PDB-101: Introduction to a
Structural View of Biology
PDB-101 is a new and unique view of the RCSB PDB website that
places educational materials front and center. It packages together
resources of interest to teachers, students, and the general public to
promote exploration in the world of proteins and nucleic acids:
• Molecule of the Month series. Describing molecules from AAA+
proteases to zinc fingers, this feature provides an easy introduction
to macromolecular structures, shows how the structures
function, and highlights their importance in our lives.
Created by David S. Goodsell (RCSB PDB, The Scripps Research
Institute), each illustrated entry links to high resolution images,
asks discussion questions, and hosts customized interactive 3D
molecular views. Biologically interesting examples of structures
are shown in specific PDB-101 views that supplement summary
information about the entry with functional context.
The Molecule of the Month resource is used in many classrooms
to introduce structures to students, and is an integral part of the
Science Olympiad protein modeling competitions.
• Structural View of Biology. Built around the Molecule of the
Month series, this interface promotes a top-down exploration of
the PDB. Beginning with high-level functional categories, readers
can browse through descriptive subcategories to access relevant
articles and related PDB entries. Mouseovers, pulldown menus, and
carousels all offer easy navigational tools to promote learning.
• Available Educational Resources include posters, animations, and
classroom lessons and activities. Recent additions include a downloadable
PDF that can be used to build 3D models of DNA.
• Understanding PDB Data provides a reference to help explore
and interpret individual PDB entries. Broad topics include how
to understand PDB data, how to visualize structures, how to read
coordinate files, and potential challenges to exploring the archive.
Educational Programs and Activities
The RCSB PDB participates in large-scale events for local communities,
such as the San Diego Science Festival and Rutgers Day.
At these festivals, event attendees build hands-on virus and DNA
models and learn about protein and nucleic acid structure.
Other programs focus on getting students and teachers at the
middle and high school level interested and involved in the
fields of structural biology and bioinformatics. Area high school
classes visit and tour the RCSB PDB. These experiences often lead
to new initiatives and collaborations.
At Rutgers and UCSD, the RCSB PDB leaders are involved in
graduate and undergraduate courses and summerstudent research
projects that depend heavily on the data in the PDB archive.
In 2012, the RCSB PDB will sponsor the protein modeling event
at the Science Olympiad competitions held in New Jersey and
in San Diego, CA. In this challenge, high school teams will
demonstrate their understanding of proteins involved in the
regulation of apoptosis through their mastery of hand-built
models and onsite exams. Information and resources can be
found at education.pdb.org and twitter.com/buildmodels. The
event is organized nationally by the MSOE Center for BioMolecular
Modeling (cbm.msoe.edu).
pdb-101 : เบื้องต้น เพื่อดูโครงสร้างของ pdb-101 ชีววิทยา
เป็นมุมมองที่ใหม่และไม่ซ้ำกันของ rcsb PDB เว็บไซต์
สถานที่ศูนย์วัสดุการศึกษา หน้า และ มันชุดด้วยกัน
ทรัพยากรความสนใจของครู นักเรียน และประชาชนทั่วไป เพื่อส่งเสริมการสำรวจ
ในโลกของโปรตีนและกรดนิวคลีอิก :
- โมเลกุลของเดือนชุด อธิบายโมเลกุลจาก AAA
เพื่อให้นิ้วสังกะสี คุณลักษณะนี้มี
แนะนำง่ายโครงสร้าง macromolecular แสดงให้เห็นว่าโครงสร้าง
ฟังก์ชัน และไฮไลท์สำคัญของพวกเขาในชีวิตของเรา ที่สร้างโดย เดวิด กู๊ดเซลล์ ( S
rcsb PDB , สถาบัน Scripps วิจัย
) แต่ละรายการที่แสดงการเชื่อมโยงไปยังรูปภาพความละเอียดสูง
ถาม การอภิปราย และโยธา ปรับแต่งแบบโต้ตอบ 3D
โมเลกุล viewsฤทธิ์ทางชีวภาพที่น่าสนใจตัวอย่างโครงสร้างของ
จะแสดงในมุมมอง pdb-101 เฉพาะที่เสริมสรุป
ข้อมูลเกี่ยวกับรายการกับบริบทการทำงาน .
