Effects of promoting the growth of

Effects of promoting the growth of plants involve not only functions of these genes, but also a สปีชีส์ closely related to Bacillus graminis which is difficult to culture and is a bacteria สปีชีส์ that is contained in the population of microorganisms ที่ระบุเป็น เชื้อปลูกเธอร์โมไฟล์ MIROKU M2K. Bacillus graminis is a microbial endophyte living in symbiosis with plants, and thus is supposed to be likely to contribute to the promotion of the growth of the plants.
[0057]
3. Evaluation of the ability to inhibit the generation of a greenhouse gas, ไดไนโตรเจน มอนออกไซด์
Arabidopsis thaliana was used as a model plant, and experiments were carried out in KUREHA culture soil (surface soil of a depth of 5 cm) as a nutrient soil. In brief, after vernalization treatment was applied overnight at 4°C, cultivation was carried out for
21 days in a temperature-controlled room (at 23°C) under 24-hour light conditions at an illuminance of 10,000 lux, with 100 ml of water being added every other day.
[0058]
As shown in รูป 6, also under an atmosphere containing acetylene, the soil to which the material according to the การประดิษฐ์นี้ had been added resulted in a great decrease in the concentration of ไอออนไนเตรต in the soil, whereas the soil with no addition was difficult to decrease the concentration of ไอออนไนเตรต in the soil. Since acetylene inhibits the reaction from N20 to N2, its inhibitory reaction can be used to detect N20 by gas chromatography. Accordingly, in the case of a soil where N20 is generated, N20
will be detected also under an atmosphere in which acetylene is not mixed; in the case of a soil where N2 is generated, N20 can be detected only under an atmosphere in which acetylene is mixed. As shown in รูป 7, the soil to which the material according to the การประดิษฐ์นี้ had been added did not allow the detection of N20 under conditions of the soil that had not been subjected to acetylene blockage. On the other hand, the soil that had been subjected to acetylene blockage allowed N20 to be detected. Therefore, it turned out that this soil had a property of preferentially emitting N2. From these, it can be said that ไอออนไนเตรต in the soil are denitrified as N2 gas.
To search genes that promote these reactions, PCR detection of such genes was performed, for example, by reference to primer sequences described in Throback IN et al. (2004) Reassessing PCR primers targeting nirS, nirK and nosZ genes for community surveys of denitrifying bacteria with DGGE. FEMS Microbiol. Ecol. 49:401-417, which was used as a reference. The primers for NirK used the sequences of
5'-GGCGGCGCGCCGCCCGCCCCGCCCCCGTCGCCCGCCTCGATCAGATTGTG GTT-3' as a forward primer and 5'-ATCATGGTCCTGCCGCG-3' as a reverse primer. The primers for NirS used the sequences of
5'-GGCGGCGCGCCGCCCGCCCCGCCCCCGTCGCCCGACTTCGGATGCGTCTT GA-3' as a forward primer and 5'-GTCAACGTCAAGGAAACCGG-3' as a reverse primer. The primers for NosZ used, for example, the sequences of
5'-TGGGGNGAYNTBCAYCA-3' as a forward primer and
5'-GARCARAAGTTIGTRCARTA-3' as a reverse primer. References used were Scala DJ and Kerkhof LJ (1998) Nitrous oxide reductase (nosZ) gene-specific PCR primers for detection of denitrifiers and three nosZ genes from marine sediments. FEMS
Microbiology Letters 162:61-68; and Jones, C.M., Welsh, A., Throback, I.N., Dorsch, P., Bakken L.R., Hallin, S. (2011) Phenotypic and genotypic heterogeneity among closely related soil-borne N2- and N20-producing Bacillus isolates harboring the nosZ gene. FEMS Microbiol. Ecol. 76: 541-552. PCR results revealed that it was likely that genes of which the sequences are closely related to gene sequences encoding ดีไนตริฟิเคชัน enzymes derived from the genus Bradyhizobium, Herbaspirillum, and Mesorhizobium work.

Comparison of sequence homologies between ดีไนตริฟิเคชัน genes derived Table 5 from the material according to the การประดิษฐ์นี้
deposit
No. no. Closely related สปีชีส์ Identity (%)
S-1 AB686171 Bradyhizobium sp. TSA44 84
S-2 AB686172 Herbaspirillum sp. TS020-1 96
S-3 AB686170 Mesorhizobium sp. TSA41b 97


[0061]

Table 5 indicates the homology between ดีไนตริฟิเคชัน-associated genes
included in the วัสดุเฉพาะทาง according to the การประดิษฐ์นี้ and ดีไนตริฟิเคชัน genes in some standard strains.
