Abstract The diazotrophic communiti

Abstract The diazotrophic communities in a rice paddy
field were characterized by a molecular polyphasic
approach including DNA/RNA-DGGE fingerprinting,
real time RT-PCR analysis of nifH gene and the
measurement of nitrogen fixation activities. The investigation
was performed on a diurnal cycle and comparisons
were made between bulk and rhizosphere / root
soil as well as between fertilized / unfertilized soils.
Real time RT-PCR showed no significant difference in
the total quantity of nifH expression under the
conditions investigated. The functional diversity and
dynamics of the nifH gene expressing diazotroph
community investigated using RT-PCR-DGGE
revealed high diurnal variations, as well as variation
between different soil types. Most of the sequence
types recovered from the DGGE gels and clone
libraries clustered within nifH Cluster I and III

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทคัดย่อชุมชน diazotrophic ในนาข้าวฟิลด์มีลักษณะ polyphasic โมเลกุลวิธีการรวมถึงลายพิมพ์ดีเอ็นเออาร์เอ็นเอ-DGGEจริงเวลาวิเคราะห์ RT-PCR ของยีน nifH และประเมินกิจกรรมปฏิกิริยาการตรึงไนโตรเจน การสอบสวนทำตามวงจร diurnal และเปรียบเทียบเกิดขึ้นจำนวนมากและไรโซสเฟียร์ / รากดินเช่นระหว่างดินเนื้อปูนปฏิสนธิ / unfertilizedเวลาจริง RT-PCR พบว่าไม่แตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในปริมาณรวมของนิพจน์ nifH ภายใต้การตรวจสอบเงื่อนไข หลากหลายการทำงาน และของยีน nifH แสดง diazotrophชุมชนตรวจสอบการใช้ RT-PCR-DGGEเปิดเผยรูป diurnal สูง ตลอดจนการเปลี่ยนแปลงระหว่างดินต่างชนิดกัน ที่สุดของลำดับชนิดการกู้คืนจากเจ DGGE และโคลนไลบรารีที่ต้องจับกลุ่มภายใน nifH คลัสเตอร์ฉันและ III

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อชุมชน diazotrophic ข้าวเปลือกใน
สนามมีลักษณะ polyphasic โมเลกุล
ดีเอ็นเอรวมทั้งวิธีการ / พิมพ์ลายนิ้วมือ RNA-DGGE,
เรียลไทม์วิเคราะห์ RT-PCR ของยีน nifH และ
การวัดของกิจกรรมการตรึงไนโตรเจน การตรวจสอบ
ได้ดำเนินการในรอบรายวันและการเปรียบเทียบ
ที่ถูกสร้างขึ้นระหว่างกลุ่มและบริเวณราก / ราก
ดินรวมทั้งระหว่างปฏิสนธิ / unfertilized ดิน.
เวลาจริง RT-PCR พบว่าไม่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญใน
ปริมาณรวมของการแสดงออก nifH ภายใต้
เงื่อนไขการตรวจสอบ ความหลากหลายของการทำงานและ
การเปลี่ยนแปลงของยีน nifH แสดง diazotroph
ชุมชนการตรวจสอบโดยใช้ RT-PCR-DGGE
เปิดเผยรูปแบบรายวันสูงเช่นเดียวกับรูปแบบ
ระหว่างดินประเภทที่แตกต่างกัน ส่วนใหญ่ของลำดับ
ชนิดหายจากเจล DGGE และโคลน
ห้องสมุดคลัสเตอร์ภายใน nifH คลัสเตอร์ I และ III

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

บทคัดย่อ diazotrophic ชุมชนในนาข้าว ข้าวมีลักษณะเป็นโมเลกุล

polyphasic วิธีการรวมถึงดีเอ็นเอ / rna-dgge fingerprinting
เวลาจริงและการวิเคราะห์ยีนนี้ nifh
การวัดกิจกรรมการตรึงไนโตรเจน . การสอบสวน
คือใช้วงจรตามเวลาและเปรียบเทียบได้ระหว่างกลุ่มและราก

/ รากดิน รวมทั้งระหว่างไข่ / unfertilized ดิน
เวลาจริง RT-PCR พบว่าปริมาณรวมของการแสดงออกใน

nifh ภายใต้เงื่อนไขตรวจสอบ ความหลากหลายและพลวัตของการทำงาน
nifh ยีนแสดงเวสต์มินสเตอร์
ชุมชน ศึกษาโดยใช้ rt-pcr-dgge
เปิดเผยการปรุงอาหารมังสวิรัติสูง ตลอดจนการเปลี่ยนแปลง
ระหว่างดินประเภทต่าง ๆส่วนใหญ่ของประเภทลำดับ
หายจากการทดลองเจลและโคลน
ห้องสมุดเป็นกลุ่มภายใน nifh กลุ่มฉัน )