Ordination analysis of sequences in

Ordination analysis of sequences included in the EzTaxon-e database. Complete sequence similarity matrices were generated from multiple sequence alignments (.1200 bp) and were converted to Jukes and Cantor distance matrices (Jukes & Cantor, 1969). Principal coordinate analyses were performed as previously described (Legendre, 1998). To reduce the computational cost of obtaining complete series of eigenvalues and eigenvectors, the power method algorithm was employed for approximating eigenvalues (Golub & van Loan, 1996). Three-dimensional ordination plots were generated from the resultant principal components using the R package

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การอบรมการวิเคราะห์ลำดับข้อมูลอี EzTaxon เมทริกซ์คล้ายลำดับที่สมบูรณ์เกิดจากการจัดลำดับหลายแนว (.1200 bp) และถูกแปลงเป็น Jukes และคันทอร์จากเมทริกซ์ (Jukes & คันทอร์ 1969) มีดำเนินการประสานงานวิเคราะห์หลักเป็นอธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (เลอฌ็องดร์ 1998) เพื่อลดต้นทุนคำนวณได้รับชุดที่สมบูรณ์ของลักษณะเฉพาะ และเวกเตอร์ อัลกอริทึมวิธีพลังงานถูกจ้างในระหว่างเวกเตอร์ (อย่างไร Golub และสินเชื่อรถตู้ 1996) ผืนบวชสามมิติสร้างขึ้นจากส่วนประกอบหลักผลแก่ใช้แพคเกจ R

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์การอุปสมบทของลำดับรวมอยู่ในฐานข้อมูล EzTaxon อี การฝึกอบรมความคล้ายคลึงกันลำดับที่สมบูรณ์ถูกสร้างขึ้นจากการจัดแนวหลายลำดับ (0.1200 bp) และได้รับการแปลงเป็นจุกส์และแคนเทอร์เมทริกซ์ระยะทาง (จุกส์และแคนเทอร์, 1969) ประสานงานวิเคราะห์หลักได้ดำเนินการตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (Legendre, 1998) เพื่อลดค่าใช้จ่ายในการคำนวณของการได้รับชุดที่สมบูรณ์ของค่าลักษณะเฉพาะและ eigenvectors, อัลกอริทึมวิธีอำนาจที่ใช้ในการประมาณค่าลักษณะเฉพาะ (Golub และรถตู้เงินกู้, 1996) แปลงบวชสามมิติถูกสร้างขึ้นจากองค์ประกอบหลักผลใช้แพคเกจอาร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ลำดับ eztaxon-e บรรพชารวมอยู่ในฐานข้อมูล สมบูรณ์เมทริกซ์ความเหมือนลำดับถูกสร้างขึ้นจากการลำดับหลาย ( 1200 BP ) และถูกแปลงและระยะทางที่เมทริกซ์จูกส์เกอ ( จูกส์&คันทอร์ , 1969 ) ติดต่อประสานงาน วิเคราะห์หลักการตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ( legendre , 1998 )เพื่อลดต้นทุน การคำนวณ การได้รับชุดสมบูรณ์ของแบกเซอร์ ฮัมบี้ วิธีการขั้นตอนวิธีสำหรับประมาณค่าพลังงานที่ใช้ ( โกเลิบ&รถตู้เงินกู้ , 1996 ) มิติที่ถูกสร้างขึ้นจากสามแปลงบวชซึ่งเป็นส่วนประกอบหลักใช้ R แพคเกจ