นามธรรม
การย้อมสีแกรมบวกค็อกคัสกำหนด cc-spl15-2t ถูกแยกออกจากบริเวณรากของ Sesuvium portulacastrum โดยการวิเคราะห์ 16s rRNA ลำดับยีนมันก็แสดงให้เห็นว่าความเครียด cc-spl15-2t เป็น salinicoccus ประเภท แยกเป็นที่เกี่ยวข้องมากที่สุดอย่างใกล้ชิดกับ salinicoccus hispanicus dsm 5352t (ลำดับยีน 16s 98.3% rrna ความคล้ายคลึงกัน) และ salinicoccus roseus dsm 5351t (967%); ลักษณะคล้ายคลึงกับสมาชิกคนอื่น ๆ ของ salinicoccus ชนิดมี <96.5% ให้สอดคล้องกับลักษณะของ salinicoccus ประเภทระบบ quinone ประกอบด้วยส่วนใหญ่ของ menaquinone mk-6 ระดับไขมันขั้วโลกแสดง diphosphatidylglycerol ส่วนประกอบสำคัญ phosphatidylglycerol และ glycolipid ไม่ปรากฏชื่อ ในรูปแบบพอลิเอ,สเปอร์มิเป็นสารประกอบเด่น กรดไขมันที่มี anteiso-c15: 0, iso-c15: 0, iso-c16: 0 และ anteiso-c17: 0 ซึ่งได้รับการสนับสนุนความร่วมมือของสายพันธุ์ cc-spl15-2t เพื่อ salinicoccus ประเภท สัมพันธ์ dna-dna ระหว่างสายพันธุ์ cc-spl15-2t และ s 43288t ccug hispanicus 42 และ 32% (การวิเคราะห์ซึ่งกันและกัน)จากข้อมูลเหล่านี้รวมทั้งจากการทดสอบทางสรีรวิทยาและชีวเคมี, ความแตกต่างที่ชัดเจนของสายพันธุ์ cc-spl15-2t จาก s hispanicus และสมาชิกคนอื่น ๆ ของ salinicoccus ประเภทเป็นไปได้ที่ เราเสนอว่าความเครียด cc-spl15-2t ได้รับมอบหมายให้เป็นสายพันธุ์ใหม่ที่มีชื่อ salinicoccus sesuvii เอสพี พฤศจิกายน สายพันธุ์ชนิดเป็น cc-spl15-2t (= dsm 23267t = CCM 7756t).
ส่วนก่อนหน้านี้ส่วนถัดไป
genbank / EMBL / ddbj จำนวนภาคยานุวัติสำหรับลำดับ 16s rRNA ยีนของสายพันธุ์ cc-spl15-2t เป็น fr669114.
รูปเสริมที่สามารถใช้ได้กับรุ่นออนไลน์ของบทความนี้.
Ventosa ตอัล (1990) เสนอ salinicoccus ประเภทจะมีการย้อมสีแกรมบวก catalase และ oxidase บวก, ไม่ใช่เคลื่อนที่, ที่ไม่ใช่ฮิสปอร์ขึ้นรูป Cocci,ด้วย mk-6 เป็น quinone หายใจเด่นและผนังเซลล์ที่มี peptidoglycan ประเภท L-ลิซ-gly5 ในขณะที่เขียน, ประเภทประกอบด้วย 12 ชนิดที่มีชื่อที่เผยแพร่สั่งจ่าย: s roseus และ s hispanicus (Ventosa และคณะ. 1990, 1992), s alkaliphilus (zhang, et al., 2002), s salsiraiae (ฝรั่งเศสและคณะ. 2006), s jeotgali (aslam และคณะ. 2007), s luteus (zhang, et al., 2007), ssiamensis (pakdeeto และคณะ. 2007), s kunmingensis (chen และคณะ. 2007), s iranensis (amoozegar และคณะ. 2008), s อัลบัส (chen และคณะ. 2009), s carnicancri (jung, et al., 2010) และ s halodurans (วังและคณะ. 2008) 's salitudinis 'ยังได้รับการเสนอโดย chen ตอัล (2008).
