1. Introduction
In recent decades, a significant increase in global aquaculture
production was accompanied by intensified use of antimicrobials
to treat bacterial infections (Boxall, 2010). Cabello et al. (2013)
reported that 80% antibiotics used in aquaculture enter the water
environment. Antibiotic concentrations in the ecosystem are high
enough to exert selective pressure on bacteria by completely or
partially inhibiting wild-type (sensitive to antimicrobials) bacterial
populations (Tello et al., 2012). This process alters biodiversity in
aquatic environments and the microbiota characteristic of water
animals.
Antibiotic-resistant bacteria are increasingly often found in the
vicinity of fish farms where antimicrobials are used, which points
to a causal relationship between these two phenomena
(Guardabassi et al., 2000; Schmidt et al., 2000). Bacterial resistance
to antibiotics is determined by genes located on the chromosome
or mobile genetic elements, such as plasmids, transposons and
integrons (Korzeniewska and Harnisz, 2013), which facilitates their
transfer between different bacterial species. In view of the above,
antibiotic-resistant bacteria (ARB) and antibiotic resistance genes
http://dx.doi.org/10.1016/j.chemosphere.2015.01.035
0045-6535/ 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.
⇑ Corresponding author. Tel.: +48 89 5234557; fax: +48 89 5234532.
E-mail address: monika.harnisz@uwm.edu.pl (M. Harnisz).
Chemosphere 128 (2015) 134–141
Contents lists available at ScienceDirect
Chemosphere
journal homepage: www.elsevier.com/locate/chemosphere
(ARGs) have been identified as contaminants of emerging concern
(Pruden et al., 2006). A knowledge of the sources and mechanisms
of ARB and ARG dissemination is required because their proliferation
and transfer poses a serious public health risk. The knowledge
will support the development of effective strategies for controlling
antibiotic resistance and assessing human health risks.
In practice, ARB and ARGs may be more widespread in aquacultures
because most studies analyze resistance with only culturedbased
methods (Guardabassi et al., 2000; Schmidt et al., 2000). Culture-independent
methods, including measurements of gene copy
numbers by quantitative polymerase chain reaction (qPCR), provide
a less biased estimation of ARGs in the environment. The number of
ARGs in marine aquacultures has been investigated by very few
studies (Tamminen et al., 2011; Gao et al., 2012; Di Cesare et al.,
2013; Muziasari et al., 2014), and it has never been analyzed in
freshwater fish farms.
Tetracyclines are widely used in aquaculture, in particular to
control furunculosis in salmonids, and oxytetracycline is a drug
of first choice in the Polish fish farming industry (www.wetgiv.
gov.pl). However, the continued widespread use of antibiotics
has led to the development of tetracycline-resistant microorganisms
in all farming operations, from fish feed (Kerry et al., 1995)
to water that circulates in and out of the pond (Miranda et al.,
2003). Our previous studies (Harnisz et al., 2011; Harnisz, 2013)
demonstrated that tetracycline-resistant (tetR
) bacteria are sensitive
to changes in the physicochemical parameters of water and
antibiotic concentrations and that they are more abundant in polluted
environments. Similar results were reported by Chen et al.
(2013a) who confirmed that water contamination levels can be
analyzed based on tetracycline resistance genes.
