (3.77 Å) and interaction
strength (Molinero and Goddard, 2004). It should be noted
that the coarse grain size of water molecules is not meant to represent
the diameter of a single water molecule, but rather an effective
diameter that, together with the fitted interaction strength,reproduces the density and interaction energetics of water which
are actually determined by the hydrogen bonds between water
molecules. The non-bonded interactions among water and M3B
beads are treated with differently fitted Morse potentials. For modeling
dextran, a modified M3B model has been developed and reported
in our recent works (Riccardi et al., 2008, 2009a,b, 2010a)
where different values were used for the angular and energetic
parameters in Eqs. (1) and (2), and the glucose monomers are
linked together via inter-monomeric B1–B6 bonds. To facilitate
comparison, both amylose and dextran chain are consisted of 40
monomers per main polymeric chain, of which 5% of the glucose
monomers have side branches that are one-monomer long. The
side branches are linked to randomly selected B6 sites in the case
of amylose chains and B4 sites in the case of dextran chains, as
shown in Fig. 1(b) and (c) where the B1, B4, and B6 beads are indicated
by the red, green, and blue balls, respectively, because the
other M3B sites have already been used for inter-monomeric bondings.
For comparison, an atomistic representation of a segment of
dextran chain is also included in Fig. 1.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เป็นส่วนหนึ่งของรูปแบบการ M3B, โมเลกุลของน้ำนอกจากนี้ยังมีเนื้อหยาบ
เป็นลูกปัดทรงกลมที่มีขนาดที่เหมาะสม (3.77) และปฏิสัมพันธ์แรง
(Molinero และก็อดดาร์ด, 2004) มันควรจะสังเกตว่า
ขนาดเม็ดหยาบโมเลกุลของน้ำไม่ได้หมายความว่าจะเป็นตัวแทนของ
เส้นผ่าศูนย์กลางของโมเลกุลน้ำเดียว แต่มีขนาดเส้นผ่าศูนย์กลางที่มีประสิทธิภาพ
ที่ร่วมกับความแข็งแรงของการทำงานร่วมกันติดตั้ง,พันธุ์ energetics ความหนาแน่นและการมีปฏิสัมพันธ์ของน้ำซึ่งมีความมุ่งมั่น
จริงโดยไฮโดรเจนพันธบัตรระหว่างน้ำโมเลกุล
ปฏิสัมพันธ์ที่ไม่ผูกมัดระหว่างน้ำและ M3B ลูกปัด
รับการรักษาด้วยการติดตั้งที่แตกต่างกันมอร์สศักยภาพ สำหรับการสร้างแบบจำลอง
dextran รุ่น M3B แก้ไขได้รับการพัฒนาและมีการรายงาน
ในผลงานที่ผ่านมาของเรา (Riccardi et al. 2008, 2009a, b, 2010a)
ที่ค่าที่แตกต่างกันถูกนำมาใช้สำหรับเชิงมุมและมีพลังในพารามิเตอร์
EQS (1) และ (2) และโมโนเมอร์กลูโคส
เชื่อมโยงกันผ่านทางอินเตอร์ monomeric พันธบัตร B1-B6 เพื่ออำนวยความสะดวกการเปรียบเทียบ
ทั้งอะไมโลสและโซ่ dextran ประกอบด้วยโมโนเมอร์ 40
ต่อห่วงโซ่พอลิเมอหลัก 5% ซึ่งจากโมโนเมอร์
กลูโคสมีสาขาข้างเคียงที่เป็นหนึ่งในโมโนเมอร์ยาว
สาขาด้านที่เชื่อมโยงกับการสุ่มเลือก b6
เว็บไซต์ในกรณีของอะไมโลสโซ่และเว็บไซต์ b4 ในกรณีของโซ่ dextran เป็น
แสดงในรูปที่ 1 (ข) และ (ค) ที่ B1, B4, B6 และลูกปัดจะมีการแสดง
โดยลูกบอลสีแดง, เขียวและน้ำเงินตามลำดับเพราะเว็บไซต์ M3B
อื่น ๆ ได้รับการใช้สำหรับการยึดเหนี่ยวระหว่าง monomeric.
