The chromosome number (2N) of walking catfish (C.macrocephalus) in Thailand is 58
(Donsakul and Magtoon 1989). Although the exact size of the genome is not known, the genetic map of walking catfish may be quite large. A large number of genetic markers will be required to span the genome evenly. Two types of genetic markers, microsatellite and AFLP are being developed for construction of genetic map in a backcross family of hybrid catfish ((C. macrocephalus x C.gariepinus) x C. gariepinus). Because of their high level of polymorphism, their relatively even distribution throughout the genome, microsatellites and AFLPs are ideal markers for the construction of highly resolution genetic maps (Vos et al. 1995; Kocher et al. 1998; Agresti et al. 2000; and Waldbieser et al. 2001). Over the past decade, microsatellite markers have been extensively
characterized in various numbers of fish species. Microsatellite DNA is comprised of tandem repeats of short, simple nucleotide sequences. The majority of microsatellite loci in fish genomes are composed of the GT motifs, similar to that of higher vertebrates, e.g., rat and human. In addition, microsatellite markers are often conserved among closely related species, e.g., salmonids and cyprinids. Primer pairs for GT dinucleotide microsatellite loci of walking catfish are being developed for population study and genetic mapping. In this study, primers of Clarias macrocephalus, C. gariepinus, C. batrachus, and Pangasius hypophthalmus microsatellites were tested for PCR amplification on the DNA of C. macrocephalus and C. gariepinus. Polymorphic microsatellite loci were chosen for genotyping of individuals from a backcross family for mapping purposes.
จำนวนโครโมโซม (2N) ปลาดุกเดิน (C.macrocephalus) ในประเทศไทยเป็น 58
(Donsakul และ Magtoon 1989) แม้ว่าขนาดที่แน่นอนของจีโนมไม่เป็นที่รู้จัก, แผนที่ทางพันธุกรรมของปลาดุกเดินอาจจะมีขนาดใหญ่มาก จำนวนมากของเครื่องหมายทางพันธุกรรมจะต้องครอบคลุมจีโนมอย่างสม่ำเสมอ สองประเภทของเครื่องหมายทางพันธุกรรม, ไมโครและ AFLP มีการพัฒนาสำหรับการก่อสร้างของแผนที่ทางพันธุกรรมในครอบครัววิธีผสมกลับของปลาดุกลูกผสม ((ปลาดุกอุย x C.gariepinus) x C. gariepinus) เนื่องจากระดับสูงของพวกเขาแตกต่างกระจายค่อนข้างแม้พวกเขาตลอดทั้งจีโนม, ไมโครและ AFLPs เป็นเครื่องหมายที่เหมาะสำหรับการก่อสร้างที่มีความละเอียดสูงแผนที่ทางพันธุกรรม (ชรา, et al. 1995; Kocher et al, 1998;. Agresti, et al. 2000; และ Waldbieser et al. 2001) กว่าทศวรรษที่ผ่านเครื่องหมายไมโครได้รับอย่างกว้างขวาง
ในลักษณะตัวเลขต่าง ๆ ของปลา ไมโครดีเอ็นเอประกอบด้วยซ้ำควบคู่สั้นลำดับเบสง่าย ส่วนใหญ่ของไมโคร loci ในจีโนมของปลาจะประกอบด้วยลวดลาย GT คล้ายกับที่ของสัตว์มีกระดูกสันหลังที่สูงขึ้นเช่นหนูและมนุษย์ นอกจากนี้เครื่องหมายไมโครได้รับการอนุรักษ์สายพันธุ์ที่มักจะอยู่ในหมู่ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดเช่น salmonids และ cyprinids คู่ศึกษาสำหรับสถานะไมโคร GT dinucleotide ปลาดุกเดินที่ถูกพัฒนาสำหรับการศึกษาของประชากรและการทำแผนที่พันธุกรรม ในการศึกษานี้ไพรดุก, C. gariepinus, C. batrachus และปลาสวาย hypophthalmus ไมโครได้มีการทดสอบสำหรับการขยาย PCR ในดีเอ็นเอของปลาดุกอุยและ C. gariepinus loci ไมโคร Polymorphic ถูกเลือกสำหรับ genotyping ของบุคคลจากครอบครัววิธีผสมกลับเพื่อวัตถุประสงค์ในการทำแผนที่
การแปล กรุณารอสักครู่..
