Correlation between expression leve

Correlation between expression level of the
bovine DNAJA1 gene and meat tenderness was recently
found in Charolais longissimus thoracis muscle samples,
suggesting that this gene could play an important role in
meat tenderness. Here, we report the validation of polymorphisms
within the bovine DNAJA1 gene, and the haplotype
variability and extent of linkage disequilibrium in
the three main French beef breeds (Blonde d’Aquitaine,
Charolais, Limousin). Genotyping 18 putative SNPs
revealed that 16 SNPs were polymorphic within the breeds
tested. Two SNPs were removed from further analyses as
one SNP had a low genotyping call rate, while the other
SNP was not in Hardy–Weinberg equilibrium. The degree
of heterozygosity observed for the remaining 14 SNPs
varied between breeds, with Charolais being the breed with
the highest genetic variation and Blonde d’Aquitaine the
lowest. Linkage disequilibrium and haplotype structure of
DNAJA1 were different between breeds. Eighteen different
haplotypes, including three shared by all breeds, were
discovered, and two to three tag SNPs (depending on the
breed) are sufficient to capture all the genetic variability
seen in these haplotypes. The results of this study will
facilitate the design of optimal future association studies
evaluating the role of the DNAJA1 gene in meat tenderness

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความสัมพันธ์ระหว่างระดับการแสดงออกของการวัว DNAJA1 ยีนและเนื้อความอ่อนโยนของคุณถูกล่าสุดพบในตัวอย่างที่ Charolais ริบบิ้น thoracis กล้ามเนื้อแนะนำว่า ยีนนี้อาจมีบทบาทสำคัญในความนุ่มของเนื้อ ที่นี่ เรารายงานการตรวจสอบของ polymorphismsภายในยีน DNAJA1 วัว และ haplotypeความแปรปรวนและขอบเขตของความเชื่อมโยง disequilibrium ในภาษาฝรั่งเศสหลัก 3 เนื้อพันธุ์ (สีบลอนด์ d'AquitaineCharolais ลีมูแซ็งทาง) SNPs อ้างว่าฝา genotyping 18เปิดเผยว่า 16 SNPs มี polymorphic ภายในสายพันธุ์ทดสอบ SNPs ที่สองถูกเอาออกจากการวิเคราะห์เป็นหนึ่ง SNP ได้อัตราโทร genotyping ต่ำ ในขณะอีกSNP ไม่อยู่ในสมดุล Hardy – Weinberg การศึกษาระดับปริญญาการสังเกตสำหรับ SNPs 14 เหลือ heterozygosityแตกต่างกันระหว่างพันธุ์ กับ Charolais ถูกสายพันธุ์ด้วยความผันแปรทางพันธุกรรมสูงและสีบลอนด์ d'Aquitaine การต่ำสุด เชื่อมโยง disequilibrium และ haplotype โครงสร้างของDNAJA1 แตกต่างกันระหว่างพันธุ์ได้ แปดที่แตกต่างกันมี haplotypes รวมทั้งสามร่วมกัน โดยทุกสายพันธุ์ค้นพบ และสองถึงสามแท็ก SNPs (ขึ้นอยู่กับการสายพันธุ์) เพียงพอในการจับภาพความแปรปรวนทางพันธุกรรมทั้งหมดเห็นใน haplotypes เหล่านี้ ผลการศึกษานี้จะอำนวยความสะดวกในการออกแบบของความสัมพันธ์ที่ดีที่สุดในอนาคตของการศึกษาการประเมินบทบาทของยีน DNAJA1 ในความนุ่มเนื้อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความสัมพันธ์ระหว่างระดับการแสดงออกของ