สำหรับ การเปรียบเทียบการแสดงละอองจากส่วนของ
ห่วงโซ่ dextran ยังรวมอยู่ในมะเดื่อ 1

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เป็นส่วนหนึ่งของแบบจำลอง M3B น้ำโมเลกุลก็หยาบ
เม็ดเป็นเม็ดทรงกลมมีขนาดที่เหมาะสม (3.77 Å) และโต้ตอบ
แรง (Molinero และก็อดเดิร์ด 2004) ควรสังเกต
ว่า เมล็ดหยาบขนาดของโมเลกุลน้ำไม่ใช่หมายความ ถึง
เส้นผ่าศูนย์กลางของโมเลกุลน้ำเดียว แต่ค่อนข้างมีประสิทธิภาพ
เส้นผ่าศูนย์กลางที่ พร้อมกับโต้ตอบผ่อนแรงคมพลังโต้ตอบและความหนาแน่นของน้ำซึ่ง
จริงถูกกำหนด โดยพันธบัตรไฮโดรเจนระหว่างน้ำ
โมเลกุล การโต้ตอบที่ไม่ถูกผูกมัดระหว่างน้ำและ M3B
ลูกปัดจะถือว่า มีศักยภาพมอร์สผ่อนแตกต่างกัน สำหรับโมเดล
พัฒนา และรายงานเดกซ์แทรน แบบ M3B แก้ไข
ในงานของเราล่าสุด (Riccardi et al., 2008, 2009a บี 2010a)
ที่ใช้ค่าอื่นสำหรับแองกูลาร์ และมีพลัง
พารามิเตอร์ใน Eqs (1) และ (2), และ monomers กลูโคส
เชื่อมโยงกันผ่านระหว่าง monomeric B1–B6 พันธบัตร เพื่ออำนวยความสะดวก
เปรียบเทียบ 40 จะประกอบด้วยโซ่และและเดกซ์แทรน
monomers ต่อหลักโซ่พอลิเมอ, %ที่ 5 ของน้ำตาลกลูโคส
monomers มีสาขาด้านที่มีน้ำยาหนึ่งนาน ใน
ด้านสาขาเชื่อมโยงกับไซต์ B6 ที่เลือกแบบสุ่มในกรณี
ของ B4 และโซ่และไซต์ในกรณีที่โซ่เดกซ์แทรน เป็น
แสดงใน Fig. 1(b) และ (c) ซึ่งบุประคำ B1, B4 และ B6
สีแดง สีเขียว และน้ำเงินลูก ตามลำดับ เนื่องจาก
ใช้ไซต์อื่น M3B สำหรับ monomeric ระหว่าง bondings แล้ว
สำหรับการเปรียบเทียบการแสดงส่วนของ atomistic
เดกซ์แทรนโซ่ยังอยู่ใน Fig. 1

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็นส่วนหนึ่งของรุ่น M 3 B ที่โมเลกุลของน้ำยังมีเนื้อหยาบละเอียด
ซึ่งจะช่วยเป็นลูกปัดทรงกลมมีขนาดที่เหมาะสม( 3.77 A )และการโต้ตอบ
ซึ่งจะช่วยเสริมความแข็งแกร่ง( molinero และ goddard 2004 ) ควรบันทึกไว้ด้วย
ที่หยาบเมล็ดธัญพืชที่มีขนาดของโมเลกุลของน้ำไม่มีเส้นผ่านศูนย์กลาง
ซึ่งจะช่วยในการเป็นตัวแทนของโมเลกุลน้ำคนเดียวแต่ไม่มี ประสิทธิภาพ
ซึ่งจะช่วยให้เส้นผ่านศูนย์กลางที่พร้อมด้วยความแรงของการตกแต่งจัดให้บริการฉาย ภาพ และการปฏิสัมพันธ์ energetics ความหนาแน่นของน้ำซึ่ง
ซึ่งจะช่วยได้ถูกกำหนดโดยพันธบัตรไฮโดรเจนที่อยู่ระหว่างน้ำ
โมเลกุลของจริงๆ การติดต่อสื่อสารไม่ใช่ - เย็บที่อยู่ท่ามกลางผืนน้ำและ M 3 B
ลูกปัดได้รับการปฏิบัติแตกต่างกันพร้อมด้วย ศักยภาพ มอซจัดให้บริการ สำหรับการสร้างแบบจำลอง
dextran แก้ไขรุ่น M 3 B ที่ได้รับการพัฒนาและรายงาน
ซึ่งจะช่วยในการทำงานเมื่อไม่นานมานี้ของเรา( riccardi et al . 20082009 B 2010 )
ที่สถานที่ซึ่งค่าที่แตกต่างกันจะถูกใช้สำหรับพารามิเตอร์การปรับมุมเสียดทานและมีชีวิตชีวา
ใน eqs ( 1 )และ( 2 )และกลูโคสที่โดยมี
เชื่อมโยงถึงกันผ่านทางพันธบัตรระหว่าง monomeric B 1 - 6 , B .
ซึ่งจะช่วยในการอำนวยความสะดวกและการเปรียบเทียบยางมากขึ้นทั้งนี้เพื่อให้ตรงกับห่วงโซ่ dextran ทั้งสองมีประกอบด้วย 40
โดยต่อห่วงโซ่ polymeric หลักของที่ 5% ของสารพลาสติกกลูโคส
ซึ่งจะช่วยให้มีสาขาทางด้านที่เป็นหนึ่งเดียว - ประกอบยาว ที่
ตามมาตรฐานสาขาด้านข้างได้รับการเชื่อมโยงกับแบบสุ่มที่เลือก B 6 สถานที่ในกรณีที่
ซึ่งจะช่วยในเครือ 4 และยางมากขึ้นทั้งนี้เพื่อให้ตรงกับไซต์ B ในกรณีที่มีโซ่ตรวน dextran เป็น
ซึ่งจะช่วยแสดงในรูป 1 ( B )และ(ค)ที่ B 1 B 4 B 6 และลูกปัดที่จะแสดง
โดยสีแดงสีเขียวสีฟ้าและลูกตามลำดับเนื่องจากสถานที่
อื่นๆม. 3 B ที่ได้รับการใช้งานสำหรับ bondings Inter - monomeric แล้ว.
สำหรับการเปรียบเทียบการเป็นตัวแทน atomistic ที่ของของส่วนของ
ห่วงโซ่ dextran ได้ถูกรวมอยู่ในรูป 1 .