The deoxyribonucleic acids (DNAs) o

The deoxyribonucleic acids (DNAs) of different sludge samples
were extracted using the Fast DNA SPIN Kit for Soil (MP
Biomedicals LLC., Califonia, USA). The primers 27F (5
0
-AGAGTTTGA
TCCTGGCTCAG-3
0
) and1522R (5
0
-AAGGAGGTGATCCAGCCAGCCGC
A-3
0
) were used for the amplification of bacterial 16S rRNA genes
(Fuller et al., 2003). The polymerase chain reaction (PCR) was per-formed in a final volume of 50 l L containing 5 l L of DNA buffer,
4 lL of deoxy-ribonucleoside triphosphate (dNTP), 0.5 l L of each
primer, 1lL of extracted DNA solutions, 0.5 lL Taq DNA polymerase
and 38.5 l L sterile water. The operations of amplification of bacte-rial 16S rRNA genes were as follows: 94 C for 2 min, 30 cycles of
94C for 1 min, annealing at 50 C for 1 min and extension at 72C
for 1.5 min and final extension at 72 C for 5 min. The PCR products
were purified with QIA quick PCR purification kit (Qiagen Company,
Hilden, Germany) and then cloned into PMD18-T vector (Takara
Biotechnology Co., Ltd., Dalian, China). 50 Positive clones were
sequenced (completed by Takara Biotechnology Co., Ltd., Dalian,
China), which were randomly chosen using a 3730XLDNAAnalyzer
(Applied Biosystems Company, USA) and all sequences were sub-mitted to the BLASTN (NCBI, USA) to obtain the closest relatives.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

กรด deoxyribonucleic (DNAs) ของตัวอย่างตะกอนแตกต่างกันถูกสกัดโดยใช้ชุดสปินดีเอ็นเอได้อย่างรวดเร็วในดิน (MPBiomedicals LLC. Califonia สหรัฐอเมริกา) ไพรเมอร์ที่ 27F (50-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-30) and1522R (50-AAGGAGGTGATCCAGCCAGCCGCA-30) ใช้สำหรับขยายของแบคทีเรีย 16S rRNA(Fuller et al., 2003) ปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรส (PCR) มีต่อมีรูปแบบปริมาณสุดท้าย 50 l L มี 5 l L ของดีเอ็นเอบัฟเฟอร์4 จะของ deoxy ribonucleoside โนซีนไตรฟอสเฟต (dNTP), 0.5 l L ของแต่ละรองพื้น 1lL แยกดีเอ็นเอโซลูชั่น 0.5 จะ Taq DNA พอลิเมอเรสและน้ำกอซ 38.5 l L มีการดำเนินการขยายยีน bacte ยล 16S rRNA ดัง: C 94 ในนาทีที่ 2, 30 รอบของC 94 1 นาที สำหรับการอบเหนียวที่ 50 C 1 นาทีและส่วนขยายที่ 72 Cสำหรับ 1.5 นาทีและสุดท้ายขยายที่ 72 C สำหรับ 5 นาที ผลิตภัณฑ์ PCRที่บริสุทธิ์ที่ มี QIA ด่วน PCR ฟอกชุด (บริษัท QiagenHilden เยอรมนี) และโคลนแล้ว เป็นเวกเตอร์ PMD18 T (Takaraเทคโนโลยีชีวภาพ Co., Ltd. ต้าเหลียน จีน) มีโคลน 50 บวกตามลำดับ (เสร็จสมบูรณ์ โดย Takara เทคโนโลยีชีวภาพ Co., Ltd. ต้าเหลียนจีน), ซึ่งถูกสุ่มเลือกใช้เป็น 3730XLDNAAnalyzer(บริษัท Biosystems ใช้ สหรัฐอเมริกา) และลำดับทั้งหมดถูกย่อย mitted เพื่อ BLASTN (NCBI สหรัฐอเมริกา) ได้รับญาติใกล้ชิด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

