DNA extraction was performed on 48

DNA extraction was performed on 48 hours blood agar culture
using MagMAXTM Total Nucleic Acid Isolation Kit (Ambion, Life
Tecnologies) and the MICROLAB STARLET automatic extractor
(Hamilton Robotics). All isolates included in this study were
screened by PCRs for the toxin genes tcdA,tcdB, the binary toxin
genes cdtA and cdtB and the tcdC regulatory gene deletions as
previously described (Stubbs et al., 2000; Lemee et al., 2004;
Antikainen et al., 2009). Toxinotyping and PCR-ribotyping were
performed according to the protocol described by Rupnik et al.
(1998) and Bidet et al. (1999) respectively. For PCR-ribotyping, DNA
fingerprint patterns were compared to those of the predominant
PCR-ribotypes circulating in Europe (the collection was kindly
provided by the European Centre for Disease Prevention and
Control-ECDC). Strains with a pattern different from the reference
strain collection were tested by capillary gel electrophoresis–based
PCR-ribotyping and the resulting patterns were classified according
to the WEBRIBO-database (

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สกัดดีเอ็นเอที่ได้ดำเนินการเกี่ยวกับวัฒนธรรม 48 ชั่วโมงวุ้นเลือด
ใช้ MagMAXTM รวมนิวคลีอิกกรดแยก Kit (Ambion ชีวิต
Tecnologies) และ Microlab STARLET ระบายอัตโนมัติ
(แฮมิลตันหุ่นยนต์) ทั้งหมดที่แยกได้รวมอยู่ในการศึกษาครั้งนี้ได้รับ
การคัดเลือกจาก PCRs ยีนพิษ tcdA, tcdB ไบนารีพิษ
ยีน cdtA และ cdtB และ TCDC ลบยีนกฎระเบียบเป็น
อธิบายไว้ก่อนหน้า (สตับส์ et al, 2000;. Lemee et al, 2004;.
Antikainen et al., 2009) Toxinotyping และ PCR-ribotyping ถูก
ดำเนินการตามโปรโตคอลอธิบายโดย Rupnik et al.
(1998) และโถสุขภัณฑ์, et al (1999) ตามลำดับ สำหรับ PCR-ribotyping ดีเอ็นเอ
รูปแบบลายนิ้วมือที่ถูกนำมาเปรียบเทียบกับของเด่น
PCR-ribotypes หมุนเวียนในยุโรป (คอลเลกชันที่ถูกกรุณา
ให้โดยศูนย์ยุโรปเพื่อการป้องกันโรคและการ
ควบคุม ECDC) สายพันธุ์ที่มีรูปแบบที่แตกต่างจากการอ้างอิง
การเก็บรวบรวมสายพันธุ์ที่ได้รับการทดสอบจากเส้นเลือดฝอยข่าวคราวตาม
PCR-ribotyping และรูปแบบที่เกิดขึ้นได้รับการจำแนกตาม
ไป WEBRIBO ฐานข้อมูล (

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การสกัดดีเอ็นเอคือใช้วัฒนธรรมวุ้นเลือด 48 ชั่วโมงการใช้ magmaxtm รวมกรดนิวคลีอิกแยกชุด ( ambion ชีวิตtecnologies ) และ microlab ผู้มาใหม่ดึงอัตโนมัติ( แฮมิลตันหุ่นยนต์ ) ทั้งหมดรวมอยู่ในการศึกษา คือ ไอโซเลทการคัดกรองโดย pcrs สำหรับยีน tcda tcdb สารพิษ , สารพิษ , ไบนารีและยีน cdta cdtb และ TCDC กฎระเบียบยีนลบเป็นอธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ( สตับส์ et al . , 2000 ; lemee et al . , 2004 ;antikainen et al . , 2009 ) toxinotyping และ PCR ribotyping คือดำเนินการตามขั้นตอนที่ระบุไว้ โดย rupnik et al .( 1998 ) และอ่าง et al . ( 1999 ) ตามลำดับ สำหรับ ribotyping ตรวจ ดีเอ็นเอแบบแผนลายนิ้วมือเปรียบเทียบกับของโดดPCR ribotypes หมุนเวียนในยุโรป ( คอลเลกชันคือกรุณาโดยศูนย์ยุโรปเพื่อป้องกันโรคและecdc ควบคุม ) สายพันธุ์ที่มีรูปแบบแตกต่างจากข้อมูลอ้างอิงการเก็บรวบรวมสายพันธุ์ทดสอบโดย capillary gel electrophoresis ) ตามribotyping PCR และผลจำแนกตามรูปแบบการ webribo ฐานข้อมูล