[0062]

4. Evaluation of nitrogen fixation
Arabidopsis thaliana was used as a model plant, and experiments were carried out in KUREHA culture soil (surface soil of a depth of 5 cm) as a nutrient soil. In brief, after vernalization treatment was applied overnight at 4°C, cultivation was carried out for
21 days in a temperature-controlled room (at 23°C) under 24-hour light conditions at an illuminance of 10,000 lux, with 100 ml of water being added every other day. The degree of dryness of the soil (decrease in the water content) was regulated by extending the time interval of addition of water by a few days.
[0063]
As shown in รูป 8, the concentration of ammonium ions within the body of Arabidopsis thaliana te

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผลของการส่งเสริมการเจริญเติบโตของพืชเกี่ยวข้องกับฟังก์ชันไม่เพียงของยีนเหล่านี้ แต่ยัง สปีชีส์ที่สัมพันธ์ใกล้ชิดกับแบคทีเรีย graminis ซึ่งเป็นการยากที่วัฒนธรรม และเป็นสปีชีส์แบคทีเรียที่มีอยู่ในประชากรของจุลินทรีย์ที่ระบุเป็นเชื้อปลูกเธอร์โมไฟล์ MIROKU M2K Graminis บา endophyte เชื้อจุลินทรีย์ที่อาศัยอยู่ที่ประสมประสานกันกับพืช และดังนั้น ควรจะเป็นแนวโน้มที่จะมีส่วนร่วมในการส่งเสริมการเจริญเติบโตของพืช [0057]3. ประเมินความสามารถในการยับยั้งการสร้างก๊าซเรือนกระจก ไดไนโตรเจนมอนออกไซด์ใช้ Arabidopsis thaliana เป็นพืชรุ่น และทดลองดำเนินการในดินวัฒนธรรม KUREHA (ผิวดินลึก 5 ซม.) เป็นดินที่สารอาหาร สรุป หลังจาก vernalization รักษาใช้ข้ามคืนที่อุณหภูมิ 4° C เพาะปลูกดำเนินการสำหรับวันที่ 21 ในห้องควบคุมอุณหภูมิ (ที่อุณหภูมิ 23° C) ภายใต้เงื่อนไข 24 ชั่วโมงแสงที่การสิ้นของ 10,000 ลักซ์ กับ 100 มิลลิลิตรของน้ำถูกเพิ่มทุกวัน [0058]ดังแสดงในรูป 6 ยังภายใต้บรรยากาศที่ประกอบด้วยอะเซทิลีน ดินที่มีการเพิ่มวัสดุตามการประดิษฐ์นี้ที่ผลในการลดความเข้มข้นของไอออนไนเตรตในดิน ดีขณะดินด้วยการไม่ยุ่งยากเพื่อลดความเข้มข้นของไอออนไนเตรตในดิน ตั้งแต่อะเซทิลีนยับยั้งปฏิกิริยาต่อจาก N20 N2 ปฏิกิริยาของ inhibitory สามารถใช้ตรวจหา N20 โดย chromatography ก๊าซ ดังนั้น ในกรณีที่เป็นดินที่ถูกสร้าง N20, N20จะตรวจพบยังภายใต้บรรยากาศที่อะเซทิลีนจะผสม ในกรณีที่เป็นดินที่สร้าง N2, N20 สามารถถูกตรวจพบภายใต้บรรยากาศที่ผสมอะเซทิลีน ดังแสดงในรูป 7 ดินที่มีการเพิ่มวัสดุตามการประดิษฐ์นี้ไม่อนุญาตให้ตรวจหา N20 ภายใต้เงื่อนไขของดินที่ไม่ได้ผ่านการอุดตันของอะเซทิลีน บนมืออื่น ๆ ดินที่ได้ผ่านการการอุดตันของอะเซทิลีนได้ N20 การตรวจพบ ดังนั้น มันเปิดออกที่ดินนี้มีคุณสมบัติเป็นเปล่ง N2 จากเหล่านี้ ได้ว่า ไอออนไนเตรตว่าในดินมี denitrified เป็นก๊าซ N2 การค้นหายีนที่ส่งเสริมปฏิกิริยาเหล่านี้ PCR ตรวจหายีนดังกล่าวดำเนินการ เช่น โดยลำดับรองพื้นที่อธิบายไว้ใน Throback IN et al. (2004) กำหนดเป้าหมายยีนต่าง nirK และ nosZ สำหรับการสำรวจชุมชนของ denitrifying แบคทีเรียกับ DGGE ไพร Reassessing PCR เมอร์ FEMS