Following 454 sequencing of spruce

Following 454 sequencing of spruce needle samples across all four forests (all sites study) for the total fungal community, 209,267 sequence reads were generated. Of these, 142,578 (68%) passed quality filtering. In the part of the study aimed to compare the metabolically active fungal community to the total fungal community (i.e. community type) from trees in North Karelia, Finland (Finland RNA study), 454 sequencing of current year needles resulted in 108,144 reads of which 86,035 (80%) passed quality filtering. Across both studies, there were 1737 global OTUs (non-singletons) and 1127 global singletons. Non-fungal OTUs (30 OTUs, 29966 reads, 13% of all reads) were removed. The two datasets, namely the all sites study and the Finland RNA study, were analyzed separately. Following the removal of OTUs with fewer than 10 reads globally for each dataset, there were 513 fungal OTUs in the all sites study and 310 fungal OTUs in the Finland RNA study.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ต่อลำดับ 454 อย่างโก้เข็มทั่วป่าสี่ทั้งหมด (ทุกไซต์เรียนชุมชนเชื้อราทั้งหมด อ่านลำดับ 209,267 ถูกสร้างขึ้น เหล่านี้ 142,578 (68%) ผ่านการกรองคุณภาพ ในส่วนของการศึกษาที่มีวัตถุประสงค์เพื่อเปรียบเทียบชุมชนเชื้อราใช้งาน metabolically รวมชุมชนเชื้อรา (เช่นชุมชนประเภท) จากต้นไม้เหนือคาเรเลีย ฟินแลนด์ (ฟินแลนด์ RNA ศึกษา), ลำดับ 454 เข็มปีปัจจุบันผลใน 108,144 อ่านว่า 86,035 (80%) ผ่านการกรองคุณภาพ ในการศึกษาทั้งสอง มี 1737 OTUs ทั่วโลก (ไม่ใช่ singletons) และ 1127 singletons สากล ปลอดเชื้อรา OTUs (30 OTUs อ่าน 29966, 13% ของการอ่านทั้งหมด) ถูกเอาออก Datasets สอง คือทั้งหมดเว็บไซต์การศึกษาและการศึกษาฟินแลนด์ RNA ถูกวิเคราะห์แยกต่างหาก ต่อการกำจัด OTUs กับอ่านได้น้อยกว่า 10 ทั่วโลกในแต่ละชุดข้อมูล มี 513 OTUs เชื้อราในการศึกษาเว็บไซต์ทั้งหมดและ 310 OTUs เชื้อราในการศึกษาฟินแลนด์ RNA

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ต่อไปนี้ 454 ลำดับตัวอย่างต้นสนเข็มทั่วทั้งสี่ป่า (เว็บไซต์การศึกษาทั้งหมด) สำหรับชุมชนเชื้อรารวม 209,267 ลำดับอ่านถูกสร้างขึ้น ของเหล่านี้ 142578 (68%) ผ่านการกรองที่มีคุณภาพ ในส่วนของการศึกษามีวัตถุประสงค์เพื่อเปรียบเทียบชุมชนเชื้อราการใช้พลังงานเพื่อชุมชนเชื้อราทั้งหมด (เช่นประเภทชุมชน) จากต้นไม้ในนอร์เลีย, ฟินแลนด์ (ฟินแลนด์ศึกษา RNA) 454 ลำดับของเข็มปีปัจจุบันส่งผลให้ 108,144 อ่านที่ 86035 (80%) ผ่านการกรองที่มีคุณภาพ ข้ามการศึกษาทั้งสองมีอยู่ทั่วโลก 1737 Otus (Non-singletons) และ 1127 singletons ทั่วโลก ไม่ใช่เชื้อรา Otus (30 Otus, 29966 อ่าน 13% ของทั้งหมดอ่าน) ถูกถอดออก ทั้งสองชุดข้อมูลคือการศึกษาเว็บไซต์ทั้งหมดและการศึกษาที่ฟินแลนด์อาร์เอ็นเอที่ได้มาวิเคราะห์แยกต่างหาก ต่อไปนี้การกำจัดของ Otus ที่มีน้อยกว่า 10 อ่านทั่วโลกสำหรับแต่ละชุดข้อมูลที่มีเชื้อรา 513 Otus ในการศึกษาและเว็บไซต์ทั้งหมด 310 เชื้อรา Otus ในการศึกษาฟินแลนด์อาร์เอ็นเอ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ต่อไปนี้ถ้าจัดลำดับของต้นสนเข็มตัวอย่างทั้งสี่ป่า ( การศึกษา ) สำหรับชุมชนราทั้งหมด 209267 ลำดับอ่านขึ้น . ของเหล่านี้ 142578 ( 68% ) ผ่านคุณภาพการกรอง ในส่วนของการศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อเปรียบเทียบชุมชนรา metabolically งานชุมชนราทั้งหมด ( เช่นชนิดชุมชน ) จากต้นไม้เหนือเลีย , ฟินแลนด์ ( ฟินแลนด์ RNA การศึกษา ) , 454 ลำดับของเข็ม ปีปัจจุบัน ส่งผล 108144 อ่านซึ่ง 86035 ( 80% ) ผ่านคุณภาพการกรอง ทั้งการศึกษา มี 1737 ในทั่วโลก ( ไม่ singletons ) และตัว singletons ทั่วโลก . ไม่ใช่เชื้อราใน ( 30 ใน 29966 อ่าน , 13 เปอร์เซ็นต์ของคนอ่าน ) ออก สองชุดข้อมูล คือ เว็บไซต์ทั้งหมดที่ศึกษา และฟินแลนด์ ซึ่งศึกษาวิเคราะห์แยกต่างหาก ต่อไปนี้การกำจัดในจำนวนกว่า 10 อ่าน ) แต่ละชุดข้อมูลมีเป็นเชื้อราในในเว็บไซต์การศึกษาและพวกเชื้อราในในฟินแลนด์ซึ่งศึกษา