4. Discussion
The present study reports genetic characterization of TRAP gene
of B. gibsoni from dogs in India. The molecular analysis of canine
B. gibsoni parasites has been reported earlier in East-Asian countries including
India, Bangladesh, Japan, Korea, Taiwan and Malaysia (Inokuma
et al., 2004; Miyama et al., 2005; Lee et al., 2009, 2010; Mokhtar et al.,
2013, Mandal et al., 2014; Terao et al., 2015). In India, a recent study
on 18S rRNA gene and ITS-1 of 13 B. gibsoni isolates from dogs in
north and north-eastern states was carried out to confirm the parasite
as B. gibsoni (Mandal et al., 2014). The authors found no genetic
variations in the Indian isolates of B. gibsoni based on the 18S rRNA
gene and ITS-1 sequences and these isolates were 100% identical to
B. gibsoni Asia-2 (accession no. AF175301). However, for determining
the genetic diversity in the B. gibsoni circulating in this part of India,
TRAP gene was not used as a marker by these authors. Sequence analysis
of BgTRAP gene fragments of different B. gibsoni isolates from north
and north eastern parts of India in the present study showed genetic
variations within these isolates. These B. gibsoni genetic variants were
distributed equally in these four states. This genetic variation was mostly
contributed by the repeat sequences of the hexapeptide, tetrapeptide
and dipeptide, respectively present in the TRAP proteins in the isolates
of India and Bangladesh. Also, length polymorphisms of 2193–2373 bp
(due to deletions and insertions of repeat sequences) in the TRAP
cDNAs of different B. gibsoni isolates and contributing to their genetic
variability have been reported in the database globally.
The phylogenetic tree of BgTRAP gene fragments clearly showed
that B. gibsoni parasites in India and Bangladesh shared a common genetic
cluster that was away from B. gibsoni detected in East-Asian countries.
This result suggests that the parasites distributed in India and
Bangladesh may not have been recently introduced from East-Asian
countries. The tree also revealed that the TRAP genes formed a different
cluster between B. gibsoni and B. bovis species and that genetic
Fig. 2. Alignment of nucleotide sequences of 19 BgTRAP gene fragments (855 bp) obtained from 19 isolates of B. gibsoni in the present study from dogs in India. Tandem DNA repeats corresponding
to three peptide repeats (DQTD, PH and EEAEED) at three insertion sites are shown in grey shade and by solid lines drawn at the sequence top.
M.N. Singh et al. / Infection, Genetics and Evolution 41 (2016) 100–106 103
difference of the BbTRAP gene was found between different isolates
(Fig. 4).
4. การอภิปราย
ผลการศึกษารายงานลักษณะทางพันธุกรรมของยีน TRAP
ของ B. gibsoni จากสุนัขในประเทศอินเดีย การวิเคราะห์ระดับโมเลกุลของสุนัข
บี ปรสิต gibsoni ได้รับการรายงานก่อนหน้านี้ในเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ประเทศรวมทั้ง
อินเดียบังคลาเทศ, ญี่ปุ่น, เกาหลี, ไต้หวันและมาเลเซีย (Inokuma
et al, 2004;. Miyama et al, 2005;. ลี, et al, 2009, 2010;. Mokhtar et al, .