สายพันธุ์ cc-spl15-2t ถูกแยกออกจากบริเวณรากของ Sesuvium portulacastrum (purslane น้ำทะเล) ในบู,Chiayi County, ไต้หวันบนอาหารวุ้น (oxoid) ที่ 28 องศาเซลเซียส แยกไว้บนวุ้น tryptone ถั่วเหลืองที่ 28 องศาเซลเซียส การย้อมสีกรัมและสัณฐานวิทยาของเซลล์ที่ถูกตั้งข้อสังเกตโดยเฟสตรงกันข้ามกล้องจุลทรรศน์ตามที่อธิบายไว้โดยนักรบ& kroppenstedt (2004) การย้อมสีกรัมนอกจากนี้ยังได้รับการตรวจสอบโดยการทดสอบเกาะ (moaledj, 1986).
ยีน 16s rRNA วิเคราะห์ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (นักรบตอัล., 2003)จัดเรียงลำดับหลายและการวิเคราะห์ที่ถูกดำเนินการโดยใช้ล้าน 4 รุ่น (ทามูระและคณะ. 2007) ระยะทางพันธุกรรมที่ถูกคำนวณโดยใช้ตัวเลือกระยะทางที่เป็นไปตามรูปแบบที่คิมูระสองพารามิเตอร์และการจัดกลุ่มโดยใช้เพื่อนบ้านเข้าร่วมและความประหยัดสูงสุดได้ดำเนินการโดยใช้ค่าบูตตาม 1000 ซ้ำ16s rRNA ลำดับยีนของสายพันธุ์ cc-spl15-2t เป็นยืดอย่างต่อเนื่องของ 1487 bp ลำดับความคล้ายคลึงกันชี้ให้เห็นว่าเป็นญาติสนิทของสายพันธุ์ cc-spl15-2t มี s hispanicus dsm 5352t (ลำดับยีน 16s 98.3% rrna ความคล้ายคลึงกัน) และ s roseus dsm 5351t (96.7%) ลักษณะคล้ายคลึงกับสมาชิกคนอื่น ๆ ของ salinicoccus ชนิดมี <96.5%ในการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการเพื่อนบ้านเข้า (รูปที่ 1) สายพันธุ์ cc-spl15-2t เกิดเชื้อสายแยกต่างหากใน salinicoccus ประเภทและกลุ่มที่มี s hispanicus dsm 5352t.
มะเดื่อ . 1
ดูรุ่นใหญ่:
ในหน้านี้ในหน้าต่างใหม่
ดาวน์โหลดเป็นภาพนิ่ง
มะเดื่อ 1.
เพื่อนบ้านเข้าสู่การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการขึ้นอยู่กับ 16s rRNA ลำดับยีนแสดงตำแหน่งของสายพันธุ์ cc-spl15-2t ใน salinicoccus ประเภท ค่าบูต (> 50%) ตาม 1000 ซ้ำมีการแสดงที่โหนดสาขา บาร์แทน 0.01 ต่อตำแหน่งเบื่อหน่าย.
สำหรับการวิเคราะห์ของผนังเซลล์กรดวินิจฉัย diamino, โพลีเอไม, Quinones และไขมันขั้วเซลล์ที่ถูกปลูกในกลางพายเสริมด้วยเกลือทะเล [0.3% เปปโตนจากเคซีน, 0สารสกัดจากยีสต์ 3%, 3.1% เกลือทะเล (s9883; ซิก)] กรด diamino ผนังเซลล์วินิจฉัยการสกัดและวิเคราะห์ตามที่อธิบาย Schleifer (1985) โพลีเอไมสกัดตามบุ& auling (1988) จากชีวมวลเก็บเกี่ยวประมาณ 70% สูงสุด OD 600 ขณะที่รายงานจาก Altenburger ตอัล (1997)ไขมันขั้วโลกและ Quinones ถูกสกัดและวิเคราะห์ตามที่อธิบายไว้ (TINDALL, ปี 1990, b;. Altenburger ตอัล, 1996) การวิเคราะห์ของ hplc Quinones และโพลีเอไมได้รับการดำเนินการโดยใช้เครื่องมือที่อธิบายโดย Stolz ตอัล (2007).