ยีนวัว DNAJA1 และเนื้อนุ่มเมื่อเร็ว ๆ นี้
พบใน Charolais longissimus thoracis ตัวอย่างกล้ามเนื้อ
บอกว่ายีนนี้จะมีบทบาทสำคัญใน
เนื้อนุ่ม ที่นี่เรารายงานการตรวจสอบของความหลากหลาย
ภายในยีนวัว DNAJA1 และ haplotype
แปรปรวนและขอบเขตของการเชื่อมโยงสมดุลใน
หลักสามสายพันธุ์เนื้อฝรั่งเศส (สีบลอนด์ d'Aquitaine,
Charolais, ลีมู) genotyping 18 SNPs สมมุติ
เปิดเผยว่า 16 SNPs เป็น polymorphic ภายในสายพันธุ์
ทดสอบ สอง SNPs ถูกถอดออกจากการวิเคราะห์ต่อไปในฐานะ
หนึ่ง SNP มีอัตราค่าโทร genotyping ต่ำในขณะที่คนอื่น ๆ
SNP ไม่ได้อยู่ใน Hardy-Weinberg สมดุล การศึกษาระดับปริญญา
ของ heterozygosity สังเกตสำหรับส่วนที่เหลืออีก 14 SNPs
แตกต่างกันระหว่างสายพันธุ์กับ Charolais เป็นสายพันธุ์ที่มี
การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมสูงและสีบลอนด์ d'อากี
ต่ำสุด สมดุลการเชื่อมโยงและโครงสร้าง haplotype ของ
DNAJA1 แตกต่างกันระหว่างสายพันธุ์ สิบแปดที่แตกต่างกัน
พบ haplotype รวมทั้งสามร่วมกันโดยทุกสายพันธุ์ที่ถูก
ค้นพบและ 2-3 SNPs แท็ก (ขึ้นอยู่กับ
สายพันธุ์) มีเพียงพอที่จะจับภาพทุกความแปรปรวนทางพันธุกรรม
ที่เห็นใน haplotypes เหล่านี้ ผลการศึกษาครั้งนี้จะ
อำนวยความสะดวกในการออกแบบที่ดีที่สุดสมาคมการศึกษาอนาคต
การประเมินบทบาทของยีน DNAJA1 ในความอ่อนโยนเนื้อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความสัมพันธ์ระหว่างระดับของการแสดงออกวัว dnaja1 ยีนและเนื้อนุ่มเมื่อเร็ว ๆ นี้ที่พบในชาโค thoracis กล้ามเนื้อตัวอย่างแนะนำว่า ยีนนี้อาจมีบทบาทสำคัญในเนื้อนุ่ม . ที่นี่เรารายงานการตรวจสอบของความหลากหลายภายในยีน และพบ dnaja1 วัว ,ระยะเวลาและขอบเขตของการเชื่อมโยงการเก็บน้ำในหลักสามฝรั่งเศสเนื้อพันธุ์ ( d'aquitaine สีบลอนด์ชาลิมูซีน , ) เขต 18 snps การแสดงออกพบว่า มีจำนวน 16 snps ภายในพันธุ์ทดสอบ สอง snps ถูกถอดออกจากการวิเคราะห์เพิ่มเติม เช่นหนึ่ง SNP มีอัตราค่าโทรต่ำเขตในขณะที่อื่น ๆSNP ไม่ได้ใน Hardy Weinberg และสมดุล ระดับของเฉพาะที่เหลือ 14 snps )ที่แตกต่างกันระหว่างพันธุ์กับพันธุ์ชาร์โรเลส์อยู่ด้วยสูงสุดและความแปรปรวนทางพันธุกรรม d'aquitaine สีบลอนด์ถูกที่สุด การเก็บน้ำ และพบการเชื่อมโยงโครงสร้างdnaja1 แตกต่างระหว่างสายพันธุ์ อายุต่าง ๆแฮป รวมถึงสามที่ใช้ร่วมกันโดยทุกประเภท คือการค้นพบและสองถึงสาม snps แท็ก ( ขึ้นอยู่กับพันธุ์ ) มีเพียงพอที่จะจับทั้งหมดของพันธุกรรมเห็นในผลเหล่านี้ ผลการศึกษานี้จะช่วยในการออกแบบของสมาคมการศึกษาในอนาคตที่เหมาะสมการประเมินบทบาทของยีนความนุ่มเนื้อ dnaja1