ปี 2013 ดั et al, 2014;.. Terao, et al, 2015) ในประเทศอินเดีย, การศึกษาล่าสุด
ใน 18S rRNA ยีนและ-1 จาก 13 บี gibsoni แยกจากสุนัขใน
ภาคเหนือและภาคตะวันออกเฉียงเหนือรัฐได้ดำเนินการเพื่อยืนยันปรสิต
เป็นบี gibsoni (ดั et al., 2014) ผู้เขียนพบว่าไม่มีทางพันธุกรรม
รูปแบบในสายพันธุ์อินเดียของ B. gibsoni อยู่บนพื้นฐานของ 18S rRNA
ยีนและ-1 และลำดับสายพันธุ์เหล่านี้เป็น 100% เหมือนกันกับ
บี gibsoni เอเชีย 2 (ภาคยานุวัติไม่มี. AF175301) อย่างไรก็ตามในการพิจารณา
ความหลากหลายทางพันธุกรรมในบี gibsoni หมุนเวียนในส่วนหนึ่งของอินเดียนี้
ยีน TRAP ไม่ได้ถูกนำมาใช้เป็นเครื่องหมายโดยนักเขียนเหล่านี้ การวิเคราะห์ลำดับ
ของ BgTRAP ชิ้นส่วนที่แตกต่างกันของยีนบี gibsoni แยกจากทางเหนือ
และชิ้นส่วนภาคตะวันออกเฉียงเหนือของประเทศอินเดียในการศึกษาแสดงให้เห็นว่าทางพันธุกรรม
รูปแบบภายในสายพันธุ์เหล่านี้ เหล่านี้บี gibsoni สายพันธุ์ทางพันธุกรรมถูก
กระจายอย่างเท่าเทียมกันในทั้งสี่รัฐ การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมนี้ส่วนใหญ่
สนับสนุนโดยลำดับซ้ำ Hexapeptide, Tetrapeptide
และ Dipeptide ตามลำดับอยู่ในโปรตีนกับดักในเชื้อ
ของอินเดียและบังคลาเทศ นอกจากนี้ยังมีความหลากหลายตามความยาวของ 2193-2373 BP
(เนื่องจากการลบและการแทรกของลำดับซ้ำ) ในกับดัก
cDNAs ของ gibsoni บีที่แตกต่างกันแยกและเอื้อต่อพันธุกรรมของพวกเขา
แปรปรวนได้รับรายงานในฐานข้อมูลทั่วโลก.
phylogenetic ต้นไม้ของ BgTRAP เศษยีน อย่างชัดเจนแสดงให้เห็น
ว่าบี gibsoni ปรสิตในอินเดียและบังคลาเทศที่ใช้ร่วมกันทางพันธุกรรมที่พบบ่อย
คลัสเตอร์นั้นอยู่ห่างจากบี gibsoni ตรวจพบในประเทศเอเชียตะวันออกเฉียงใต้.
ผลที่ได้นี้แสดงให้เห็นว่าปรสิตกระจายอยู่ในอินเดียและ
บังคลาเทศอาจจะไม่ได้รับการแนะนำมาจาก East- เอเชีย
ประเทศ ต้นไม้ยังพบว่ายีนดักรูปแบบที่แตกต่างกัน
ของคลัสเตอร์ระหว่างบีบี gibsoni และ bovis สายพันธุ์และพันธุกรรม
รูป 2. การจัดตำแหน่งของเบสลำดับ 19 BgTRAP เศษยีน (855 BP) ที่ได้รับจาก 19 สายพันธุ์ของ B. gibsoni ในการศึกษาจากสุนัขในประเทศอินเดีย ควบคู่ดีเอ็นเอซ้ำที่สอดคล้องกัน
ถึงสามซ้ำเปปไทด์ (DQTD, PH และ EEAEED) ที่สามเว็บไซต์แทรกจะแสดงในที่ร่มสีเทาและวาดเส้นทึบที่ด้านบนลำดับ.
MN ซิงห์, et al / การติดเชื้อพันธุศาสตร์และวิวัฒนาการ 41 (2016) 100-106 103
ความแตกต่างของยีน BbTRAP ถูกพบระหว่างสายพันธุ์ที่แตกต่างกัน
(รูปที่. 4)
การแปล กรุณารอสักครู่..