The aim of this study was to assess the impact of a freshwater
fish farm on an antibiotic-resistant bacterial community based
on the prevalence of tetracycline-resistant bacteria (TRB) and tetracycline
resistance (tet) genes. Two parallel approaches were used
to examine the prevalence of TRB and tet genes: a culture-based
method involving standard PCR, and a method relying on quantitative
PCR. To our knowledge, this paper makes the first attempt to
investigate antibacterial resistance in freshwater fish farms of Central-Eastern
Europe with the use of qPCR
1. บทนำในทศวรรษล่าสุด การเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำทั่วโลกพร้อมกับการผลิต โดยใช้ intensified antimicrobialsการรักษาติดเชื้อแบคทีเรีย (Boxall, 2010) Cabello et al. (2013)รายงานว่า ยาปฏิชีวนะ 80% ที่ใช้ในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำป้อนน้ำสภาพแวดล้อม ความเข้มข้นของยาปฏิชีวนะในระบบนิเวศมีสูงเพียงพอที่จะใช้ความดันในแบคทีเรียโดยสมบูรณ์ หรือบางส่วน inhibiting แบคทีเรียชนิดป่า (ตรงตาม antimicrobials)ประชากร (Tello et al., 2012) กระบวนการนี้เปลี่ยนแปลงความหลากหลายทางชีวภาพในสภาพแวดล้อมทางน้ำและ microbiota ลักษณะของน้ำสัตว์แบคทีเรียดื้อยาปฏิชีวนะมากขึ้นมักพบในการปริมณฑลของฟาร์มปลาที่ antimicrobials ใช้ ซึ่งชี้การความสัมพันธ์เชิงสาเหตุระหว่างปรากฏการณ์เหล่านี้สอง(Guardabassi et al., 2000 ชมิดท์และ al., 2000) ต้านทานแบคทีเรียให้ยาปฏิชีวนะจะถูกกำหนด โดยยีนที่อยู่บนโครโมโซมหรือเคลื่อน องค์ทางพันธุกรรม เช่น plasmids, transposons และintegrons (Korzeniewska และ Harnisz, 2013), ซึ่งอำนวยความสะดวกของพวกเขาโอนย้ายระหว่างแบคทีเรียชนิดต่าง ๆ มุมมองด้านบนแบคทีเรียดื้อยาปฏิชีวนะ (ARB) และยีนต้านทานยาปฏิชีวนะhttp://dx.doi.org/10.1016/j.chemosphere.2015.01.0350045-6535 / 2015 Elsevier จำกัด สงวนลิขสิทธิ์ทั้งหมดผู้⇑ Corresponding โทร: 48 89 5234557 โทรสาร: 5234532 89 48ที่อยู่อีเมล์: monika.harnisz@uwm.edu.pl (Harnisz เมตร)Chemosphere 128 (2015) 134-141เนื้อหารายการ ScienceDirectChemosphereหน้าแรกของสมุดรายวัน: www.elsevier.com/locate/chemosphere(อาร์กิวเมนต์) ได้รับการระบุเป็นสารปนเปื้อนความกังวลเกิดขึ้น(Pruden และ al., 2006) รู้แหล่งและกลไกARB และอาร์กิวเมนต์ของค่า เผยแพร่จำเป็นเนื่องจากการแพร่หลายของพวกเขาและโอนย้ายซึ่งทำให้เกิดความเสี่ยงร้ายแรงสาธารณสุข ความรู้จะสนับสนุนการพัฒนากลยุทธ์ที่มีประสิทธิภาพในการควบคุมต้านทานยาปฏิชีวนะและการประเมินความเสี่ยงต่อสุขภาพมนุษย์ในทางปฏิบัติ ARB และอาร์กิวเมนต์อาจจะแพร่หลายมากขึ้นใน aquaculturesเพราะส่วนใหญ่ศึกษาวิเคราะห์ต้านทานกับ culturedbased เท่านั้นวิธีการ (Guardabassi et al., 2000 ชมิดท์และ al., 2000) ไม่ขึ้นกับวัฒนธรรมวิธีการ รวมถึงขนาดของสำเนาของยีนโดยปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสเชิงปริมาณ (qPCR), ให้ไม่มีลำเอียงประเมินของอาร์กิวเมนต์ในสิ่งแวดล้อม จำนวนอาร์กิวเมนต์ใน aquacultures ทางทะเลได้ถูกสอบสวนมากน้อยการศึกษา (Tamminen et al., 2011 เกา al. et, 2012 Di Cesare et al.,2013 Muziasari et al., 2014), และไม่เคยมีการวิเคราะห์ในฟาร์มปลาน้ำจืดTetracyclines ใช้ในสัตว์น้ำ โดยเฉพาะอย่างยิ่งการควบคุม furunculosis salmonids และออกซิเตตราไซคลีนเป็นยาทางเลือกแรกในโปแลนด์ปลาเกษตรอุตสาหกรรม (www.wetgivgov.pl) อย่างไรก็ตาม ใช้ยาปฏิชีวนะอย่างแพร่หลายอย่างต่อเนื่องได้นำไปพัฒนาจุลินทรีย์ทนเตตราไซคลีนในการดำเนินการทำการเกษตรทั้งหมด จากปลาเลี้ยง (เคอร์รี่และ al., 1995)น้ำที่หมุนเวียนอยู่และออกจากบ่อ (มิรันดา et al.,2003) การศึกษาก่อนหน้านี้ของเรา (Harnisz et al., 2011 Harnisz, 2013)แสดงว่าทนเตตราไซคลีน (tetR) แบคทีเรียมีความไวต่อการเปลี่ยนแปลงพารามิเตอร์ physicochemical น้ำ และความเข้มข้นของยาปฏิชีวนะและพวกเขาอุดมสมบูรณ์มากในเสียสภาพแวดล้อม มีรายงานผลที่คล้ายกันโดย Chen et al(2013a) ที่ยืนยันว่า น้ำปนเปื้อนระดับสามารถเตตราไซคลีนวิเคราะห์ตามยีนที่ต้านทานจุดมุ่งหมายของการศึกษานี้เป็นการ ประเมินผลกระทบของตัวปลาฟาร์มปลาในชุมชนเชื้อแบคทีเรียดื้อยาปฏิชีวนะอยู่ในส่วนของแบคทีเรียทนเตตราไซคลีน (TRB) เตตราไซคลีนยีนที่ต้านทาน (tet) ใช้วิธีสองขนานการตรวจสอบความชุกของ TRB และ tet: วัฒนธรรมโดยใช้วิธีที่เกี่ยวข้องกับ PCR มาตรฐาน และวิธีการพึ่งพาเชิงปริมาณPCR ความรู้ของเรา กระดาษนี้ทำครั้งแรกไปตรวจสอบความต้านทานยาฆ่าเชื้อโรคในฟาร์มปลาน้ำจืดของภาคตะวันออกกลางยุโรป มีการใช้ qPCR
การแปล กรุณารอสักครู่..

1.
บทนำในทศวรรษที่ผ่านมาเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำระดับโลกที่ผลิตมาพร้อมกับการใช้ความรุนแรงของยาต้านจุลชีพในการรักษาโรคติดเชื้อแบคทีเรีย(Boxall 2010) Cabello et al, (2013) รายงานว่า 80% ใช้ยาปฏิชีวนะที่ใช้ในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำใส่น้ำสภาพแวดล้อม ความเข้มข้นของยาปฏิชีวนะในระบบนิเวศที่สูงพอที่จะออกแรงดันคัดเลือกแบคทีเรียโดยสมบูรณ์หรือบางส่วนยับยั้งป่าชนิด(ความไวต่อยาต้านจุลชีพ) แบคทีเรียประชากร(Tello et al., 2012) กระบวนการนี้จะเปลี่ยนความหลากหลายทางชีวภาพในสภาพแวดล้อมที่มีน้ำและลักษณะ microbiota น้ำสัตว์. แบคทีเรียยาปฏิชีวนะที่ทนจะพบมากขึ้นมักจะอยู่ในบริเวณใกล้เคียงของฟาร์มเลี้ยงปลาที่ยาต้านจุลชีพที่ใช้ซึ่งชี้ไปที่ความสัมพันธ์เชิงสาเหตุระหว่างทั้งสองปรากฏการณ์(Guardabassi et al., 2000. ชมิดท์, et al, 2000) ต้านทานแบคทีเรียต่อยาปฏิชีวนะจะถูกกำหนดโดยยีนอยู่บนโครโมโซมหรือองค์ประกอบทางพันธุกรรมมือถือเช่นพลาสมิด, transposons และintegrons (Korzeniewska และ Harnisz 2013) ซึ่งอำนวยความสะดวกของพวกเขาการถ่ายโอนระหว่างแบคทีเรียชนิดที่แตกต่างกัน ในมุมมองของข้างต้นแบคทีเรียที่ทนต่อยาปฏิชีวนะ (ARB) และยีนต้านทานยาปฏิชีวนะ http://dx.doi.org/10.1016/j.chemosphere.2015.01.035 