Microbiol Ecol. 49:401-417 ซึ่งถูกใช้เป็นการอ้างอิง ไพรเมอร์สำหรับ NirK ใช้ลำดับของ 5'-GGCGGCGCGCCGCCCGCCCCGCCCCCGTCGCCCGCCTCGATCAGATTGTG GTT-3' เป็นรองพื้นไปข้างหน้าและ 5'-ATCATGGTCCTGCCGCG-3' เป็นรองพื้นย้อนกลับ ไพรเมอร์สำหรับต่างใช้ลำดับของ5'-GGCGGCGCGCCGCCCGCCCCGCCCCCGTCGCCCGACTTCGGATGCGTCTT GA-3' เป็นรองพื้นไปข้างหน้าและ 5'-GTCAACGTCAAGGAAACCGG-3' เป็นรองพื้นย้อนกลับ ไพรเมอร์สำหรับ NosZ ใช้ เช่น ลำดับของ 5'-TGGGGNGAYNTBCAYCA-3' เป็นรองพื้นไปข้างหน้า และ5'-GARCARAAGTTIGTRCARTA-3' เป็นรองพื้นย้อนกลับ อ้างอิงที่ใช้เป็น Scala DJ และ Kerkhof LJ (1998) ไนตรัสออกไซด์ reductase (nosZ) ยีนเฉพาะ PCR ไพรเมอร์สำหรับการตรวจหา denitrifiers และยีน nosZ สามจากตะกอนทะเล FEMS จุลอักษร 162:61-68 และโจนส์ C.M. เวลช์ A., I.N., Throback, Dorsch, P., Bakken L.R., Hallin, S. heterogeneity ไทป์ และจีโนไทป์ (2011) ระหว่างที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดดินพัดพา N2 และ N20-ผลิตแบคทีเรียที่แยกเก็บงำยีน nosZ FEMS Microbiol Ecol. 76:541-552 ผล PCR เปิดเผยว่า มันเป็นไปได้ว่า ยีนที่ลำดับที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับลำดับยีนเอนไซม์ดีไนตริฟิเคชันที่มาจากสกุล Bradyhizobium, Herbaspirillum การเข้ารหัส และทำงาน Mesorhizobiumตาราง 5 มาเปรียบเทียบกับ homologies ลำดับระหว่างยีนดีไนตริฟิเคชันวัสดุตามการประดิษฐ์นี้การเงินฝากไม่ใช่ ไม่ใช่ ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดสปีชีส์รหัสประจำตัว (%)TSA44 เอสพี Bradyhizobium S-1 AB686171 84S-2 AB686172 Herbaspirillum 96 TS020-1 เอสพีS-3 AB686170 Mesorhizobium 97 TSA41b เอสพี[0061]ตาราง 5 แสดง homology ระหว่างยีนที่เกี่ยวข้องดีไนตริฟิเคชันรวมอยู่ในวัสดุเฉพาะทางตามยีนการประดิษฐ์นี้และดีไนตริฟิเคชันในบางสายพันธุ์มาตรฐาน[0062]4. ประเมินการตรึงไนโตรเจนใช้ Arabidopsis thaliana เป็นพืชรุ่น และทดลองดำเนินการในดินวัฒนธรรม KUREHA (ผิวดินลึก 5 ซม.) เป็นดินที่สารอาหาร สรุป หลังจาก vernalization รักษาใช้ข้ามคืนที่อุณหภูมิ 4° C เพาะปลูกดำเนินการสำหรับวันที่ 21 ในห้องควบคุมอุณหภูมิ (ที่อุณหภูมิ 23° C) ภายใต้เงื่อนไข 24 ชั่วโมงแสงที่การสิ้นของ 10,000 ลักซ์ กับ 100 มิลลิลิตรของน้ำถูกเพิ่มทุกวัน ระดับการแห้งของดิน (ลดลงในปริมาณน้ำ) ถูกควบคุม โดยการขยายช่วงเวลาของน้ำกี่วัน[0063]ดังแสดงในรูป 8 ความเข้มข้นของแอมโมเนียไอออนในตัว Arabidopsis thaliana te

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลของการส่งเสริมการเจริญเติบโตของพืชที่เกี่ยวข้องกับฟังก์ชั่นไม่เพียง แต่ของยีนเหล่านี้ แต่ยังมีสปีชีส์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับ Bacillus graminis ซึ่งเป็นเรื่องยากในการเพาะเลี้ยงและเป็นเชื้อแบคทีเรียสปีชีส์ที่มีอยู่ในประชากรของจุลินทรีย์ที่ระบุ เป็นเชื้อปลูกเธอร์โมไฟล์โระกุ M2K Bacillus graminis เป็น endophyte จุลินทรีย์ที่อาศัยอยู่ใน symbiosis กับพืชและจึงควรจะมีแนวโน้มที่จะมีส่วนร่วมในการส่งเสริมการเจริญเติบโตของพืชได้.