4 . การอภิปรายปัจจุบันรายงานศึกษาลักษณะทางพันธุกรรมของยีนดักของ gibsoni จากสุนัขในอินเดีย การวิเคราะห์ระดับโมเลกุลของเขี้ยวB . gibsoni ปรสิตมีรายงานก่อนหน้านี้ในประเทศเอเชียตะวันออก ได้แก่อินเดีย , บังคลาเทศ , ญี่ปุ่น , เกาหลี , ไต้หวันและมาเลเซีย ( อินุคุมะet al . , 2004 ; มิยาม่า et al . , 2005 ; ลี et al . , 2009 , 2010 mokhtar et al . ,2013 Mandal et al . , 2014 ; terao et al . , 2015 ) ผลการศึกษาล่าสุดในอินเดียบนยีน 18S rRNA และ its-1 13 พ. gibsoni ที่แยกได้จากสุนัขเหนือ และรัฐภาคตะวันออกเฉียงเหนือมีวัตถุประสงค์เพื่อยืนยันปรสิตเป็นบี gibsoni ( Mandal et al . , 2010 ) ผู้เขียนพบว่าไม่มีทางพันธุกรรมการเปลี่ยนแปลงในอินเดีย พบว่า gibsoni ขึ้นอยู่กับ 18S rRNA Bยีนและ its-1 ลำดับและจำนวน 100% เหมือนB . gibsoni asia-2 ( หนังสือไม่ af175301 ) อย่างไรก็ตาม การความหลากหลายทางพันธุกรรมในพ. gibsoni หมุนเวียนในส่วนนี้ของอินเดียยีนกับดักไม่ได้ใช้เป็นเครื่องหมาย โดยผู้เขียนเหล่านี้ การวิเคราะห์ลำดับของยีนที่แตกต่างกัน bgtrap เศษ . gibsoni ไอโซเลทจากเหนือและภาคอีสานบางส่วนของอินเดียในการศึกษาครั้งนี้พบว่าพันธุกรรมการเปลี่ยนแปลงภายในของเชื้อ เหล่านี้เป็น gibsoni พันธุกรรมสายพันธุ์ Bการกระจายอย่างเท่าเทียมกันในเหล่านี้สี่รัฐ การแปรผันทางพันธุกรรมนี้ส่วนใหญ่จะเป็นสนับสนุนโดยทำซ้ำลำดับของ hexapeptide เตตระเพปไทด์ ,และ ไดเพปไทด์ ตามลำดับ ปัจจุบันอยู่ในกับดักโปรตีนในเลทของอินเดียและบังคลาเทศ นอกจากนี้ ความหลากหลายของความยาว 2193 – 2373 BP( เนื่องจากการลบแทรกของลำดับและทำซ้ำในกับดักcdnas แตกต่างกัน gibsoni สายพันธุ์ B และเอื้อต่อพันธุกรรมซึ่งมีรายงานในฐานข้อมูลทั่วโลกต้นไม้วิวัฒนาการของยีน พบเศษ bgtrap อย่างชัดเจนที่บี gibsoni ปรสิตในอินเดียและบังคลาเทศที่เหมือนกันคือ พันธุกรรมกลุ่มที่ห่างจาก B gibsoni ตรวจพบในประเทศในเอเชียตะวันออกผลที่ได้นี้แสดงให้เห็นว่าปรสิตกระจายในอินเดีย และบังคลาเทศอาจได้รับการแนะนำจากเอเชียตะวันออกประเทศ ต้นไม้ยังพบว่ากับดักยีนรูปแบบที่แตกต่างกันกลุ่มระหว่างพ. gibsoni และ B bovis สายพันธุ์และพันธุกรรมรูปที่ 2 การเรียงตัวของลำดับเบสของยีน 19 bgtrap เศษ ( 855 BP ) ที่ได้จาก 19 ไอโซเลทของ gibsoni ในการศึกษาจากสุนัขในอินเดีย ตีคู่ซ้ำที่ดีเอ็นเอ3 ทำซ้ำ เปปไทด์ ( dqtd pH และ eeaeed ) ที่ 3 แทรกเว็บไซต์จะแสดงในเฉดสีเทาและแข็งโดยใช้เส้นวาดในลำดับสูงสุดm.n. Singh et al . / การติดเชื้อพันธุศาสตร์และวิวัฒนาการ 41 ( 2016 ) 100 – 106 103ความแตกต่างของยีนที่แตกต่างกัน bbtrap พบระหว่างไอโซเลท( รูปที่ 4 )
การแปล กรุณารอสักครู่..
