the necessary first step in analysi

the necessary first step in analysis of nsSNPs is to identify whether a given SNP is indeed non-synonymous. For this purpose we map SNPs onto known protein on the basis of SNP DNA flanking sequences.
Flanking genomic sequences of SNPs from HGVbase with length 25 bp each have been translated in all six possible and searched for in the proteins in the human proteins subset of SWALL database. Protein sequences and genomic fragments were preprocessed with the SEG,XNU,RepeatMasker and Dust program, which are use to fitter iot areas of low compositional complexity,regions containing internal repeats of short periodicity and know human genomic repeat sequence.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ขั้นตอนแรกจำเป็นในการวิเคราะห์ของ nsSNPs เป็นการ ระบุว่า SNP ที่กำหนดอย่างแน่นอนไม่ใช่- สำหรับวัตถุประสงค์นี้ เราแผนที่ SNPs ไปรู้จักโปรตีนโดย DNA SNP flanking ลำดับ.
Flanking ลำดับ genomic ของ SNPs จาก HGVbase มีความยาว 25 bp ได้ถูกแปลในหกไปทั้งหมด และค้นหาในโปรตีนในชุดย่อยโปรตีนมนุษย์ของฐานข้อมูล SWALL ลำดับโปรตีนและบางส่วนของ genomic ถูก preprocessed กับโปรแกรม SEG, XNU, RepeatMasker และฝุ่น ซึ่งจะใช้พื้นที่ iot โลภซับซ้อนต่ำ compositional ภูมิภาคที่ประกอบด้วยภายในซ้ำของสั้นประจำงวด และทราบลำดับซ้ำ genomic มนุษย์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ขั้นตอนแรกที่จำเป็นในการวิเคราะห์ nsSNPs คือการระบุว่าได้รับ SNP เป็นจริงไม่ตรงกัน เพื่อจุดประสงค์นี้เราแผนที่ SNPs บนโปรตีนที่รู้จักกันบนพื้นฐานของ SNP ดีเอ็นเอขนาบลำดับ
ขนาบข้างลำดับจีโนมของ SNPs จาก HGVbase ที่มีความยาว 25 bp แต่ละได้รับการแปลในทุกหกเป็นไปได้และค้นหาในโปรตีนในโปรตีนของมนุษย์ย่อยของ Swall ฐานข้อมูล ลำดับโปรตีนและเศษจีโนมได้ preprocessed กับ SEG, xnu, RepeatMasker และโปรแกรมฝุ่นที่มีการใช้งานเพื่อช่างฟิตพื้นที่ IOT ของความซับซ้อน compositional ต่ำพื้นที่ซึ่งมีซ้ำภายในระยะเวลาสั้น ๆ และรู้ลำดับจีโนมของมนุษย์ซ้ำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ขั้นตอนแรกที่จำเป็นในการวิเคราะห์ nssnps จะระบุว่าให้ SNP ย่อมไม่ตรงกัน สำหรับวัตถุประสงค์นี้ เรา snps โปรตีนบนแผนที่หรือบนพื้นฐานของ SNP ดีเอ็นเอจ ลำดับ ลำดับของจีโนม
จ snps จาก hgvbase กับ BP ความยาว 25 แต่ละได้รับการแปลในทั้งหมดหกที่สุดและค้นหาในโปรตีนที่ย่อยโปรตีนมนุษย์ฐานข้อมูล swall .ลำดับโปรตีนและเศษ preprocessed กับจีโนมถูกขังเดี่ยว xnu repeatmasker , , และโปรแกรมฝุ่น ซึ่งจะใช้พื้นที่ของความซับซ้อนต่ำด้วยช่างฟิต ส่วนประกอบ ภูมิภาคที่มีซ้ำภายในอย่างสั้นและรู้ลำดับซ้ำจีโนมมนุษย์