[0057]
3 การประเมินความสามารถในการยับยั้งการสร้างก๊าซเรือนกระจกที่ไดไนโตรเจนมอนออกไซด์
Arabidopsis thaliana ถูกนำมาใช้เป็นพืชรุ่นและทดลองดำเนินการใน Kureha วัฒนธรรมของดิน (ดินพื้นผิวของความลึก 5 เซนติเมตร) เป็นสารอาหารในดิน ในช่วงสั้น ๆ หลังการรักษา vernalization ถูกนำมาใช้ในชั่วข้ามคืนที่ 4 ° C, การเพาะปลูกได้ดำเนินการสำหรับ
21 วันในห้องควบคุมอุณหภูมิ (23 ° C) ภายใต้สภาพแสง 24 ชั่วโมงที่สว่าง 10,000 ลักซ์โดยมี 100 มิลลิลิตร น้ำที่เพิ่มเข้ามาทุกวัน ๆ .
[0058]
ดังแสดงในรูปที่ 6 ยังอยู่ภายใต้บรรยากาศที่มีอะเซทิลีนดินที่วัสดุให้เป็นไปตามการประดิษฐ์นี้ได้รับการเพิ่มผลในการลดลงอย่างมากในความเข้มข้นของไอออนไนเต รตในดินในขณะที่ดินด้วยนอกจากนี้ไม่เป็นเรื่องยากที่จะลดความเข้มข้นของไอออนไนเตรตในดิน ตั้งแต่อะเซทิลีนยับยั้งปฏิกิริยาจาก N20 จะ N2 ปฏิกิริยาการยับยั้งของมันสามารถนำมาใช้ในการตรวจสอบโดย N20 แก๊ส chromatography ดังนั้นในกรณีของดินที่ N20 ถูกสร้างขึ้นที่ N20
จะถูกตรวจพบยังอยู่ภายใต้บรรยากาศที่อะเซทิลีนไม่ผสม ในกรณีของดินที่ N2 ถูกสร้างขึ้นที่ N20 สามารถตรวจพบได้เฉพาะภายใต้บรรยากาศที่มีการผสมสารเคมี ดังแสดงในรูปที่ 7 ดินที่วัสดุให้เป็นไปตามการประดิษฐ์นี้ได้รับการเพิ่มไม่อนุญาตให้มีการตรวจสอบของ N20 ภายใต้เงื่อนไขของดินที่ไม่ได้รับภายใต้การอุดตันอะเซทิลีน บนมืออื่น ๆ ดินที่ได้รับภายใต้การอุดตันได้รับอนุญาตอะเซทิลีน N20 ที่จะตรวจพบ ดังนั้นมันกลับกลายเป็นว่าดินนี้มีคุณสมบัติพิเศษในการเปล่ง N2 จากนี้ก็อาจกล่าวได้ว่าไอออนไนเตรตในดินที่มีการ denitrified เป็น N2 ก๊าซ.
