Background: Many fruits, including

Background: Many fruits, including watermelon, are proficient in carotenoid accumulation during ripening. While most genes encoding steps in the carotenoid biosynthetic pathway have been cloned, few transcriptional regulators of these genes have been defined to date. Here we describe the identification of a set of putative carotenoid-related transcription factors resulting from fresh watermelon carotenoid and transcriptome analysis during fruit development and ripening. Our goal is to both clarify the expression profiles of carotenoid pathway genes and to identify candidate regulators and molecular targets for crop improvement. Results: Total carotenoids progressively increased during fruit ripening up to ~55 μgg -1 fw in red-ripe fruits. Trans-lycopene was the carotenoid that contributed most to this increase. Many of the genes related to carotenoid metabolism displayed changing expression levels during fruit ripening generating a metabolic flux toward carotenoid synthesis. Constitutive low expression of lycopene cyclase genes resulted in lycopene accumulation. RNA-seq expression profiling of watermelon fruit development yielded a set of transcription factors whose expression was correlated with ripening and carotenoid accumulation. Nineteen putative transcription factor genes from watermelon and homologous to tomato carotenoid-associated genes were identified. Among these, six were differentially expressed in the flesh of both species during fruit development and ripening. Conclusions: Taken together the data suggest that, while the regulation of a common set of metabolic genes likely influences carotenoid synthesis and accumulation in watermelon and tomato fruits during development and ripening, specific and limiting regulators may differ between climacteric and non-climacteric fruits, possibly related to their differential susceptibility to and use of ethylene during ripening.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พื้นหลัง: ผลไม้มากมาย แตงโม รวมทั้งมีความเชี่ยวชาญในการสะสม carotenoid ระหว่าง ripening ในขณะที่ส่วนใหญ่ยีนที่เข้าขั้นตอนทางเดินที่ biosynthetic carotenoid มีการโคลน เร็คกูเลเตอร์ transcriptional น้อยของยีนเหล่านี้มีการกำหนดวันที่ ที่นี่เราอธิบายรหัสชุดของ transcription carotenoid เกี่ยวข้อง putative ปัจจัยเกิดจากแตงโมสด carotenoid และ transcriptome การวิเคราะห์ในระหว่างการพัฒนาผลไม้ และ ripening เป้าหมายของเราคือทั้งสองชี้แจงค่านิพจน์ทางเดิน carotenoid ยีน และระบุผู้สมัครเร็คกูเลเตอร์และปรับปรุงพืชโมเลกุลเป้าหมาย ผลลัพธ์: carotenoids รวมความก้าวหน้าเพิ่มขึ้นระหว่างผลไม้ ripening fw μgg -1 ถึง 55 ~ ในผลไม้สุกสีแดง ทรานส์-lycopene เป็น carotenoid ที่ส่วนนี้เพิ่มขึ้นมากที่สุด ของยีนที่เกี่ยวข้องกับเมแทบอลิซึม carotenoid แสดงเปลี่ยนนิพจน์ระดับระหว่างผลไม้ ripening สร้างฟลักซ์ที่เผาผลาญไปสังเคราะห์ carotenoid ค่าขึ้นต่ำของ lycopene cyclase ยีนให้สะสม lycopene อาร์เอ็นเอลำดับนิพจน์สร้างโพรไฟล์ของแตงโมผลไม้เต็มชุดของนิพจน์ซึ่งถูก correlated กับปัจจัย transcription ripening และ carotenoid สะสม Putative transcription ทส่วนตัวยีน จากแตงโม และ homologous กับยีนที่เกี่ยวข้อง carotenoid มะเขือเทศไม่ระบุ ในหมู่เหล่านี้ 6 ได้ differentially แสดงในเนื้อทั้งสองชนิดในระหว่างการพัฒนาผลไม้และ ripening บทสรุป: นำกันข้อมูลแนะนำในขณะที่ข้อบังคับทั่วไปชุดเผาผลาญยีนมีอิทธิพลต่อแนวโน้ม carotenoid สังเคราะห์และสะสมในผลไม้แตงโมและมะเขือเทศในระหว่างการพัฒนาและ ripening เฉพาะที่ และจำกัดเร็คกูเลเตอร์อาจแตกต่างระหว่าง climacteric และ climacteric ไม่ใช่ผลไม้ อาจเกี่ยวข้องกับความง่ายแตกต่างและการใช้เอทิลีนระหว่าง ripening