0045-6535 / 2015 เอลส์ จำกัด สงวนลิขสิทธิ์. ⇑ที่สอดคล้องกัน ผู้เขียน Tel .: +48 89 5234557; แฟ็กซ์: 48 89 5234532. อีเมล์:. monika.harnisz@uwm.edu.pl (เอ็ม Harnisz) Chemosphere 128 (2015) 134-141 รายการเนื้อหาที่มีอยู่ใน ScienceDirect Chemosphere วารสารหน้าแรก: www.elsevier.com/ ค้นหา / chemosphere (ARGs) ได้รับการระบุว่าเป็นสารปนเปื้อนของความกังวลที่เกิดขึ้นใหม่(Pruden et al., 2006) ความรู้ของแหล่งที่มาและกลไกของ ARB และการเผยแพร่หาเรื่องถูกต้องเนื่องจากการแพร่กระจายของพวกเขาและการถ่ายโอนposes ความเสี่ยงต่อสุขภาพของประชาชนอย่างร้ายแรง ความรู้ที่จะสนับสนุนการพัฒนากลยุทธ์ที่มีประสิทธิภาพในการควบคุมความต้านทานยาปฏิชีวนะและการประเมินความเสี่ยงต่อสุขภาพของมนุษย์. ในทางปฏิบัติ ARB และ ARGs อาจจะเป็นที่แพร่หลายมากขึ้นในสัตว์น้ำเพราะการศึกษาส่วนใหญ่วิเคราะห์ต้านทานกับculturedbased เพียงวิธีการ(Guardabassi et al, 2000;. ชมิดท์และ al., 2000) วัฒนธรรมอิสระวิธีการรวมทั้งการวัดของการคัดลอกยีนตัวเลขโดยวิธีPolymerase chain reaction เชิงปริมาณ (qPCR) ให้การประเมินลำเอียงน้อยARGs ในสภาพแวดล้อม จำนวนARGs ในสัตว์น้ำทางทะเลที่ได้รับการตรวจสอบโดยน้อยมากการศึกษา(Tamminen et al, 2011;. Gao et al, 2012;. Di Cesare, et al. 2013; Muziasari et al, 2014.) และมันไม่เคยมี การวิเคราะห์ในน้ำจืดฟาร์มเลี้ยงปลา. Tetracyclines ถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในการเพาะเลี้ยงสัตว์โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการควบคุมกระดูกในsalmonids และ oxytetracycline เป็นยาของตัวเลือกแรกในอุตสาหกรรมการเลี้ยงปลาโปแลนด์(www.wetgiv. gov.pl) อย่างไรก็ตามการใช้อย่างแพร่หลายอย่างต่อเนื่องของยาปฏิชีวนะได้นำไปสู่การพัฒนาของเชื้อจุลินทรีย์ทน tetracycline ในการดำเนินงานการเกษตรทั้งหมดจากอาหารปลา (เคอร์รี et al., 1995) ลงไปในน้ำที่ไหลเวียนเข้าและออกจากบ่อ (Miranda et al., 2003) การศึกษาก่อนหน้าของเรา (Harnisz et al, 2011;. Harnisz 2013) แสดงให้เห็นว่ายาทน (tetr) แบคทีเรียที่มีความไวต่อการเปลี่ยนแปลงในพารามิเตอร์ทางเคมีกายภาพของน้ำและความเข้มข้นของยาปฏิชีวนะและที่พวกเขามีความอุดมสมบูรณ์มากขึ้นในการปนเปื้อนในสภาพแวดล้อม ผลที่คล้ายกันได้รับรายงานจากเฉิน et al. (2013a) ซึ่งได้รับการยืนยันว่าระดับการปนเปื้อนน้ำสามารถวิเคราะห์บนพื้นฐานของยีนต้านทานยา. จุดมุ่งหมายของการศึกษาครั้งนี้คือการประเมินผลกระทบของน้ำจืดฟาร์มปลาในชุมชนแบคทีเรียทนต่อยาปฏิชีวนะตามความชุกของเชื้อแบคทีเรียทน tetracycline (ที่ TRB) และ tetracycline ต้านทาน (Tet) ยีน สองวิธีขนานถูกนำมาใช้ในการตรวจสอบความชุกของ TRB และยีน Tet นี้: วัฒนธรรมตามวิธีการที่เกี่ยวข้องกับวิธีPCR มาตรฐานและวิธีการอาศัยปริมาณPCR ความรู้ของเรากระดาษนี้จะทำให้ความพยายามครั้งแรกที่จะตรวจสอบความต้านทานต้านเชื้อแบคทีเรียในฟาร์มปลาน้ำจืดของกลางตะวันออกยุโรปที่มีการใช้qPCR
การแปล กรุณารอสักครู่..

