BACKGROUND/PURPOSE:Hepatitis delta

BACKGROUND/PURPOSE:
Hepatitis delta virus (HDV) is the only animal RNA virus that has an unbranched rod-like genome with ribozyme activity. It replicates in the nucleus by host RNA polymerase via a rolling circle mechanism. Similar to many RNA viruses encoding their own RNA-dependent RNA polymerases, homologous recombination of HDV occurs in mixed-genotype infections and in cultured cells cotransfected with two HDV sequences, as demonstrated by molecular analyses.
METHODS:
Among 237 published complete genomic sequences, 34 sequences were reported from the small and isolated Miyako Island, Japan, and belonged to the Asia-specific genotypes, HDV-2 and HDV-4 (the majority of them belonged to the known Miyako Island-specific subgroup, HDV-4M). We investigated the presence of naturally occurring HDV recombinant in Miyako Island using phylogenetic and recombination analyses.
RESULTS:
We identified a two-switch HDV-4/4M intersubtype recombinant with an unbranched rod-like RNA genome.
CONCLUSION:
Our data suggest that RNA recombination plays an important role in the rapid evolution of HDV, allowing the production of new HDV strains with correct genomic structures.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พื้นหลัง/วัตถุประสงค์:ไวรัสตับอักเสบเดลต้า (HDV) เป็นอาร์เอ็นเอไวรัสที่มีจีโนมร็อดเหมือนการ unbranched มีกิจกรรมไรโบไซม์ สัตว์เท่านั้น มันเหมือนกับในนิวเคลียสโดย host ของอาร์เอ็นเอพอลิเมอเรสผ่านกลไกกลมกลิ้ง คล้ายกับในอาร์เอ็นเอไวรัสเข้ารหัสอาร์เอ็นเออาร์เอ็นเอขึ้นอยู่กับ polymerases, homologous recombination ของ HDV ตนเกิดขึ้น ในการติดเชื้อผสมลักษณะทางพันธุกรรม และ ในเซลล์อ่าง cotransfected มีสองลำดับ HDV เป็นโดยวิเคราะห์ระดับโมเลกุลวิธีการ:ระหว่าง 237 เผยแพร่สมบูรณ์ genomic ลำดับ ลำดับที่ 34 ได้รายงานจากเล็ก และแยกเกาะมิยาโกะ ญี่ปุ่น และเป็นสมาชิกในเอเชียเฉพาะศึกษาจีโนไทป์ HDV-2 และ HDV-4 (ส่วนใหญ่พวกเขาเป็นสมาชิกที่รู้จักเกาะมิยาโกะเฉพาะกลุ่มย่อย HDV - 4M) เราตรวจสอบสถานะเกิดขึ้นตามธรรมชาติ HDV วททชเกาะมิยาโกะใช้ phylogenetic และวิเคราะห์ recombinationผลลัพธ์:เราระบุสองสลับ HDV-4 / 4M intersubtype วททชกับการ unbranched แกนเช่นอาร์เอ็นเอจีโนมสรุป:ข้อมูลแนะนำว่า recombination อาร์เอ็นเอมีบทบาทสำคัญในการวิวัฒนาการอย่างรวดเร็วของ HDV ช่วยให้ผลิตของเงีย HDV ใหม่โครงสร้าง genomic ถูกต้อง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

วัตถุประสงค์พื้นฐาน :
คือ ไวรัสตับอักเสบ ( HDV ) เป็น RNA ไวรัส มีเพียงสัตว์ที่ชอบคัน unbranched จีโนมกับกิจกรรมไรโบไซม์ . มันซ้ำในนิวเคลียสโดยเจ้าภาพอาร์เอ็นเอพอลิเมอเรสผ่านกลไกกลมกลิ้ง . คล้ายกับหลาย RNA ไวรัส RNA ( RNA polymerases การเข้ารหัสของตัวเอง ,การเปรียบเทียบของ HDV เกิดขึ้นในเชื้อพันธุกรรมในเซลล์เพาะเลี้ยงและผสม cotransfected สอง HDV ลำดับ ดังที่แสดงโดยวิเคราะห์โมเลกุล วิธีการ :

ลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ของ 237 หัวข้อ 34 ) มีรายงานจากขนาดเล็กและแยก มิยาโกะ เกาะญี่ปุ่น และเป็นของเฉพาะพันธุ์เอเชีย ,และ hdv-2 hdv-4 ( ส่วนใหญ่ของพวกเขาเป็นของจักมิยาโกะเกาะเฉพาะกลุ่มย่อย hdv-4m ) เราได้ตรวจสอบสถานะของธรรมชาติที่เกิดขึ้นในเกาะมิยาโกะใช้ HDV สามารถวิเคราะห์ และการยืนยันผล : .

เราระบุสองสลับ hdv-4 / 4M intersubtype แนนท์ด้วยพลอง unbranched เช่น RNA genome .

สรุป :ข้อมูลแนะนำว่า RNA การมีบทบาทสำคัญในการวิวัฒนาการอย่างรวดเร็วของ HDV สามารถผลิตสายพันธุ์ใหม่ที่มีโครงสร้างจีโนม HDV ที่ถูกต้อง