โมเลกุลของเดือนทรัพยากรใช้ในหลายห้องเรียน
แนะนำโครงสร้างให้กับนักเรียน และเป็นส่วนหนึ่งของการแข่งวิทยาศาสตร์โอลิมปิกระหว่างประเทศโปรตีน
.
- โครงสร้างมุมมองของชีววิทยาสร้างรอบโมเลกุลของ
เดือนชุดอินเตอร์เฟซนี้ส่งเสริมลงสำรวจ
PDB . เริ่มต้นด้วยหมวดการทำงานระดับสูง , ผู้อ่าน
สามารถเรียกดูผ่านบทความที่เกี่ยวข้องเชิงย่อยเพื่อเข้าถึง
และ PDB รายการ mouseovers , เมนูแบบเลื่อนลง , และช่องทั้งหมดมีการเดินเรือเครื่องมือง่าย
เพื่อส่งเสริมการเรียนรู้- มีการศึกษาทรัพยากรรวมถึงโปสเตอร์ , ภาพเคลื่อนไหวและ
เรียนบทเรียนและกิจกรรม เพิ่มล่าสุดรวม PDF ดาวน์โหลด
ที่สามารถใช้ในการสร้างโมเดล 3 มิติของดีเอ็นเอ .
- GAS ให้เข้าใจข้อมูลอ้างอิงเพื่อช่วยสำรวจ
และตีความแต่ละ PDB รายการ หัวข้อที่กว้าง รวมถึงวิธีการ
เข้าใจข้อมูล PDB , วิธีการที่จะเห็นภาพโครงสร้าง วิธีการอ่าน
ไฟล์ประสานงานและความท้าทายที่อาจเกิดขึ้นกับการจัดเก็บ โปรแกรมการศึกษาและกิจกรรม
rcsb PDB มีส่วนร่วมในเหตุการณ์ขนาดใหญ่สำหรับชุมชนท้องถิ่น ,
เช่น San Diego วิทยาศาสตร์เทศกาลและรัทวัน .
ในเทศกาลนี้ ผู้เข้าร่วมงานสร้างโดยไวรัสและดีเอ็นเอ
รูปแบบและเรียนรู้เกี่ยวกับโปรตีนและกรดนิวคลีอิกโครงสร้าง .
โปรแกรมอื่น ๆ ทำให้นักเรียนและครูที่โรงเรียนกลางและสูงระดับ
สนใจและมีส่วนร่วมในด้านชีววิทยาโครงสร้าง และชีวสารสนเทศ บริเวณโรงเรียนมัธยม
เรียนเยี่ยมชมและทัวร์ rcsb PDB . ประสบการณ์เหล่านี้มักจะนำ
แนวใหม่และความร่วมมือ .
ที่ UCSD และรัท , rcsb PDB ผู้นำเกี่ยวข้องกับ
บัณฑิตและหลักสูตรระดับปริญญาตรีและ summerstudent วิจัย
โครงการที่ขึ้นอยู่กับหนักในข้อมูลใน PDB ถาวร .
ใน 2012 , rcsb PDB จะสปอนเซอร์โปรตีนการสร้างแบบจำลองเหตุการณ์
ที่วิทยาศาสตร์โอลิมปิกระหว่างประเทศการแข่งขันจัดขึ้นใน New Jersey และ
ในซานดิเอโก แคลิฟอร์เนีย ในความท้าทายนี้ ทีมโรงเรียนสูงจะแสดงให้เห็นถึงความเข้าใจ
ของโปรตีน ที่เกี่ยวข้องใน
ระเบียบของ apoptosis ผ่านการเรียนรู้ของพวกเขาของมือสร้าง
นางแบบและสอบในโรงแรม ข้อมูลและทรัพยากรที่สามารถพบได้ใน education.pdb.org twitter.com/buildmodels
และ .
จัดทั่วประเทศโดย ศูนย์ msoe แบบชีวโมเลกุล
( CBM . msoe . edu )
การแปล กรุณารอสักครู่..
