and PDA (potato dextrose agar medium) colony-forming units
(CFU) (epiphytic) were determined after 72 h. For endophytic
bacteria counting, roots were surface sterilized by immersion in
HgCl2 0.01% (w/v), immediately washed with sterile distilled water
macerated in a mortar with 10 mL sterile saline, sonicated for 10 s,
diluted as before and plated on NFbHP-Malate and BDA to count
CFU (endophytic). Bacterial counting was performed after 72 h.
The fingerprinting of endophytic and epiphytic bacteria recovered
was confirmed by PCR targeting the 16S rRNA and nifH genes.
Genomic DNA obtained from bacterial colonies [46] was amplified
using 16S rRNA primers (sense 50-AGG AGG DG74 TGA TCC AAC CGC
A-30 and antisense 50-AAC RW1 TGG AGG AAG GTG GGG AT-30;
amplicon of 310 bp) and nifH (sense 50-ACC ATC CTG CGC CTG CAC
GCC AAG G-30 and antisense 50-ACG ATG ATT TCC TGG TAG TTG GCC
TT-30; amplicon of 317 bp). The reactions were subjected to the
following programs: for 16S rRNA, 5 min at 94 C followed by 35
cycles of amplification (30 s at 94 C, 30 s at 54 C, 1 min at 72 C)
and final extension of 5 min at 72 C; for nifH, 5 min at 94 C followed
by 35 amplification cycles (45 s 94 C, 45 s 54 C, 45 s 72 C)
and 1 min final extension at 72 C. Products of the PCR reactions
were submitted to agarose gel 1.5% (w/v) electrophoresis
และ PDA (มันฝรั่งขึ้น agar medium) เป็นอาณานิคม(CFU) (epiphytic) ถูกกำหนดหลังจาก 72 h สำหรับ endophyticการตรวจนับแบคทีเรีย รากถูกราคาผิว sterilized โดยแช่ในHgCl2 0.01% (w/v), การทันทีล้างด้วยใส่น้ำกลั่นmacerated ในครกด้วยน้ำเกลือฆ่าเชื้อ 10 mL, sonicated 10 sแตกออกเป็นก่อนชุบในมาลาเต NFbHP และ BDA นับCFU (endophytic) การตรวจนับแบคทีเรียที่ดำเนินการหลังจาก 72 hลายพิมพ์ของแบคทีเรีย endophytic และ epiphytic กู้มียืนยันจาก PCR ที่กำหนดเป้าหมาย 16S rRNA และ nifH ยีนมีขยาย genomic DNA ที่ได้จากแบคทีเรียอาณานิคม [46]ใช้ไพรเมอร์ 16S rRNA ที่ (รู้สึก 50 AGG AGG DG74 TGA TCC AAC CGCA-30 และ antisense 50 AAC RW1 TGG AGG เอเอจี GTG GGG AT-30amplicon 310 bp) และ nifH (รู้สึก 50 บัญชี ATC CTG CGC CTG CACเอเอจี G-30 ของ GCC และ antisense 50-จีบ ATG ATT TCC TGG แท็ก TTG GCCTT-30 amplicon 317 bp) ปฏิกิริยาที่ถูกต้องโปรแกรมต่อไปนี้: สำหรับ 16S rRNA, 5 นาทีที่ 94 C ตาม ด้วย 35วงจรขยาย (30 s ที่ 94 C การ 30 s ที่ 54 C, 1 นาทีที่ 72 C)และสุดท้ายขยาย 5 นาทีที่ 72 C สำหรับ nifH, 5 นาทีที่ 94 C ตามโดยรอบขยาย 35 (45 s 94 C, 45 s 54 C, 45 s 72 C)และส่วนขยายสุดท้าย 1 นาทีที่ 72 C. ผลิตภัณฑ์ของปฏิกิริยา PCRส่งมาที่ electrophoresis agarose เจล 1.5% (w/v)
การแปล กรุณารอสักครู่..