กรด diamino ผนังเซลล์การวินิจฉัยที่ถูกระบุว่าเป็นไลซีนซึ่งเป็นไปตามคำอธิบายของ salinicoccus ประเภท (Ventosa et al,.1990) รูปแบบของพอลิเอความเครียด cc-spl15-2t ประกอบด้วย [(g น้ำหนักแห้ง) -1] 2.2 ไมโครโมสเปอร์มิ, 0.1 ไมโครโมล spermine และ 0.2 ไมโครโมล putrescine ที่ดีที่สุดของความรู้ของเราจนถึงขณะนี้ไม่มีรูปแบบพอลิเอที่ได้รับรายงานของสมาชิกของ salinicoccus ประเภทใด แต่พืชและสัตว์ได้รับมอบหมายให้ bacillales การสั่งซื้อและสมาชิกของจำพวกตัวแทนอื่น ๆ ของคำสั่งนี้เช่นบาซิลลัส,Paenibacillus alicyclobacillus และ ureibacillus เสมอสเปอร์มิแสดงเป็นสารประกอบที่สำคัญในรูปแบบพอลิเอ (Hamana et al, 1989;.. hosoya et al, 2004) ดังนั้นจำนวนเงินที่สูงของสเปอร์มิในเซลล์จะเห็นได้ชัดลักษณะทั่วไปของผู้แทนของ bacillales ลำดับ.
ระบบ quinone ของสายพันธุ์ cc-spl15-2t ประกอบด้วย menaquinones มีจำนวนมาก mk-6 (998%) และร่องรอยของ mk-7 (0.2%) ระดับไขมันขั้วของสายพันธุ์ cc-spl15-2t ประกอบด้วยจำนวนเงินที่สำคัญของ diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol และจำนวน glycolipid และรายย่อยที่ไม่ปรากฏชื่อของทั้งสองไขมันไม่ปรากฏชื่อไม่ stainable ด้วย ninhydrin โมลิบดีนัมสีฟ้าหรือα-แนฟทอ (มะเดื่อเสริม. s1 ที่มีอยู่ใน ijsem ออนไลน์)ระบบ quinone และระดับไขมันขั้วโลกอยู่ในข้อตกลงที่ดีกับผู้ที่รายงานสำหรับสมาชิกอื่น ๆ ของ salinicoccus ชนิด แต่ทั้งสองไขมันที่ไม่ได้ระบุยังไม่ได้รับรายงานก่อนหน้านี้ ที่เกี่ยวข้องกับการ diphosphatidylglycerol และ phosphatidylglycerol,glycolipid ไม่ปรากฏชื่อของสายพันธุ์ cc-spl15-2t แสดงให้เห็นว่าพฤติกรรมเช่นเดียวกับโคร glycolipid ไม่ปรากฏชื่อที่ตรวจพบโดย Ventosa ตอัล (1992, 1993) ในสายพันธุ์ดังกล่าวข้างต้นของ s hispanicus และ s roseus แต่เป็นสารที่ไม่ชอบน้ำสูงสามารถมองเห็นได้ในรูปของไขมันขั้วของสายพันธุ์ชนิดของ s hispanicus และความเครียดของ s roseus (Ventosa และคณะ. 19921993) ซึ่งอาจจะตรงกับสายพันธุ์ของ l1 cc-spl15-2t เพราะพฤติกรรมโครที่มีความคล้ายคลึง. การวิเคราะห์
กรดไขมันได้ดำเนินการตามที่นักรบ& kroppenstedt (1996) องค์ประกอบของกรดไขมันสายพันธุ์ cc-spl15-2t ก็คล้ายกับที่สมาชิกของ salinicoccus ชนิดและส่วนใหญ่คล้ายกับองค์ประกอบของกรดไขมัน s 43288t ccug hispanicus,แต่ความแตกต่างของปริมาณบางอย่างที่ถูกตั้งข้อสังเกต (ตารางที่ 1) กรดไขมันลักษณะ anteiso-c15: 0, iso-c16: 0 และ anteiso-c17: 0 ถูกตรวจพบในสายพันธุ์ cc-spl15-2t
มุมมองตารางนี้.