ในการค้นหายีนที่ส่งเสริมปฏิกิริยาเหล่านี้ตรวจสอบ PCR ของยีนดังกล่าวได้ดำเนินการเช่นโดยการอ้างอิงถึงไพรเมอร์ลำดับที่อธิบายไว้ใน Throback ใน et al, (2004) ไพรเมอร์ reassessing PCR กำหนดเป้าหมาย nirS, nirK และ nosZ ยีนสำหรับการสำรวจชุมชน Denitrifying แบคทีเรีย DGGE FEMS Microbiol Ecol 49: 401-417 ซึ่งถูกใช้เป็นข้อมูลอ้างอิง ไพรเมอร์สำหรับ NirK ใช้ลำดับของ
5'-GGCGGCGCGCCGCCCGCCCCGCCCCCGTCGCCCGCCTCGATCAGATTGTG GTT-3 'เป็นไพรเมอร์ไปข้างหน้าและ 5'-ATCATGGTCCTGCCGCG-3' เป็นไพรเมอร์กลับ ไพรเมอร์สำหรับ Nirs ใช้ลำดับของ
5'-GGCGGCGCGCCGCCCGCCCCGCCCCCGTCGCCCGACTTCGGATGCGTCTT GA-3 'เป็นไพรเมอร์ไปข้างหน้าและ 5'-GTCAACGTCAAGGAAACCGG-3' เป็นไพรเมอร์กลับ ไพรเมอร์สำหรับ NosZ ใช้ตัวอย่างเช่นลำดับของ
5'-TGGGGNGAYNTBCAYCA-3 'เป็นไพรเมอร์ไปข้างหน้าและ
5'-GARCARAAGTTIGTRCARTA-3' เป็นไพรเมอร์กลับ อ้างอิงที่ใช้เป็นดีเจและสกาล่า Kerkhof LJ (1998) ก๊าซไนตรัสออกไซด์ reductase (nosZ) ยีนเฉพาะไพรเมอร์ PCR ในการตรวจหา denitrifiers และสามยีน nosZ ตะกอนจากทะเล FEMS
วิทยาจดหมาย 162: 61-68; และโจนส์, CM, เวลส์, a, Throback, IN, Dorsch พี Bakken LR, Hallin, S. (2011) ลักษณะปรากฏและความหลากหลายทางพันธุกรรมในหมู่ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดดินเป็นพาหะ N2- และ N20 ผลิต Bacillus แยกเก็บงำ nosZ ยีน. FEMS Microbiol Ecol 76: 541-552 ผล PCR เผยให้เห็นว่ามันเป็นไปได้ว่ายีนที่ลำดับที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับลำดับยีนดีไนตริฟิเคชันเอนไซม์ที่ได้มาจากพืชและสัตว์ Bradyhizobium, HERBASPIRILLUM และ Mesorhizobium ทำงาน. เปรียบเทียบ homologies ลำดับระหว่างดีไนตริฟิเคชัน ยีนที่ได้มาจากตารางที่ 5 จากวัสดุให้เป็นไปตามการประดิษฐ์นี้เงินฝากเลขที่ ไม่ เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดสปีชีส์ประจำตัว (%) S-1 AB686171 Bradyhizobium SP TSA44 84 S-2 AB686172 HERBASPIRILLUM SP TS020-1 96 S-3 AB686170 Mesorhizobium SP TSA41b 97 [0061] ตารางที่ 5 แสดงให้เห็นคล้ายคลึงกันระหว่างดีไนตริฟิเคชันยีน -associated รวมอยู่ในวัสดุเฉพาะทางตามการประดิษฐ์นี้และดีไนตริฟิเคชันยีนในบางสายพันธุ์มาตรฐาน. [0062] 4 การประเมินผลของการตรึงไนโตรเจนArabidopsis thaliana ถูกนำมาใช้เป็นพืชรุ่นและทดลองดำเนินการใน Kureha วัฒนธรรมของดิน (ดินพื้นผิวของความลึก 5 เซนติเมตร) เป็นสารอาหารในดิน ในช่วงสั้น ๆ หลังการรักษา vernalization ถูกนำมาใช้ในชั่วข้ามคืนที่ 4 ° C, การเพาะปลูกได้ดำเนินการสำหรับ21 วันในห้องควบคุมอุณหภูมิ (23 ° C) ภายใต้สภาพแสง 24 ชั่วโมงที่สว่าง 10,000 ลักซ์โดยมี 100 มิลลิลิตร น้ำที่เพิ่มเข้ามาทุกวัน ๆ ระดับของความแห้งกร้านของดิน (ลดลงในปริมาณน้ำ) ถูกควบคุมโดยการขยายช่วงเวลาของการเติมน้ำโดยไม่กี่วัน. [0063] ดังแสดงในรูปที่ 8 ความเข้มข้นของแอมโมเนียมไอออนภายในร่างกายของ Arabidopsis thaliana Te