SUMMARYOrdered collections of Arabi

SUMMARY
Ordered collections of Arabidopsis thaliana lines containing mapped T-DNA insertions have
become an important resource for plant scientists performing genetic studies. Previous reports
have indicated that T-DNA insertion lines can have chromosomal translocations associated with
the T-DNA insertion site, but the prevalence of these rearrangements has not been well
documented. To determine the frequency with which translocations are present in a widely-used
collection of T-DNA insertion lines, we analyzed 64 independent lines from the Salk T-DNA
mutant collection. Chromosomal translocations were detected in 12 of the 64 lines surveyed
(19%). Two assays were used to screen the T-DNA lines for translocations: pollen viability and
genome-wide genetic mapping. Although the measurement of pollen viability is an indirect screen
for the presence of a translocation, all 11 of the T-DNA lines showing an abnormal pollen
phenotype were found to contain a translocation when analyzed using genetic mapping. A normal
pollen phenotype does not, however, guarantee the absence of a translocation. We observed one TDNA
line with normal pollen that nevertheless had a translocation based on genetic mapping
results. One additional phenomenon that we observed through our genetic mapping experiments
was that the T-DNA junctions on the 5′- and 3′-sides of a targeted gene can genetically separate
from each other in some cases. Two of the lines in our survey displayed this ‘T-DNA borders
separate’ phenomenon. Experimental procedures for efficiently screening T-DNA lines for the
presence of chromosomal abnormalities are presented and discussed.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

SUMMARYOrdered collections of Arabidopsis thaliana lines containing mapped T-DNA insertions havebecome an important resource for plant scientists performing genetic studies. Previous reportshave indicated that T-DNA insertion lines can have chromosomal translocations associated withthe T-DNA insertion site, but the prevalence of these rearrangements has not been welldocumented. To determine the frequency with which translocations are present in a widely-usedcollection of T-DNA insertion lines, we analyzed 64 independent lines from the Salk T-DNAmutant collection. Chromosomal translocations were detected in 12 of the 64 lines surveyed(19%). Two assays were used to screen the T-DNA lines for translocations: pollen viability andgenome-wide genetic mapping. Although the measurement of pollen viability is an indirect screenfor the presence of a translocation, all 11 of the T-DNA lines showing an abnormal pollenphenotype were found to contain a translocation when analyzed using genetic mapping. A normalpollen phenotype does not, however, guarantee the absence of a translocation. We observed one TDNAline with normal pollen that nevertheless had a translocation based on genetic mappingresults. One additional phenomenon that we observed through our genetic mapping experimentswas that the T-DNA junctions on the 5′- and 3′-sides of a targeted gene can genetically separatefrom each other in some cases. Two of the lines in our survey displayed this ‘T-DNA bordersแยก ' ปรากฏการณ์ ขั้นตอนการทดลองได้อย่างมีประสิทธิภาพคัดกรองรายการ T-ดีเอ็นเอสำหรับการของความผิดปกติของโครโมโซมจะนำเสนอ และกล่าวถึง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สรุป