กรดดีเอ็นเอ (ดีเอ็นเอ)
ของกลุ่มตัวอย่างตะกอนที่แตกต่างกันถูกสกัดโดยใช้ดีเอ็นเอได้อย่างรวดเร็วSPIN ชุดดิน (MP
Biomedicals LLC. Califonia สหรัฐอเมริกา) ไพรเมอร์ 27 (ที่ 5
0
-AGAGTTTGA
TCCTGGCTCAG-3
0) and1522R (5 0 -AAGGAGGTGATCCAGCCAGCCGC A-3 0) ถูกนำมาใช้สำหรับการขยายของเชื้อแบคทีเรีย 16S rRNA ยีน (ฟุลเลอร์ et al., 2003) ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอร์ (PCR) เป็นต่อที่เกิดขึ้นในปริมาณสุดท้ายของ 50 ลิตร L ที่มี 5 ลิตรลิตรบัฟเฟอร์ดีเอ็นเอ4 LL ของ Deoxy-ribonucleoside triphosphate (dNTP), 0.5 ลิตรลิตรของแต่ละไพรเมอร์, 1LL ของสารสกัดโซลูชั่นดีเอ็นเอ 0.5 จะ Taq ดีเอ็นเอโพลิเมอร์และ38.5 ลิตรลิตรน้ำหมัน การดำเนินงานของการขยายของ 16S bacte-เรียลยีน rRNA มีดังนี้: 94 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 2 นาที 30 รอบ? 94 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 1 นาที, การอบที่ 50 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 1 นาทีและการขยายที่ 72 C เป็นเวลา 1.5 นาที ขยายสุดท้ายที่ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 5 นาที ผลิตภัณฑ์ PCR บริสุทธิ์กับ QIA รวดเร็วชุดฟอก PCR (Qiagen บริษัทฮิลเดน, เยอรมนี) และโคลนแล้วเป็นเวกเตอร์ PMD18-T (Takara เทคโนโลยีชีวภาพ จำกัด , ต้าเหลียน, จีน) 50 โคลนบวกได้รับการจัดลำดับ(เสร็จสมบูรณ์โดย Takara เทคโนโลยีชีวภาพ จำกัด , ต้าเหลียน, จีน) ซึ่งได้รับการสุ่มเลือกใช้ 3730XLDNAAnalyzer (Applied Biosystems บริษัท สหรัฐอเมริกา) และลำดับทั้งหมดถูกย่อย mitted การกล่าวหานี้ (NCBI สหรัฐอเมริกา) ที่จะได้รับญาติที่ใกล้เคียงที่สุด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

กรดดีออกซีไรโบนิวคลีอิก ( แถบ ) ของที่แตกต่างกันตัวอย่างตะกอน
ถูกสกัดโดยใช้ดีเอ็นเออย่างรวดเร็วหมุนชุดดิน ( MP
biomedicals LLC . แคลิฟอเนีย สหรัฐอเมริกา ) ไพรเมอร์ 27f ( 5
0
-
agagtttga tcctggctcag-3
0
) and1522r ( 5
0
-
aaggaggtgatccagccagccgc A-3
0
) ใช้สำหรับการเพิ่มปริมาณของแบคทีเรีย 16S rRNA ยีน
( ฟูลเลอร์ et al . , 2003 )ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอร์เรส ( พีซีอาร์ ) ถูกต่อขึ้นในเล่มสุดท้าย 50 L L L L ของบัฟเฟอร์ที่ประกอบด้วย 5 ดีเอ็นเอ ,
4 จะ ribonucleoside ดีอ ซี ไตรฟอสเฟต ( dntp ) , 0.5 ลิตรลิตรละ
1ll ดีเอ็นเอไพรเมอร์โซลูชั่นสกัด 0.5 จะแท็ค DNA polymerase และ 38.5 l l
ฆ่าเชื้อน้ำ การเพิ่มปริมาณยีน 16S rRNA bacte เรียลดังนี้ : 94  C 2 นาที 30 รอบ 
94 องศาเซลเซียสนาน 1 นาทีอบอ่อนที่อุณหภูมิ 50 องศาเซลเซียส นาน 1 นาที และ  ส่วนขยายที่ 72  C
1.5 นาทีและสุดท้ายส่วนขยายที่ 72  องศาเซลเซียสเป็นเวลา 5 นาที ผลิตภัณฑ์ PCR
เป็นบริสุทธิ์กับมั่นเร็ว PCR ฟอก Kit ( QIAGEN บริษัท
Hilden เยอรมนี ) และโคลนเข้าเวกเตอร์ pmd18-t ( Takara
เทคโนโลยีชีวภาพ Co . , ltd Dalian จีน ) 50 โคลนบวกเป็นลำดับ
( แล้วเสร็จโดย Takara เทคโนโลยีชีวภาพ Co . , Ltd . , Dalian ,
จีน )ซึ่งสุ่มเลือกใช้ 3730xldnaanalyzer
( Applied Biosystems บริษัท , USA ) และผ้าทอ / ลำดับ ถูกย่อยให้ blastn ( ncbi , USA ) รับญาติที่ใกล้ที่สุด