Sugarcane cultivars are polyploid,

Sugarcane cultivars are polyploid, aneuploid clones derived from interspecific hybridization between Saccharum officinarum and S. spontaneum. Their genome has recently started to be unravelled as a result of the development of molecular markers. We constructed an AFLP genetic map based on a selfing population of a specific cultivar, R570.Using 37 AFLP primer pairs, we detected 1,185 polymorphic markers of which 939 were simplex (segregated 3:1); these were used to construct the map. Of those 939, 887 were distributed on 120 cosegregation groups (CGs) based on linkages in coupling, while 52 remained unlinked. The cumulative length of all the groups was 5,849 cM, which is probably around one-third of the total genome length. Comparison with reference S. officinarum clones enabled us to assign 11 and 79 CGs to S. spontaneum and S. officinarum,respectively, whereas 11 CGs were probably derived from recombination between chromosomes of the two ancestral species. The patchy size of the groups, which ranges from 1 to 232 cM, illustrates the difficulty to access large portions of chromosomes, particularly those inherited from S. officinarum. Repulsion phase linkages suggested a high preferential pairing for 13 CG pairs. Out of the 120 CGs, 34 could be assigned to one of the 10 homo(eo)logy groups already defined in a previous RFLP map owing to the use of a small common marker set. The genome coverage was significantly increased in the map reported here. Implications for quantitative trait loci (QTL) research and marker-assisted breeding perspectives are discussed.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

อ้อยเป็น polyploid, aneuploid โคลนมา hybridization interspecific officinarum กำแพงแสนและ S. spontaneum กลุ่มของพวกเขาเพิ่งได้เริ่มเป็น unravelled จากการพัฒนาเครื่องหมายโมเลกุล เราสร้างแผนที่พันธุ AFLP ที่ตามประชากร selfing cultivar เฉพาะ R570 เราใช้คู่พื้น AFLP 37 พบ polymorphic การเครื่องหมาย 1,185 ที่ 939 ถูก simplex (แยก 3:1); เหล่านี้ถูกใช้เพื่อสร้างแผนที่ ของเหล่า 939, 887 ได้กระจาย 120 cosegregation กลุ่ม (CGs) ตามลิงค์ใน coupling ในขณะที่ 52 ยังคงไม่ได้เชื่อมโยง ซม 5,849 ซึ่งอาจจะประมาณหนึ่งในสามของความยาวรวมกลุ่ม จำนวนกลุ่มทั้งหมดที่สะสมได้ เปรียบเทียบกับข้อมูลอ้างอิง S. officinarum โคลนช่วยให้เราสามารถกำหนด 11 และ 79 CGs S. spontaneum และ S. officinarum ตามลำดับ ในขณะที่ 11 CGs ได้คงมาจาก recombination ระหว่าง chromosomes สองโบราณพันธุ์ ขนาดของกลุ่ม รำลึกซึ่งมีตั้งแต่ 1 ซม. 232 แสดงให้เห็นถึงความยากลำบากในการเข้าถึงส่วนใหญ่ของ chromosomes โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่สืบทอดมาจาก S. officinarum Repulsion ระยะลิงค์แนะนำสูงต้องการจับคู่สำหรับ 13 CG คู่ จาก 120 CGs, 34 สามารถกำหนด 10 ตุ๊ด (อีโอ) ฝ่ากลุ่มกำหนดไว้แล้วในแผนที่ RFLP ก่อนหน้าเนื่องจากการใช้เครื่องหมายขนาดเล็กทั่วไปชุดหนึ่ง กลุ่มความครอบคลุมมากขึ้นในแผนที่รายงานที่นี่ ผลวิจัยเชิงปริมาณติด loci (QTL) และมุมเครื่องช่วยผสมพันธุ์ได้กล่าวถึง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