สั่งคอลเลกชันของเส้น Arabidopsis thaliana บรรจุแมปแทรก T-DNA ได้
กลายเป็นทรัพยากรที่สำคัญสำหรับนักวิทยาศาสตร์พืชดำเนินการศึกษาทางพันธุกรรม รายงานก่อนหน้านี้
ได้แสดงให้เห็นว่าสายการแทรก T-DNA สามารถมีโครโมโซม translocations ที่เกี่ยวข้องกับ
เว็บไซต์แทรก T-DNA แต่ความชุกของ rearrangements เหล่านี้ไม่ได้รับการดี
เอกสาร การตรวจสอบความถี่ที่ translocations ที่มีอยู่ในใช้กันอย่างแพร่หลาย
คอลเลกชันของเส้นแทรก T-DNA เราวิเคราะห์เส้นอิสระ 64 จากซอล์ค T-DNA
คอลเลกชันที่กลายพันธุ์ translocations โครโมโซมถูกตรวจพบใน 12 ของ 64 บรรทัดสำรวจ
(19%) สองการตรวจได้ใช้วิธีการสกรีนเสื้อสายดีเอ็นเอสำหรับ translocations: ชีวิตเกสรและ
การทำแผนที่พันธุกรรมจีโนมทั้ง แม้ว่าการวัดค่าของการมีชีวิตเกสรเป็นหน้าจอทางอ้อม
การปรากฏตัวของการโยกย้ายทั้งหมด 11 ของสาย T-DNA แสดงเกสรผิดปกติ
ต้นพบว่ามีการโยกย้ายเมื่อวิเคราะห์โดยใช้การทำแผนที่พันธุกรรม ปกติ
ฟีโนไทป์เกสรไม่ได้ แต่รับประกันไม่มีการโยกย้าย เราสังเกต TDNA หนึ่ง
สอดคล้องกับเกสรปกติที่ยังคงมีการโยกย้ายอยู่บนพื้นฐานของการทำแผนที่พันธุกรรม
ผล หนึ่งปรากฏการณ์เพิ่มเติมที่เราสังเกตได้ผ่านการทดลองทำแผนที่พันธุกรรมของเรา
คือการที่ทางแยกเสื้อดีเอ็นเอ 5'- และ 3'ด้านของยีนเป้าหมายสามารถทางพันธุกรรมที่แยกต่างหาก
จากกันในบางกรณี สองของสายในการสำรวจที่แสดงนี้ 'T-DNA ชายแดน
แยกปรากฏการณ์ ขั้นตอนการทดลองอย่างมีประสิทธิภาพสำหรับการตรวจคัดกรองสาย T-DNA สำหรับ
การปรากฏตัวของโครโมโซมผิดปกติจะถูกนำเสนอและพูดคุยกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สรุป
สั่งคอลเลกชันของ Arabidopsis thaliana บรรทัดที่มีแมปใหม่ได้
t-dna กลายเป็นทรัพยากรสำคัญสำหรับพืช นักวิทยาศาสตร์แสดงการศึกษาทางพันธุกรรม รายงานก่อนหน้านี้ระบุว่า t-dna
แทรกบรรทัดสามารถโยกย้ายโครโมโซมที่เกี่ยวข้องกับการแทรก t-dna
เว็บไซต์ แต่ความชุกของ rearrangements เหล่านี้ยังไม่ได้รับเอกสารด้วย
.เพื่อตรวจสอบความถี่ที่โยกย้ายอยู่ในที่ใช้กันอย่างแพร่หลาย คอลเลกชันของ t-dna
แทรกบรรทัด เราวิเคราะห์ 64 เส้นอิสระจากโรคโปลิโอ t-dna
กลายพันธุ์ คอลเลกชัน โยกย้ายโครโมโซมพบว่า 12 จาก 64 เส้นสำรวจ
( 19% ) 2 ) ใช้หน้าจอ t-dna เส้นสำหรับโยกย้าย : ความมีชีวิตของละอองเกสรและ
genome-wide พันธุกรรมแผนที่แม้ว่าการวัดของความมีชีวิตของละอองเกสรเป็น
หน้าจอทางอ้อมสำหรับสถานะของการโยกย้าย ทั้งหมด 11 แห่ง t-dna เส้นแสดงการ pollen
ผิดปกติ พบว่ามีการเคลื่อนย้ายเมื่อวิเคราะห์โดยใช้แผนที่ทางพันธุกรรม เป็นเกสรที่มีปกติ
ไม่ได้ แต่รับประกันขาดโยกย้าย . เราพบหนึ่ง tdna
สายปกติ ละอองเกสรดอกไม้ ที่ยังคงมีการโยกย้ายตามผลการทำแผนที่
พันธุ อีกหนึ่งปรากฏการณ์ที่เราสังเกตได้ผ่านแผนที่พันธุกรรมการทดลอง
ที่ t-dna ทางแยกบน 5 ’ - 3 - ด้านนั้นเป็นเป้าหมายที่สามารถแยกยีนพันธุกรรม
จากแต่ละอื่น ๆ ในบางกรณี สองเส้นในการสำรวจของเราแสดงนี้ t-dna พรมแดน
' แยก ' ปรากฏการณ์ขั้นตอนการทดลองสำหรับการคัดกรองสายได้อย่างมีประสิทธิภาพ t-dna
ตนของตัวอสุจิจะถูกนำเสนอ และกล่าวถึง