ในหน้าต่างนี้ในหน้าต่างใหม่ตารางที่ 1
องค์ประกอบของกรดไขมันสายพันธุ์ cc-spl15-2t และเพื่อนบ้านใกล้เคียงที่สุดของสายวิวัฒนาการในประเภท salinicoccus
สายพันธุ์: 1, s sesuvii cc-spl15-2t 2, s43288t ccug hispanicus ข้อมูลที่ถูกนำมาจากการศึกษาครั้งนี้ใช้ฐานข้อมูล tsba40 ในระบบโพลี ECL ความยาวโซ่เทียบเท่า -. (. นักรบตอัล, 1991), ไม่พบ
ผลของลักษณะทางสรีรวิทยาเปรียบเทียบโดยใช้เงื่อนไขการทดสอบเกือบจะเหมือนกันสำหรับสายพันธุ์ cc-spl15-2t และสมาชิกของ salinicoccus ประเภทจะได้รับในตารางที่ 2 และคำอธิบายชนิด .พันธุ์ dna-dna ระหว่างสายพันธุ์ cc-spl15-2t และ s 43288t ccug hispanicus ทำตามวิธีการของ ziemke ตอัล . (1998) และพบว่า 42 และ 32% (การวิเคราะห์ซึ่งกันและกัน) dna-dna สัมพันธ์
ดูตารางนี้:
ในหน้าต่างนี้ในหน้าต่างใหม่ตารางที่ 2
ความแตกต่างของลักษณะของสายพันธุ์ cc-spl15-2t และสมาชิกของพืชและสัตว์สายพันธุ์ salinicoccus
: 1, salinicoccus sesuvii เอสพี พฤศจิกายนcc-spl15-2t 2, s อัลบัสยิ้ม-y21t (chen et al, 2009.) 3, s kunmingensis ยิ้ม y15t (chen et al, 2007.) 4, s alkaliphilus t8t (zhang et al, 2002.) 5, s roseus dsm 5351t (. Ventosa et al, 1990); 6, s hispanicus dsm 5352t (Marquez et al, 1990;. Ventosa et al, 1992.) 7 s jeotgali s2r53-5t (. aslam et al, 2007); 8 s salsiraiae rh1t (ฝรั่งเศส et al, 2006.) 9 ssiamensis pn1-2t (. pakdeeto et al, 2007); 10 s luteus ยิ้ม 70202t (zhang et al, 2007.) 11 s qw6t iranensis (amoozegar และคณะ. 2008) ทุกสายพันธุ์มี mk-6 เป็น quinone เด่นทางเดินหายใจ o ส้ม; op, ส้มสีชมพู, p สีชมพู; PR, สีชมพูสีแดง ro, สีส้มสีแดง; W, สีขาว y, สีเหลือง, บวก tr ร่องรอย; - ลบครั้งที่ไม่มีข้อมูลที่มีอยู่
ข้อมูลของเราแสดงให้เห็นว่าความเครียด cc-spl15-2t แสดงลักษณะที่เป็นปกติของ salinicoccus ประเภท: ยกตัวอย่างเช่นไลซีนกรด diamino วินิจฉัยระบบ quinone ประกอบด้วย menaquinone เด่น mk-6 และระดับไขมันขั้วโลกประกอบด้วย diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol และ glycolipid ไม่ปรากฏชื่อ แยกที่อาจจะแตกต่างไปจากที่ใกล้ชิดญาติของตน43288t ccug และสมาชิกคนอื่น ๆ ของ salinicoccus ประเภทโดยลักษณะทางสรีรวิทยา dna-dna สัมพันธ์และความแตกต่างใน 16s rRNA ลำดับยีน hispanicus เราเสนอว่าความเครียด cc-spl15-2t เป็นตัวแทนของสายพันธุ์ใหม่ที่มีชื่อ salinicoccus sesuvii เอสพี พฤศจิกายน
แล้วส่วนต่อไปส่วนรายละเอียดของการ
salinicoccus sesuvii เอสพี พฤศจิกายน
salinicoccus sesuvii [se.su 'vi.i. n.l. เก็นn sesuvii ของ Sesuvium แยก
การแปล กรุณารอสักครู่..
![](//thimg.ilovetranslation.com/pic/loading_3.gif?v=b9814dd30c1d7c59_8619)