1 . บทนำ
ในทศวรรษที่ผ่านมาเพิ่มขึ้นอย่างมากในการผลิต การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำ
ระดับโลกพร้อมกับการใช้ยาต้านจุลชีพ (
รักษาเชื้อแบคทีเรีย ( boxall , 2010 ) cabello et al . ( 2013 )
รายงานว่า 80% ยาปฏิชีวนะที่ใช้ในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำป้อนน้ำ
สภาพแวดล้อม ยาปฏิชีวนะความเข้มข้นในระบบนิเวศมีสูง
พอออกแรงดันเลือกในแบคทีเรียโดยสมบูรณ์หรือบางส่วนของ (
ยับยั้งไวต่อยาต้านจุลชีพ ) ประชากรแบคทีเรีย
( เทลโล่ et al . , 2012 ) กระบวนการนี้ทำลายความหลากหลายทางชีวภาพในน้ำ และไมโครไบโ ้า
สภาพแวดล้อมลักษณะของสัตว์น้ำ
.
แบคทีเรียดื้อยาปฏิชีวนะมากขึ้น มักพบในบริเวณใกล้เคียงของฟาร์มปลา
ที่ยาต้านจุลชีพที่ใช้ซึ่งคะแนน
เพื่อความสัมพันธ์เชิงสาเหตุระหว่างทั้งสองปรากฏการณ์
( guardabassi et al . , 2000 ; ชมิดท์ et al . , 2000 ) แบคทีเรียต้านทานยาปฏิชีวนะจะถูกกำหนดโดยยีน
ตั้งอยู่บนโครโมโซมหรือองค์ประกอบทางพันธุกรรม เช่น โทรศัพท์มือถือ เพื่อ transposons และ
integrons ( korzeniewska และ harnisz 2013 ) ซึ่งอำนวยความสะดวกในการถ่ายโอนระหว่างชนิดของ
แบคทีเรียที่แตกต่างกัน ในมุมมองด้านบน
แบคทีเรียต้านทานยาปฏิชีวนะ ( ARB ) และยีนที่ต้านทานยาปฏิชีวนะ
http : / / DX ดอย . org / 10.1016 / j.chemosphere . 2015.01.035
0045-6535 / 2015 นอกจากนี้ จำกัด .
⇑ที่สอดคล้องกันของผู้เขียน โทร . 48 89 5234557 ; โทรสาร : 48 89 5234532 .
e - mail address : monika.harnisz@uwm.edu.pl ( ม. harnisz ) .