พันธุ์อ้อยจะ polyploid โคลน aneuploid ที่ได้มาจากการผสมข้ามพันธุ์ระหว่าง interspecific Saccharum officinarum และ S. spontaneum จีโนมของพวกเขาได้เริ่มต้นเมื่อเร็ว ๆ นี้ที่จะหลุดเป็นผลมาจากการพัฒนาเครื่องหมายโมเลกุล เราสร้างแผนที่พันธุกรรม AFLP อยู่บนพื้นฐานของประชากร selfing ของพันธุ์เฉพาะ R570.Using 37 AFLP คู่ไพรเมอร์เราตรวจพบ 1,185 เครื่องหมาย polymorphic ที่ 939 ถูก simplex (แยก 3: 1); เหล่านี้ถูกนำมาใช้ในการสร้างแผนที่ ของผู้ที่ 939, 887 มีการกระจายในกลุ่ม 120 cosegregation (CGS) ตามความเชื่อมโยงในการมีเพศสัมพันธ์ในขณะที่ยังคงอยู่ 52 ยกเลิกการเชื่อมโยง ความยาวสะสมของทุกกลุ่มเป็น cM 5849 ซึ่งอาจเป็นรอบหนึ่งในสามของความยาวรวมจีโนม เมื่อเทียบกับการอ้างอิง S. officinarum โคลนช่วยให้เราสามารถกำหนดที่ 11 และ 79 CGS เอส spontaneum และ S. officinarum ตามลำดับในขณะที่ 11 CGS อาจได้มาจากการรวมตัวกันระหว่างโครโมโซมของทั้งสองสายพันธุ์บรรพบุรุษ ขนาดหย่อมของกลุ่มซึ่งช่วง 1-232 cM แสดงให้เห็นถึงความยากลำบากในการเข้าถึงส่วนใหญ่ของโครโมโซมโดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่สืบเชื้อสายมาจากเอส officinarum เชื่อมโยงขั้นตอนการเขม่นแนะนำการจับคู่พิเศษสูงสำหรับ 13 คู่ CG ออกจาก 120 CGS, 34 จะได้รับมอบหมายให้เป็นหนึ่งใน 10 ตุ๊ด (eo) กลุ่มเฉื่อยชากำหนดไว้แล้วในแผนที่ RFLP ก่อนหน้าเนื่องจากการใช้งานของชุดเครื่องหมายขนาดเล็กที่พบบ่อย จีโนมความคุ้มครองที่เพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญในแผนที่ที่มีการรายงานที่นี่ ผลกระทบต่อตำแหน่งลักษณะเชิงปริมาณ (QTL) การวิจัยและเครื่องหมายช่วยมุมมองการปรับปรุงพันธุ์ที่จะกล่าวถึง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

พันธุ์อ้อยอยู่ในส aneuploid , โคลนมาจาก interspecific ลูกผสมระหว่างอ้อยและ spontaneum . จีโนมของพวกเขาเพิ่งจะเริ่ม unravelled เป็นผลของการพัฒนาโมเลกุลเครื่องหมาย เราสร้างแผนที่พันธุกรรม AFLP ตามประชากรผสมพันธุ์ โดยเฉพาะ r570 โดยใช้ไพรเมอร์คู่ 37 เอเอฟ เราตรวจพบ 1185 จำนวนเครื่องหมายที่ 939 ก็เริม ( แยก 3 ) ; เหล่านี้ถูกใช้ในการสร้างแผนที่ ที่กระจายอยู่ในโทรศัพท์ 887 , 120 cosegregation กลุ่ม ( CGS ) บนพื้นฐานของการเชื่อมโยงในการมีเพศสัมพันธ์ในขณะที่ 52 ยังคงเชื่อมกันแล้ว ความยาวรวมของทุกกลุ่ม คือ 5849 เซนติเมตร ซึ่งอาจจะประมาณหนึ่งในสามของความยาวโดยรวม เปรียบเทียบกับการอ้างอิง .โคลนดำช่วยให้เราสามารถกำหนด 11 79 CGS เอส spontaneum และ ดำ ตามลำดับ ในขณะที่ 11 CGS อาจจะได้มาจากการรวมตัวระหว่างโครโมโซมของบรรพบุรุษสองชนิด ขนาดหย่อมของกลุ่ม ซึ่งช่วงจาก 1 ถึง 232 เซนติเมตร แสดงให้เห็นถึงความยากในการเข้าถึงส่วนใหญ่ของโครโมโซม โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่สืบทอดจาก S . ดำ .แรงผลักระยะการเชื่อมโยงแนะนำสูงพิเศษจับคู่ 13 คู่ CG . ออกจาก 120 CGS 34 อาจได้รับมอบหมายให้เป็นหนึ่งใน 10 โฮโมโลจี้ ( EO ) กลุ่มที่กำหนดไว้แล้วในหน้า : แผนที่เนื่องจากใช้ชุดเครื่องหมายทั่วไปขนาดเล็ก โดยความคุ้มครองเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญในแผนที่รายงานที่นี่สำหรับรูปแบบเชิงคุณลักษณะ ( QTL ) และมุมมองการวิจัยดีเอ็นเอเครื่องหมายช่วยผสมพันธุ์ได้ถูก