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

พื้นหลัง: ผลไม้จำนวนมากรวมทั้งแตงโมมีความเชี่ยวชาญในการสะสม carotenoid ระหว่างการสุก ในขณะที่ยีนส่วนใหญ่การเข้ารหัสขั้นตอนในทางเดินชีวสังเคราะห์ carotenoid ได้รับการโคลนหน่วยงานกำกับดูแลการถอดรหัสไม่กี่ของยีนเหล่านี้ได้รับการกำหนดให้วันที่ ที่นี่เราจะอธิบายบัตรประจำตัวของชุดของ carotenoid ถอดความปัจจัยที่เกี่ยวข้องกับสมมุติที่เกิดจาก carotenoid แตงโมสดและการวิเคราะห์ยีนในระหว่างการพัฒนาและผลไม้สุก เป้าหมายของเราคือการชี้แจงทั้งรูปแบบการแสดงออกของยีนเดิน carotenoid และระบุหน่วยงานกำกับดูแลของผู้สมัครและเป้าหมายโมเลกุลในการปรับปรุงการเพาะปลูก ผลการศึกษา: นอยด์รวมเพิ่มขึ้นมีความก้าวหน้าในช่วงผลไม้สุกถึง ~ 55 μgg -1 จืดในผลไม้สีแดงสุก ทรานส์ไลโคปีนเป็น carotenoid ที่สนับสนุนมากที่สุดในการเพิ่มขึ้นนี้ หลายของยีนที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญอาหาร carotenoid แสดงการเปลี่ยนแปลงระดับการแสดงออกในช่วงผลไม้สุกสร้างการไหลของการเผาผลาญที่มีต่อการสังเคราะห์ carotenoid ส่วนประกอบแสดงออกต่ำของไลโคปีนยีนเคลสส่งผลให้เกิดการสะสมของไลโคปีน RNA-หมายเลขโปรไฟล์การแสดงออกของการพัฒนาผลไม้แตงโมผลชุดของถอดความปัจจัยที่มีการแสดงออกที่มีความสัมพันธ์กับการสุกและการสะสม carotenoid เก้ายีนถอดความปัจจัยสมมุติจากแตงโมและมะเขือเทศคล้ายคลึงกัน carotenoid ยีนที่เกี่ยวข้องที่ถูกระบุ กลุ่มคนเหล่านี้หกถูกแสดงออกแตกต่างกันในเนื้อหนังของทั้งสองชนิดในระหว่างการพัฒนาและผลไม้สุก สรุปร่วมกันข้อมูลที่ชี้ให้เห็นว่าในขณะที่การควบคุมการตั้งค่าทั่วไปของยีนการเผาผลาญที่มีอิทธิพลต่อแนวโน้มการสังเคราะห์ carotenoid และการสะสมในผลไม้แตงโมและมะเขือเทศในระหว่างการพัฒนาและการสุกที่เฉพาะเจาะจงและหน่วยงานกำกับดูแลการ จำกัด การอาจแตกต่างกันระหว่างจุดสำคัญในชีวิตและผลไม้ที่ไม่ใช่จุดสำคัญในชีวิตอาจจะเป็น ที่เกี่ยวข้องกับความไวต่อความแตกต่างของพวกเขาและการใช้เอทิลีนระหว่างการสุก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

พื้นหลัง : ผลไม้มากมาย ได้แก่ แตงโม มีความเชี่ยวชาญในการสะสมคาโรทีนอยด์ในการ . ขณะที่ส่วนใหญ่ยีนเข้ารหัสในขั้นตอนการผลิตแคโรทีนอยด์ได้ทางโคลน น้อยลองควบคุมของยีนเหล่านี้ได้รับการกำหนดให้วันที่ที่นี่เราจะอธิบายการตั้งค่าของแคโรทีนอยด์กรดอะมิโนที่เกี่ยวข้องกับปัจจัยการถอดความที่เกิดจากเชื้อที่แตงโมสด และการวิเคราะห์ทราน ริปโตมในระหว่างการพัฒนาของผลสุก เป้าหมายของเราคือเพื่อให้โปรไฟล์ของแคโรทีนอยด์ทั้งการแสดงออกทางและยีนระบุสารควบคุมผู้สมัครและเป้าหมายโมเลกุลเพื่อการปรับปรุงพันธุ์พืช . ผลลัพธ์ :แคโรทีนอยด์รวมมีความก้าวหน้าเพิ่มขึ้นในช่วงผลไม้สุกถึง ~ 55 μ GG - 1 FW ในผลไม้สุกสีแดง ทราน ไลโคปีน เป็นแคโรทีนอยด์ที่สนับสนุนมากที่สุดในการเพิ่มนี้ หลายของยีนที่เกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงในการเผาผลาญแสดงระดับการแสดงออกในช่วงผลไม้สุกสร้างการเผาผลาญอาหารฟลักซ์ต่อการสังเคราะห์ Carotenoid .การแสดงออกของยีนไซเคลสต่ำ และส่งผลให้เกิดการสะสม Lycopene ไลโคปีน . แบบแผนการแสดงออกของยีน seq การพัฒนาผลไม้แตงโม จากชุดของปัจจัยการถอดความที่มีการแสดงออกมีความสัมพันธ์กับการสุกและแคโรทีนสะสม . สิบเก้าซึ่งถอดความปัจจัยยีนจากแตงโม และความคล้ายคลึงกับยีนในมะเขือเทศที่ระบุระหว่างเหล่านี้หกถูกแสดงออกแตกต่างกันในเนื้อทั้งสองชนิดระหว่างการพัฒนาของผลสุก สรุป ได้ข้อมูลว่า ในขณะที่ชุดทั่วไปของกฎระเบียบของยีนอาจสลายอิทธิพลในการสังเคราะห์และการสะสมในแตงโม มะเขือเทศ และผลไม้ ระหว่างการพัฒนาและการสุก ,ที่เฉพาะเจาะจงและการควบคุมอาจแตกต่างระหว่าง 4 และไม่ใช่ผลไม้หมด อาจเกี่ยวข้องกับการเกิดและการใช้อนุพันธ์เอทิลีนในระหว่างการสุก