เคโมสเฟียร์ 128 ( 2015 ) 134 - 141
เนื้อหารายการพร้อมบริการ
วารสารหน้าแรก : เคโมสเฟียร์www.elsevier . com / ค้นหา / เคโมสเฟียร์
( มีอาร์กิวเมนต์ ) ได้รับการระบุว่าเป็นสารปนเปื้อนของความกังวล
เกิดขึ้นใหม่ ( pruden et al . , 2006 ) ความรู้ของแหล่งที่มาและกลไก
ของ ARB arg เผยแพร่และเป็นเพราะการแพร่กระจายของพวกเขาและการถ่ายโอน
poses ความเสี่ยงสุขภาพของประชาชนอย่างร้ายแรง ความรู้
จะสนับสนุนการพัฒนากลยุทธ์ที่มีประสิทธิภาพเพื่อการควบคุม
ต้านทานยาปฏิชีวนะ และการประเมินความเสี่ยงต่อสุขภาพของมนุษย์
ในทางปฏิบัติและ ARB ARGs อาจจะแพร่หลายมากขึ้นใน aquacultures
เพราะการศึกษาส่วนใหญ่วิเคราะห์ความต้านทานที่มีเพียง culturedbased
วิธี ( guardabassi et al . , 2000 ; ชมิดท์ et al . , 2000 ) วัฒนธรรมอิสระ
วิธี เช่น การวัดเชิงปริมาณของตัวเลขคัดลอก
ยีนโดยปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอร์เรส ( qpcr ให้
)ไม่ลำเอียงประมาณมีอาร์กิวเมนต์ในสิ่งแวดล้อม จำนวน aquacultures มีอาร์กิวเมนต์ในทะเลได้
( มากน้อย โดยศึกษา tamminen et al . , 2011 ; เกา et al . , 2012 ; Di Cesare et al . ,
2013 ; muziasari et al . , 2010 ) และมันไม่เคยถูกใช้ในฟาร์มปลา
.
เตตร้าไซคลินใช้ กันอย่างแพร่หลายในการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำ โดยเฉพาะการควบคุมการกำจัดสารหนูใน salmonids
,และออกซิเตตราไซคลีนคือยา
ของทางเลือกแรกในโปแลนด์อุตสาหกรรมการเลี้ยงปลา ( www.wetgiv .
gov.pl ) อย่างไรก็ตาม ยังคงมีการใช้ยาปฏิชีวนะ
ได้นำไปสู่การพัฒนา ป้องกันเชื้อจุลินทรีย์ในการเกษตร tetracycline
ปฏิบัติการจากให้อาหารปลา ( Kerry et al . , 1995 )
น้ำที่ไหลเวียนในและออกจากบ่อ ( Miranda
et al . , 2003 ) การศึกษาก่อนหน้านี้ ( harnisz et al . ,2011 ; harnisz 2013 )
) ทนเตตราไซคลีน ( สี่
) แบคทีเรียมีความไวต่อการเปลี่ยนแปลงในค่า
และน้ำและความเข้มข้นของยาปฏิชีวนะและว่าพวกเขาจะอุดมสมบูรณ์มากขึ้นในสภาพแวดล้อมเสีย
ผลที่คล้ายกันได้รับรายงานโดย Chen et al .
( 2013A ) ที่ยืนยันว่า ระดับการปนเปื้อนน้ำสามารถวิเคราะห์จากยีนต้านทาน tetracycline
.
จุดมุ่งหมายของการศึกษานี้คือ เพื่อศึกษาถึงผลกระทบของฟาร์มปลาน้ำจืด
ยาปฏิชีวนะต้านแบคทีเรียชุมชน
บนความชุกของแบคทีเรียดื้อยาเตตร้าซัยคลิน ( tetracycline
trb ) และความต้านทาน ( Tet ) ยีน เส้นขนานสองวิธีได้แก่
เพื่อศึกษาความชุกและยีนของ trb เทต : วัฒนธรรมโดยวิธี PCR
เกี่ยวข้องกับมาตรฐานและวิธีการที่อาศัยเทคนิคเชิงปริมาณ
ความรู้ , กระดาษนี้จะทำให้ความพยายามแรก
ศึกษาแบคทีเรียต้านทานในปลาน้ำจืดฟาร์มกลางตะวันออก
ยุโรปด้วยการใช้ qpcr
การแปล กรุณารอสักครู่..
